csvファイルを読み込みグラフを作成したい

前提・実現したいこと

csvファイルとして保存されている実験データを読み込み、グラフを作成するプログラミングを作成しています。バージョン(python3.7)
その際に以下のエラーが発生しました。

発生している問題・エラーメッセージ

Traceback (most recent call last):

  File "C:\Users\user.spyder-py3\I_Vsweep一括動作特性.py", line 34, in <module>
    i.append([float(df['I1'][j])])

ValueError: could not convert string to float:

該当のソースコード

import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
import glob
import os



plt.rcParams['xtick.direction']='in'
plt.rcParams['ytick.direction']='in'
fig, ax = plt.subplots(1,1)

col_names = ['D','V1','V2','I1','I2','R']

file_pass = glob.glob('F:/0911/素子1_21-40/*.csv')
file_pass.sort(key = os.path.getmtime)
c = 0

for file in file_pass:
    df = pd.read_csv(file, names = col_names)
    df = df.replace("'")
    v = ([])
    i = ([])
    c = c + 1
    for j in range(216, len(df)):
        v.append([float(df['V1'][j])])
        i.append([float(df['I1'][j])])
    ax.plot(v, i, label = 'device '+ str(c))
    ax.legend(bbox_to_anchor=(1.05,1),loc = 'upper left', borderaxespad=0)
ax.set_yscale("log")
ax.set_title('switching I-V')
ax.set_xlabel("V")
ax.set_ylabel("I")

試したこと

float(df['I1'][216])
Out[46]: -1.4169200000000002e-10
上記のようにfor文を用いずに変換すると正しく変換されているようなのです。
しかしながら、
for j in range(216,len(df)):
print(float(df['I1'][j]))
Traceback (most recent call last):

File "<ipython-input-48-e11b1cc39de7>", line 2, in <module>
print(float(df['I1'][j]))

ValueError: could not convert string to float:
上記に用に繰り返しを用いるとエラーが発生します。
また、ネットで調べてDecimalで変換するなどもやってみたのですがうまくいかなかったようです。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

読み込むcsvファイルは下記のようになっています。
D ... R
0 SetupTitle ... NaN
1 PrimitiveTest ... NaN
2 TestParameter ... NaN
3 TestParameter ... NaN
4 TestParameter ... NaN
.. ... ... ...
247 DataValue ... 77221884.213974833
248 DataValue ... 73755911.3193631
249 DataValue ... 44300993.607999496
250 DataValue ... 1125314.1502002643
251 DataValue ...

[252 rows x 6 columns]
問題のI1列は以下のようになっています。
0 NaN
1 NaN
2 NaN
3 SMU
4 SMU2:MP

247 -1.28202E-08
248 -1.38294E-08
249 -2.37015E-08
250 -9.59732E-07
251
Name: I1, Length: 252, dtype: object

can110

2021/06/17 02:20

「for j in range(216, len(df)):」の次行に「print(j)」を追加し、何行目でエラー発生しているかを特定してください。さらにその時のdf['I1']に入っている値を「print( df['I1'][???])」なりで確認し提示ください。

tomonitanimo

2021/06/17 03:08

can110様修正依頼ありがとうございます。回答してくださっ方が指摘してくれたように最後の部分が空文字になっていてエラーになっていたようです。しかし、can110様のおかげでfor文でエラーが出た時の対処法について勉強させていただきました。ありがとうございました。

行動規範の内容に同意します

回答2件

pandas.to_numeric()を使うと、文字列から数値への変換が簡単にできます。

https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/reference/api/pandas.to_numeric.html

errors='coerce'でやると、数値に変換できないところがNaNになります。
グラフプロットが目的なら、それで問題ないかと思います。

python
1for file in file_pass:
2    df = pd.read_csv(file, names = col_names)
3    df = df.replace("'")
4    c = c + 1
5    v = pd.to_numeric(df['V1'][216:], errors='coerce')
6    i = pd.to_numeric(df['I1'][216:], errors='coerce')
7    ax.plot(v, i, label = 'device '+ str(c))
8    ax.legend(bbox_to_anchor=(1.05,1),loc = 'upper left', borderaxespad=0)