非圧縮16bitのtiffデータの保存方法がわかりません。

Question

1画素＝16bitのリトルエンディアンのモノクロ、符号はなしの整数で構成されているrawデータ（イメージセンサの出力データ）を
読み込んでtiffの非圧縮の16bitで保存をしたいのですが、pltで保存すると非圧縮32bitのtifデータになり、cv2で保存すると圧縮LZW
16bitになります。
pltとcv2どちらでもいいのですが、非圧縮16bitのtifデータとして保存する方法をご教授いただけないでしょうか。

python
with open(filename +".raw","rb") as f: #2byteのrawデータファイル
data=f.read()
Imagesize =[2592,1944]
img = Image.frombytes('I;16L', Imagesize, data, "raw")
img_16bit = np.array((img), dtype='uint16')

plt.imsave('plttest.tiff', img_16bit , cmap="gray")
cv2.imwrite('cv2test.tiff', img_16bit )

Comments

[ppaul]

cv2ではできないようです。
「ようです」というのは、CV2が使っているOpenCVのソースを改変してコンパイルしなおせばできるという記事があったからです。

[hasy]

ありがとうございます。cv2は固定なんですね。
pltを非圧縮16bitで保存する方法しっていますでしょうか。

[ppaul]

PILではなく、matplotlib.pltのことですか？

[hasy]

そうです。ただ、特にこだわりがあるわけではなく、
私が初学者のため知っているのが、opencvとmatplotlib.pltというだけです。
PILでも非圧縮tiff保存できるのであればその方法でも問題ないですので、ぜひ教えてください。

Answer 1

tifffileを使うと無圧縮で保存できました。

import numpy as np
import tifffile
from PIL import Image
from PIL.TiffTags import TAGS

W, H = 32, 16

# テストデータ
data = bytes()
for b in [(65535*i//H).to_bytes(2, byteorder='little') for i in range(H)]:
    for i in range(W):
        data += b

# numpy.arrayに変換
data = np.frombuffer(data, dtype='<u2')
data = data.reshape((H,W))

# tiffとして保存
tifffile.imsave('image.tif', data)

# 確認
with Image.open('image.tif') as img:
    for k,v in img.tag.items():
        print(f'{TAGS[k]} : {v[0]}')
"""
ImageWidth : 32
ImageLength : 16
BitsPerSample : 16
Compression : 1
PhotometricInterpretation : 1
ResolutionUnit : 1
ImageDescription : {"shape": [16, 32]}
StripOffsets : 256
Software : tifffile.py
SamplesPerPixel : 1
RowsPerStrip : 16
StripByteCounts : 1024
XResolution : (1, 1)
YResolution : (1, 1)
"""

Comments

[hasy]

ありがとうございました。無事に非圧縮16bitのtiffで保存できました。