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Minicondaをインストールしたのにconda, pipコマンドが使えない

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harunouta

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 前提・実現したいこと

以下の参考記事に沿って、Minicondaをインストールしました。
condaとpipコマンドを使いたいです。
参考記事

 発生している問題・エラーメッセージ

% conda install scipy
zsh: command not found: conda
% pip install peewee
zsh: command not found: pip

 試したこと

ここまでは問題なくできました。

$ bash Miniconda2-latest-MacOSX-x86_64.sh

再度インストールしてPATHを通そうとしました。

Do you wish the installer to prepend the Miniconda3 install location
to PATH in your /home/usename/.bashrc ? [yes|no]
[no] >>> yes

Appending source /home/username/miniconda3/bin/activate to /home/username/.bashrc
A backup will be made to: /home/username/.bashrc-miniconda3.bak


For this change to become active, you have to open a new terminal.

Thank you for installing Miniconda3!
% conda
zsh: command not found: conda
% pip
zsh: command not found: pip

 補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Linux version 4.18.9-arch1-1-ARCH
Minicondaは、Python 3.7のLinux 64-bit (bash installer)をインストールしました。

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anaconda をインストールした場所を ~/.bashrc で PATH 環境変数に追加してください

~/.bashrc

export PATH="<anaconda のインストールパス>/bin:$PATH"

anaconda のインストールパスは環境によって変わるので調べてください。
なにも指定しない場合は /opt 以下だったような気がします。

 Ubuntu 16.04 で再現した手順

Docker 上のまっさらな Ubuntu 16.04 環境に Miniconda をインストールした手順です。

必要なプログラムを入れる。

$ apt-get update
$ apt-get install -y wget bzip2

Miniconda をダウンロードし、インストールする。

$ wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
$ bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Welcome to Miniconda3 4.5.11

In order to continue the installation process, please review the license
agreement.
Please, press ENTER to continue
>>> 

Enter キーを押すと利用規約が表示さます。

Do you accept the license terms? [yes|no]
[no] >>> Please answer 'yes' or 'no':'
>>>  yes 

一番下までスクロールし、yes を入力し、Enter を押します。

Miniconda3 will now be installed into this location:
/root/miniconda3

  - Press ENTER to confirm the location
  - Press CTRL-C to abort the installation
  - Or specify a different location below

ここにインストール先のディレクトリが表示されています。(この例では、/root/miniconda3)
環境によって違うので、確認してください。
Enter キーを押し、インストールを続行します。

PREFIX=/root/miniconda3
installing: python-3.7.0-hc3d631a_0 ...
Python 3.7.0 (default, Jun 28 2018, 13:15:42) 
[GCC 7.2.0]
installing: ca-certificates-2018.03.07-0 ...
installing: conda-env-2.6.0-1 ...
installing: libgcc-ng-8.2.0-hdf63c60_1 ...
installing: libstdcxx-ng-8.2.0-hdf63c60_1 ...
installing: libffi-3.2.1-hd88cf55_4 ...
installing: ncurses-6.1-hf484d3e_0 ...
installing: openssl-1.0.2p-h14c3975_0 ...
installing: xz-5.2.4-h14c3975_4 ...
installing: yaml-0.1.7-had09818_2 ...
installing: zlib-1.2.11-ha838bed_2 ...
installing: libedit-3.1.20170329-h6b74fdf_2 ...
installing: readline-7.0-h7b6447c_5 ...
installing: tk-8.6.8-hbc83047_0 ...
installing: sqlite-3.24.0-h84994c4_0 ...
installing: asn1crypto-0.24.0-py37_0 ...
installing: certifi-2018.8.24-py37_1 ...
installing: chardet-3.0.4-py37_1 ...
installing: idna-2.7-py37_0 ...
installing: pycosat-0.6.3-py37h14c3975_0 ...
installing: pycparser-2.18-py37_1 ...
installing: pysocks-1.6.8-py37_0 ...
installing: ruamel_yaml-0.15.46-py37h14c3975_0 ...
installing: six-1.11.0-py37_1 ...
installing: cffi-1.11.5-py37he75722e_1 ...
installing: setuptools-40.2.0-py37_0 ...
installing: cryptography-2.3.1-py37hc365091_0 ...
installing: wheel-0.31.1-py37_0 ...
installing: pip-10.0.1-py37_0 ...
installing: pyopenssl-18.0.0-py37_0 ...
installing: urllib3-1.23-py37_0 ...
installing: requests-2.19.1-py37_0 ...
installing: conda-4.5.11-py37_0 ...
installation finished.
Do you wish the installer to prepend the Miniconda3 install location
to PATH in your /root/.bashrc ? [yes|no]
[no] >>> yes

PATH 環境変更に追加するか聞かれるので、yes を入力し、Enter キーを押します。

You may wish to edit your .bashrc to prepend the Miniconda3 install location to PATH:

export PATH=/root/miniconda3/bin:$PATH

Thank you for installing Miniconda3!

