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特殊な指数表記を含むcsvファイルの読み込み

daily_999

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投稿2023/03/09 08:12

実現したいこと

特殊な指数表記を含むcsvファイルをNumpy loadtxtで読込みたい

前提

当方が扱っている解析系プログラムのインプットファイルでは、節点座標値が指数表記の場合以下の右側のように記載するルールとなっています。
2.342E-12 → 2.342-12
なお、インプットファイルには指数と小数点表記が混在しています。

発生している問題・エラーメッセージ

インプットファイルの節点座標値をcsv形式に変換し、Numpyライブラリのloadtxtで配列Nodeに読み込ませたいのですが、上記指数表記が邪魔をしているようで成功しません。

ValueError: could not convert string '2.342-12' to float64 at row 226, column 3.

該当のソースコード

Python

1import numpy as np 2Node = np.loadtxt('test.csv',dtype='float',delimiter=',',encoding="utf-8_sig")

試したこと

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Python3, Numpyを使っています。
ご教示いただけますと幸いです。宜しくお願い致します。

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ベストアンサー

test.csv

csv

12.342-12,123.456+6

python

1import re 2import numpy as np 3 4Node = np.loadtxt('test.csv',dtype='float',delimiter=',',encoding="utf-8_sig", 5 converters=lambda i: re.sub(r'(?<=\d)([+-])', r'E\1', i)) 6 7print(Node) 8 9# [2.34200e-12 1.23456e+08]

投稿2023/03/09 08:30

melian

総合スコア19881

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daily_999

2023/03/09 10:26

ご回答ありがとうございます。参考にさせていただきます。
daily_999

2023/03/09 11:25

(?<=\d) この正規表現について、いろいろ検索したのですが<=がわからず、お手数ですがご教示いただけないでしょうか。
daily_999

2023/03/09 11:56

ありがとうございました。よく理解できました。
guest

0

test.csvを読んで、普通の表記にして、別ファイルに書き込むという前処理をすれば良いかと思います。
お書きのことだけであれば、単に-E-に置換する。

-12-3のような数値もあるなら正規表現で。

投稿2023/03/09 08:28

otn

総合スコア84830

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daily_999

2023/03/09 10:26

ご回答ありがとうございます。参考にさせていただきます。
guest

0

まずはstrで読込んで、各要素に対して正規表現でEを付加してfloatに変換すればよいかと思います。

Python

1import numpy as np 2from io import StringIO 3import re 4 5def conv(v): 6 v = re.sub(r'(\d)-(\d)', r'\1E-\2', v) 7 return float(v) 8f = np.vectorize(conv) 9 10Node = np.loadtxt(StringIO('1,1.2,-1,2.342-12,2'), dtype=str, delimiter=',') 11Node = f(Node) 12print(Node) # [ 1.000e+00 1.200e+00 -1.000e+00 2.342e-12 2.000e+00]

投稿2023/03/09 08:25

can110

総合スコア38280

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daily_999

2023/03/09 10:26

ご回答ありがとうございます。参考にさせていただきます。
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