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解決済

ネットワーク図での可視化 ラベル付けできない

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総合スコア14

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投稿2022/10/04 08:53

編集2022/10/04 16:33

前提

相関係数の高い変数同士を結んで可視化
その各エッジに相関係数を表示させたい

実現したいこと

相関係数の高い変数同士を結んで可視化したネットワーク図のエッジに相関係数を表示させたい

発生している問題・エラーメッセージ

edgeにlabelを与えているのに表示されていない

該当のソースコード

Python

def graph(test): df = pd.read_csv(test+".csv", sep=',') df_corr = df.corr() threshold = 0.4 mask_df = df_corr.mask(np.triu(np.ones(df_corr.shape)).astype(bool), None) # 「右上の三角行列」にマスクをして、Noneに置き換える # edges data frame edges = mask_df.stack().reset_index().rename(columns={"level_0":"source", "level_1":"target", 0:"weight"}) edges['label'] = edges['weight'].apply(lambda x: np.round(x,2) if abs(x) > threshold else '') #しきい値以上の接続に限定 edges2 = edges[edges.label != ''] # networkxからpyvisに変換 G = nx.from_pandas_edgelist(edges, edge_attr=True) nt = Network(height=f'1000px', width=f'1000px', bgcolor="#FFFFFF", font_color="black", notebook=True, directed=False) # heading='test graph', nt.from_nx(G) # グラフ構造 nt.repulsion(node_distance=300) #default 300 nt.show_buttons(filter_=['physics','nodes']) nt.show(test+".html") # display(HTML(test+".html"))

test.csv

objective,column1,column2,column3 10,5,6,7 9,6,7,8 8,6,6,6

結果

イメージ説明

ここに加えて、各エッジに相関係数を表示させたい

試したこと

edges中身を表示させると、labelの値は反映されていたが、HTML上での表示はされていない

ネットワーク図の描画プログラムは初めてなので細かい部分は理解が足りていない可能性があります

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Windows11
VSCodeでipynbファイルに記述して実行しています

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2022/10/04 14:56依頼された後にこの質問は修正されています

こちらの質問が他のユーザーから「過去に投稿した質問と同じ内容の質問」という指摘を受けました。

can110

2022/10/04 09:19

現象が再現するシンプルな.csvデータ例を示すと回答得られやすくなると思います。
melian

2022/10/04 14:17

文字列型に変更してみて下さい。 edges['label'] = edges['weight'].apply(lambda x: np.round(x,2) if abs(x) > threshold else '').astype(str)
754x

2022/10/04 15:42

文字列型に変更してみましたが、表示されませんでした
melian

2022/10/04 15:47

こちらの環境は Pandas 1.5.0, NetworkX 2.8.6, Pyvis 0.3.0 ですが、係数が表示されます。
754x

2022/10/04 16:33

アップデートしたところ表示されるようになりました。ありがとうございます!

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