.bashrc を見ると、追加されている。

export PATH="/root/miniconda3/bin:$PATH"

これでインストールが完了です。

$ source ~/.bashrc
$ which conda
/root/miniconda3/bin/conda

これで conda や pip コマンドが使えることが確認できました。

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  • 2018/09/27 10:44

    ご回答いただきましてありがとうございます。
    PATH環境変数を追加する方法を調べているのですが、もしanacondaの PATH 環境変数に関する説明記事をご存知でしたら共有いただけますと幸いです。

    キャンセル

  • 2018/09/27 11:17

    追記しました。記事ですと、https://qiita.com/t2y/items/2a3eb58103e85d8064b6 がよくまとまっていると思います。

    キャンセル

  • 2018/09/27 11:34

    追記いただきましてありがとうございます。
    Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shのある場所のPATHと言う認識で合っていますか。

    キャンセル

  • 2018/09/27 11:38

    `Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh` はインストーラーなので違います。
    自分の場合、`/opt/anaconda3-5.0.1/bin` を環境変数に追加しています。
    たぶん、/home または /opt あたりにあると思うので、わからなければ find /opt/ -name conda のように find コマンドで探してください。

    キャンセル

  • 2018/09/27 11:53 編集

    % find /opt/ -name condaだとpermission deniedだったので、
    以下のコマンドを代わりに実行しましたが、これだけではPATHはわからないでしょうか。
    % find -name conda
    ./download/pkgs/conda-4.5.11-py37_0/bin/conda
    ./download/pkgs/conda-4.5.11-py37_0/lib/python3.7/site-packages/conda
    ./download/bin/conda
    ./download/lib/python3.7/site-packages/conda

    キャンセル

  • 2018/09/27 12:00

    /download 以下にインストールしたのですかね? であれば、以下を ~/bashrc に追加し、source ~/.bashrc で読み込んで、conda コマンドが使えるか確認してみてはどうでしょうか?

    ```
    export PATH="~/download/pkgs/conda-4.5.11-py37_0/bin:$PATH"
    ```

    キャンセル

  • 2018/09/27 13:46

    /home/username/の下で、
    %vim ~/.bashrc
    #added by MIniconda3 installer
    export PATH="~/download/pkgs/conda-4.5.11-py37_0/bin:$PATH"
    % source ~/.bashrc
    % pip install peewee
    zsh: command not found: pip
    と出てしまいました。

    キャンセル

  • 2018/09/27 13:50

    パスを通して、conda コマンドは使えるようになりましたか?
    which python としたら、どのパスが表示されていますか?

    ちなみに、この記事によると、パスの設定は本来インストール時に設定するかどうか聞かれるようなので、解決が難しいようであれば、もう一度下記記事を参考にインストールしたほうがいいかもしれません。
    https://qiita.com/m0p1nt/items/b55b175c78ecfa42eeea

    キャンセル

  • 2018/09/27 13:53

    condaコマンドも使えないままです。
    % which python
    /usr/bin/python
    となりました。

    再度インストールします。お手数おかけして申し訳ございません。

    キャンセル

  • 2018/09/27 13:54

    ちなみに、MInicondaとAnacondaのちがいでインストールの違いなどはないでしょうか。

    キャンセル

  • 2018/09/27 14:10

    再度インストールし直してPATHを通そうとしましたが、その後、condaとpipをしてもやはりコマンドがないと出てしまいました。

    キャンセル

  • 2018/09/27 14:44

    Ubuntu 16.04 の環境上で実際に試してみましたが、上記の通りインストールできました。
    インストーラーに表示される英文 (利用規約以外) は内容を読んでください。

    すでにインストール済みであると下記のようにでるので、rm で削除してから再インストールしてみてください。
    ```
    ERROR: File or directory already exists: '/root/miniconda3'
    If you want to update an existing installation, use the -u option.
    ```

    キャンセル

  • 2018/09/27 23:16

    ご丁寧にありがとうございました。

    キャンセル

+2

zshを使っているのですか?

おそらく.zshrcにパスの設定を書かないと無理かと。

zsh環境だとpython anacondaがうごかなくてハマった | weblog

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