pythonでアニメーションgifが保存できない

Question

python で熱拡散の様子がわかるアニメーションを作っています。
アニメーションを出力することはできたのですが、gif保存ができずに困っています。
どうゆう箇所をチェックすればよろしいでしょうか？
プログラミング初心者故によくわからず、検討違いかもしれませんが
pythonやanacondaを再インストールしましたが同じようなエラーが出力されました。

OS:win10
python3.8
anadonda3を利用しています。

以下がエラー文になります。
Traceback (most recent call last):
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 230, in saving
yield self
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 1152, in save
writer.grab_frame(**savefig_kwargs)
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 568, in grab_frame
self._frames.append(Image.frombuffer(
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\PIL\Image.py", line 2706, in frombuffer
im = im._new(core.map_buffer(data, size, decoder_name, 0, args))
ValueError: buffer is not large enough

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
File "try2.py", line 116, in <module>
ani.save('時刻歴温度分布,T=60,D=1,dt=0.1,dx=2.gif', writer='pillow')
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 1152, in save
writer.grab_frame(**savefig_kwargs)
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\contextlib.py", line 131, in exit
self.gen.throw(type, value, traceback)
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 232, in saving
self.finish()
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 574, in finish
self._frames[0].save(
IndexError: list index out of range

以下がコードになります。
何卒よろしくお願い致します。

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.animation as animation
import numpy as np
import math
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
from matplotlib import animation


DIM = 2          ##次元
D = 1

#pi = math.pi     ##円周率
r = 1.0            ##粒子半径,アニメーションにのみ使用
dx = 2.0*r         ##初期粒子間距離
h = 1.0*dx         ##1~1.2の間でかける
re = 3.0*h           ##影響半径
##解析範囲の設定
H = 20           ##解析範囲の高さ方向の粒子数
W = 20           ##解析範囲の高さ方向の粒子数
ρ0 = 2700.0        ##水の密度
T = 1.0
dt =0.1
TH_O = 1200
ms = 16

Rx_wall = [] ##壁粒子の位置
Ry_wall = []

Rx_in = [] ##内部粒子の位置
Ry_in = []

C_x_f = 2*re          ##坩堝の左下の粒子位置x
C_x_l = W*(2*r) - 2*re    ##坩堝の右下の粒子番号x


for i in range(0,W):##解析範囲に全ての粒子を入れるとして、その位置情報をRに入れていく
    for k in range(0,H):
        x = r + i*(2*r)
        y = r + k*(2*r)
        if x <= C_x_f and C_x_f <= y:##左上
            Rx_wall.append(x)
            Ry_wall.append(y)
        if y < C_x_f:##真下
            Rx_wall.append(x)
            Ry_wall.append(y)
        if C_x_l <= x and C_x_f <= y:
            Rx_wall.append(x)
            Ry_wall.append(y)

N_wall = len(Rx_wall)    ##壁粒子の数

for i in range(0,W):##解析範囲に全ての粒子を入れるとして、その位置情報をRに入れていく
    for k in range(0,H):
        x = r + i*(2*r)
        y = r + k*(2*r)
        if  C_x_f <= x and x < W*(2*r)-C_x_f and C_x_f <= y :
            Rx_in.append(x)
            Ry_in.append(y)

N_in = len(Rx_in)    ##坩堝内の粒子数
N = N_in + N_wall
#print(Rx_in,Ry_in)
print("粒子数",N,"壁内粒子数",N_in,"壁粒子数",N_wall)
plt.plot(Rx_wall,Ry_wall,color = "k",linestyle = "None",marker ="o",markersize = ms)
plt.plot(Rx_in,Ry_in,color = "b",linestyle = "None",marker ="o",markersize = ms)
plt.show()




Rx = np.zeros(N,dtype=np.float) 
Ry = np.zeros(N,dtype=np.float)
for i in range(N):
    if i < N_in:
        Rx[i] = Rx_in[i]
        Ry[i] = Ry_in[i]
    if N_in <= i:
        Rx[i] = Rx_wall[i-N_in]
        Ry[i] = Ry_wall[i-N_in]
fig = plt.figure()
ims = []

