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GPU上の学習速度が(仮想メモリの爆発的増加に伴い)急激に低下する問題について

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dad

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GPU(Ubuntu)を用いてディープラーニングを試しています。

直面している問題は、そのスピードについてです。

5万ステップくらいの学習を行うつもりなのですが、最初の500ステップくらいを超えたあたりから、急激にスピードが落ちてしまいます。1秒に3,4ステップだったものが、1秒1ステップくらいになってしまいます。

どのようなことが原因だと思われますか?

申し訳ないのですが、プログラムや環境については、記載できないです。
あくまで、推測で考えられる原因を教えてください。

追記
プログラム内に適宜、現在の時刻を示しつつ、topコマンドでメモリを確認してみました。
すると、仮想メモリが物理メモリの2倍くらい(物理メモリ16GB)になっていました。
2倍なったタイミングの時刻から、原因を探ってみると、VGG16()にたどり着きました。 懸念されることとして、VGG16のh5ファイルをGPU上でタイムアウトしてダウンロードできなかったため、別のPC(CPU)上でダウンロードしたものを使っていることがあります。 これは関係しているでしょうか?タイムアウトしないようにするには、どうすればよいでしょうか?

さらに追記

GoogleColaboratoryにて同じプログラムを動かし、topコマンドにてメモリを監視しました。
すると、同じように仮想メモリが35gなどとなっていました。
実行後、ほんの数秒で一気に大きくなる感じでした。

どこに問題があるのか、探りたいのですが、どうすればよいのかわかりません。
仮想メモリが爆発的に増える原因を見つけるために、できることには何がありますか?

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  • GPUのサーマルプロテクションが作動した
  • (ファイルから動的にデータを読み込みながら走らせているなら)ストレージのサーマルプロテクションが作動した

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  • 2018/07/24 20:41

    googlecolaboratoryに変えましたが。問題が発生しています。何がいけないのか、いつ問題が生じるのかを調べるにはどうすればよいのでしょうか?

    キャンセル

  • 2018/07/25 09:48

    メモリ消費が劇的に増大したときにどんな処理が行われているのか特定してください
    あちこちにprint入れて、メモリ消費とどこまで処理が進んでいるか表示させてみるとか

    キャンセル

+3

  • メモリをリークさせながらやっていない限りswapはないと願いたいです。
    top/htopで監視してみてはいかがですか?
  • Jupyterとかなら表示を出しすぎると、画面でメモリ食いすぎて死んだりします。
  • 熱がこもって速度がガタ落ちするのはよくあることです。
    nvidia-smiで温度を監視したり、上限を設定してみてください。
  • まさかそんなトリッキーなことをやっていないと思いますが、バッチサイズを下げならが学習していると、遅くなっていきます。
    http://forums.fast.ai/t/change-batch-size-during-training/7947/20
  • 損失関数などはどう変化していますか?
    nanになってたりするとオーバーフローが起きたか、なにかよからぬことがあったのかもしれません。
  • 何もかけないのでは仕方ないのですが、環境を専有していますか?
    他のプロセス走っていませんか?
    仮想環境ならありえますし、Symantecが発動してディスクIOを100%にしてしまうこともあります。

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  • 2018/07/24 20:41

    topで問題を確認し、googlecolaboratoryに変えました。しかし、相変わらず問題が発生しています。何がいけないのか、いつ問題が生じるのかを調べるにはどうすればよいのでしょうか?

    キャンセル

  • 2018/07/24 21:19

    コールバック関数を何か使っていますか?

    キャンセル

  • 2018/07/24 22:00

    コールバック関数は使っていません

    キャンセル

  • 2018/07/24 23:08

    https://github.com/keras-team/keras/issues/8668
    マルチプロセスはどうでしょう。

    キャンセル

  • 2018/07/25 09:40

    使ってないです

    キャンセル

0

I think, callbacks issue,
or may be memory leakage 

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  • 2018/07/24 20:39

    どうすればどのタイミングでメモリリークしているのかを確認できますか?

    キャンセル

  • 2018/07/26 16:20

    https://www.bountysource.com/issues/32318080-memory-leak-when-using-tensorflow

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