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pythonからR呼びたいがエラーになる

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PythonでRを使いたいのですが、エラーが出て解決できないでおります。

■前提
当方、機械学習を勉強するために、Python+Rを試験実装しています。
どちらの言語も初心者です。(普段はJavaです)

■環境
Windows7 64bit
Python 3.5.2
PypeR 1.1.2
PyCharm Community Edition 2016.3

■事象
以下のようにRを呼び出していますが、エラーが出ます。

import pyper
r = pyper.R(use_pandas='True')
iris = pd.read_csv(r"C:\Users\user\Desktop\r_Sample\iris.csv")
r.assign('data', iris)
r('rlm <- lm(Sepal.Width ~ Sepal.Length + Petal.Length + Petal.Width, data=iris)')
print(r('summary(rlm)'))

エラーメッセージ

C:\Python\python.exe C:/Users/user/PycharmProjects/sample/Ayame.py
Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/user/PycharmProjects/sample/Ayame.py", line 99, in <module>
    r = pyper.R(use_numpy='True', use_pandas='True')
  File "C:\Python\lib\site-packages\pyper.py", line 600, in __init__
    self.__dict__['prog'] = Popen(RCMD, stdin=PIPE, stdout=PIPE, stderr=return_err and _STDOUT or childstderr, startupinfo=info)
  File "C:\Python\lib\subprocess.py", line 947, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python\lib\subprocess.py", line 1224, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] 指定されたファイルが見つかりません。

Process finished with exit code 1

どなたか解決方法をご教授頂けますでしょうか。。

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回答 1

checkベストアンサー

0

質問文とエラー内容、そしてPypeRのドキュメントを読む限り、
Rをインストールしていない もしくは PyeRが想定している場所とは別にインストールしている のどちらかだと思います。

もしインストールしているのであれば、

  • インストールしているコマンドをRCMDでしていする
  • インストール先のパスを環境変数に含める

のどちらかが必要です。

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  • 2016/12/12 19:35

    attakei様

    ご回答ありがとうございます。
    ご指摘の通り、Rはインストールしていたんですが、パスが通っていませんでした。
    私の環境だと、環境変数に「C:\Program Files\R\R-3.3.2\bin\x64」を追加すれば、正常に実行できました。
    大変助かりました。ありがとうございます。
    ベストアンサーとさせて頂きます。

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