TH = np.zeros(N,dtype=np.float)
r_TH_O = 5

for t in range(int(T/dt)+1):
    print(t*dt)

    for i in range(N):##温度拡散の計算、i粒子について調べる
        dTH = 0
        for k in range(N):##k粒子がi粒子の近傍に存在するか確認
            dis = math.sqrt((Rx[i]-Rx[k])**2 + (Ry[i]-Ry[k])**2)
            s = dis/h
            if s < 1.0 and 0.0 < s :
                fs_s = 7.0/(478.0*math.pi)*(-5.0*(3.0-s)**4.0 + 30.0*(2.0-s)**4.0 -75.0*(1.0-s)**4.0)
                dTH += D*dt*2*(TH[i]-TH[k])*(fs_s/dis)*(2*r)**2
            elif s < 2.0 and 1.0 <= s :
                fs_s = 7.0/(478.0*math.pi)*(-5.0*(3.0-s)**4.0 + 30.0*(2.0-s)**4.0)
                dTH += D*dt*2*(TH[i]-TH[k])*(fs_s/dis)*(2*r)**2
            elif s < 3.0 and 2.0 <= s :
                fs_s = 7.0/(478.0*math.pi)*(-5.0*(3.0-s)**4.0)
                dTH += D*dt*2*(TH[i]-TH[k])*(fs_s/dis)*(2*r)**2
            else:
                continue
        TH[i] += dTH
    for i in range(N):
        if Ry[i] >= H*(2*r)-2*r and r+r*W-r_TH_O <= Rx[i] and Rx[i] <= r+r*W+r_TH_O:##坩堝の照射範囲内にある粒子を強制的に1200度にする
            TH[i]=TH_O
    THi = list(map(float,TH))
    im = plt.scatter(Rx,Ry, vmin=min(THi), vmax=max(THi), c=THi, cmap="plasma",s = ms*9)
    ims.append([im])

cbar = plt.colorbar()        
ani = animation.ArtistAnimation(fig, ims)
plt.show()
ani.save('時刻歴温度分布,T=60,D=1,dt=0.1,dx=2.gif', writer='pillow')

Comments

[jbpb0]

> ValueError: buffer is not large enough

https://github.com/matplotlib/matplotlib/issues/15678/
によると、Matplotlib 3.3あたりで修正されてるようです

3.3.0は、この質問がされたより1ヵ月くらい前にリリースされてました
https://pypi.org/project/matplotlib/3.3.0/

Answer 1

ValueError: buffer is not large enough

Error at save animation with pillow #15678
によると、Matplotlib 3.3あたりで修正されてるようです

matplotlib 3.3.0
は、この質問がされたより1ヵ月くらい前にリリースされてました

Answer 2

IndexError: list index out of range

はlistの範囲外をアクセスしているために発生しているエラーです。

どうゆう箇所をチェックすればよろしいでしょうか？

コード上でlistの要素にアクセスしているすべての場所で、範囲外をアクセスしているところがないか確認すればよいです。

Comments

[s1920897]

申し訳ございません。エラー文は以下でした。一部のみコピペしていたようです。
ani.saveの段をコメントアウトするとしっかり動きます(保存はできませんが)。

Traceback (most recent call last):
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 230, in saving
yield self
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 1152, in save
writer.grab_frame(**savefig_kwargs)
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 568, in grab_frame
self._frames.append(Image.frombuffer(
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\PIL\Image.py", line 2706, in frombuffer
im = im._new(core.map_buffer(data, size, decoder_name, 0, args))
ValueError: buffer is not large enough

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
File "try2.py", line 116, in <module>
ani.save('時刻歴温度分布,T=60,D=1,dt=0.1,dx=2.gif', writer='pillow')
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 1152, in save
writer.grab_frame(**savefig_kwargs)
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\contextlib.py", line 131, in __exit__
self.gen.throw(type, value, traceback)
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 232, in saving
self.finish()
File "C:\Users\kstkh\anaconda3\lib\site-packages\matplotlib\animation.py", line 574, in finish
self._frames[0].save(
IndexError: list index out of range

[8524ba23]

提示コードでエラー発生せず、アニメーションするgifができました。
OSやPython、使用しているモジュールのバージョンなどを質問本文に記載するとよいかと思われます。

[s1920897]

確認ありがとうございます。
わかりました。