質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう!

新規登録して質問してみよう
ただいま回答率
85.48%
Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

Q&A

解決済

1回答

1162閲覧

ネットワーク図での可視化 ラベル付けできない

754x

総合スコア20

Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

0グッド

0クリップ

投稿2022/10/04 08:53

編集2022/10/04 16:33

前提

相関係数の高い変数同士を結んで可視化
その各エッジに相関係数を表示させたい

実現したいこと

相関係数の高い変数同士を結んで可視化したネットワーク図のエッジに相関係数を表示させたい

発生している問題・エラーメッセージ

edgeにlabelを与えているのに表示されていない

該当のソースコード

Python

1def graph(test): 2 df = pd.read_csv(test+".csv", sep=',') 3 df_corr = df.corr() 4 threshold = 0.4 5 mask_df = df_corr.mask(np.triu(np.ones(df_corr.shape)).astype(bool), None) # 「右上の三角行列」にマスクをして、Noneに置き換える 6 7 # edges data frame 8 edges = mask_df.stack().reset_index().rename(columns={"level_0":"source", "level_1":"target", 0:"weight"}) 9 edges['label'] = edges['weight'].apply(lambda x: np.round(x,2) if abs(x) > threshold else '') 10 11 #しきい値以上の接続に限定 12 edges2 = edges[edges.label != ''] 13 14 # networkxからpyvisに変換 15 G = nx.from_pandas_edgelist(edges, edge_attr=True) 16 nt = Network(height=f'1000px', width=f'1000px', bgcolor="#FFFFFF", font_color="black", notebook=True, directed=False) # heading='test graph', 17 nt.from_nx(G) 18 19 # グラフ構造 20 nt.repulsion(node_distance=300) #default 300 21 22 nt.show_buttons(filter_=['physics','nodes']) 23 24 nt.show(test+".html") 25 # display(HTML(test+".html"))

test.csv

1objective,column1,column2,column3 210,5,6,7 39,6,7,8 48,6,6,6

結果

イメージ説明

ここに加えて、各エッジに相関係数を表示させたい

試したこと

edges中身を表示させると、labelの値は反映されていたが、HTML上での表示はされていない

ネットワーク図の描画プログラムは初めてなので細かい部分は理解が足りていない可能性があります

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Windows11
VSCodeでipynbファイルに記述して実行しています

気になる質問をクリップする

クリップした質問は、後からいつでもMYページで確認できます。

またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

can110

2022/10/04 09:19

現象が再現するシンプルな.csvデータ例を示すと回答得られやすくなると思います。
melian

2022/10/04 14:17

文字列型に変更してみて下さい。 edges['label'] = edges['weight'].apply(lambda x: np.round(x,2) if abs(x) > threshold else '').astype(str)
754x

2022/10/04 15:42

文字列型に変更してみましたが、表示されませんでした
melian

2022/10/04 15:47

こちらの環境は Pandas 1.5.0, NetworkX 2.8.6, Pyvis 0.3.0 ですが、係数が表示されます。
754x

2022/10/04 16:33

アップデートしたところ表示されるようになりました。ありがとうございます!
guest

回答1

0

自己解決

edges['label']を文字列型に変更
pandas,Pyvisのライブラリをアップデート

投稿2022/10/04 16:34

754x

総合スコア20

バッドをするには、ログインかつ

こちらの条件を満たす必要があります。

あなたの回答

tips

太字

斜体

打ち消し線

見出し

引用テキストの挿入

コードの挿入

リンクの挿入

リストの挿入

番号リストの挿入

表の挿入

水平線の挿入

プレビュー

15分調べてもわからないことは
teratailで質問しよう!

ただいまの回答率
85.48%

質問をまとめることで
思考を整理して素早く解決

テンプレート機能で
簡単に質問をまとめる

質問する

関連した質問