Flask-SQLAlchemyでDBを作成しWebアプリケーションを正常にデプロイしたい。

Question

実現したいこと

Flask-SQLAlchemyでDBを作成しWebアプリケーションを正常にデプロイしたい。

前提

FlaskにてWebアプリケーションを開発し完成しました。
VPS（Ubuntu 22.04）を契約し、以下のような環境を構築しました。
・nginx
・uwsgi
・Flask等必要なモジュールのインストール

Webブラウザからトップページを表示させることは出来ましたが、
DB関連の表示がされません。
ローカルで作ったDBをそのままVPS側に移動させても使用出来なさそうなので、
新たにVPS側でデータベースの作成作業を行いましたがうまくいきません。
DBを作成する方法をご教授頂けましたら幸いです。

下記はvenv環境でapp.pyと同じ階層で対話モードにて実行しています。

from app import app
form model import db
with app.app_context():
   db.create_all()

Traceback (most recent call last):
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 145, in __init__
    self._dbapi_connection = engine.raw_connection()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 3288, in raw_connection
    return self.pool.connect()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 452, in connect
    return _ConnectionFairy._checkout(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 1268, in _checkout
    fairy = _ConnectionRecord.checkout(pool)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 716, in checkout
    rec = pool._do_get()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/impl.py", line 168, in _do_get
    with util.safe_reraise():
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/util/langhelpers.py", line 147, in __exit__
    raise exc_value.with_traceback(exc_tb)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/impl.py", line 166, in _do_get
    return self._create_connection()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 393, in _create_connection
    return _ConnectionRecord(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 678, in __init__
    self.__connect()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 902, in __connect
    with util.safe_reraise():
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/util/langhelpers.py", line 147, in __exit__
    raise exc_value.with_traceback(exc_tb)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 898, in __connect
    self.dbapi_connection = connection = pool._invoke_creator(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/create.py", line 637, in connect
    return dialect.connect(*cargs, **cparams)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/default.py", line 616, in connect
    return self.loaded_dbapi.connect(*cargs, **cparams)
sqlite3.OperationalError: unable to open database file

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 2, in <module>
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/flask_sqlalchemy/extension.py", line 884, in create_all
    self._call_for_binds(bind_key, "create_all")
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/flask_sqlalchemy/extension.py", line 865, in _call_for_binds
    getattr(metadata, op_name)(bind=engine)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/sql/schema.py", line 5796, in create_all
    bind._run_ddl_visitor(
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 3238, in _run_ddl_visitor
    with self.begin() as conn:
  File "/usr/lib/python3.10/contextlib.py", line 135, in __enter__
    return next(self.gen)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 3228, in begin
    with self.connect() as conn:
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 3264, in connect
    return self._connection_cls(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 147, in __init__
    Connection._handle_dbapi_exception_noconnection(
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 2426, in _handle_dbapi_exception_noconnection
    raise sqlalchemy_exception.with_traceback(exc_info[2]) from e
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 145, in __init__
    self._dbapi_connection = engine.raw_connection()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/base.py", line 3288, in raw_connection
    return self.pool.connect()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 452, in connect
    return _ConnectionFairy._checkout(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 1268, in _checkout
    fairy = _ConnectionRecord.checkout(pool)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 716, in checkout
    rec = pool._do_get()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/impl.py", line 168, in _do_get
    with util.safe_reraise():
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/util/langhelpers.py", line 147, in __exit__
    raise exc_value.with_traceback(exc_tb)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/impl.py", line 166, in _do_get
    return self._create_connection()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 393, in _create_connection
    return _ConnectionRecord(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 678, in __init__
    self.__connect()
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 902, in __connect
    with util.safe_reraise():
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/util/langhelpers.py", line 147, in __exit__
    raise exc_value.with_traceback(exc_tb)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/pool/base.py", line 898, in __connect
    self.dbapi_connection = connection = pool._invoke_creator(self)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/create.py", line 637, in connect
    return dialect.connect(*cargs, **cparams)
  File "/var/www/myapp/venv/lib/python3.10/site-packages/sqlalchemy/engine/default.py", line 616, in connect
    return self.loaded_dbapi.connect(*cargs, **cparams)
sqlalchemy.exc.OperationalError: (sqlite3.OperationalError) unable to open database file
(Background on this error at: https://sqlalche.me/e/20/e3q8)

model.pyのソースコード

from flask_sqlalchemy import SQLAlchemy

db = SQLAlchemy()

def init_db(app):
    app.config["SQLALCHEMY_DATABASE_URI"] = "sqlite:///test.db"
    app.config["SECRET_KEY"] = os.urandom(24)
    db.init_app(app)

class Test(db.Model):
    __tablename__ = 'test'
    id = db.Column(db.Integer, primary_key=True)
    name = db.Column(db.String(255), nullable=False, unique=True)

試したこと

・Windowsのローカル環境で全く同じ手順でDBの作成は可能でした。
・SQLALCHEMY_DATABASE_URIのパスを絶対パスに変更しても同じエラー表示でした。
・エラー文で検索かけましたが、DBが開けないことによるエラーとのことで解決には至りませんでした。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

Flask==2.3.2
Flask-SQLAlchemy==3.0.3
SQLAlchemy==2.0.12

Comments

[KEMONO_PANTSU_k]

https://stackoverflow.com/questions/4636970/sqlite3-operationalerror-unable-to-open-database-file

上のリンクなどを参考にしますと、
/test.db
(ルートディレクトリ)にファイルは作成できそうでしょうか？

SQLAlchemyから.dbファイルを作成する前に、
任意のディレクトリにテキストファイルなどを作成してみて、
権限的に大丈夫そうなところ(ディレクトリ)にtest.dbを作成することを試してみたら
いかがでしょうか？

[kumakinkan]

コメント頂きありがとうございます。
ルートディレクトリに変更しても同じエラーで作成出来ませんでした。
しかし、app.config["SQLALCHEMY_DATABASE_URI"]のsqlite:///test.dbをsqlite:///test.todoに変更したら正常に作成されました。

[KEMONO_PANTSU_k]

コメントありがとうございます。
私は見当違いのことを書いてしまったみたいですね・・

ルートディレクトリにも作成できたのですね・・
(それ以外の個人ユーザー用のドキュメントディレクトリなどで試してみたらどうかな？？と思って書いていました)

でも、.dbじゃなくて.todoだとOKというのは不思議ですね。
すでにtest.dbが存在していたからエラーになってしまった、とかですかね。
(でもエラーメッセージ的にそうではなさそうですよね)

Answer 1

app.config["SQLALCHEMY_DATABASE_URI"]のsqlite:///test.dbをsqlite:///test.todoに変更したら正常に作成されました。