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plot_model()のImportエラー(pydot)

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mori_takeshi

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実現したいこと

plot_modelを使ってモデルの可視化を行いたい。

現状

以下に記述しているコードで学習したモデルの可視化を行うため、plot_model()で出力しようとしたところ、ImportErrorが出ました。
調べてみたところ、pydotの開発が止まっており、python3.5以降だと動作しないとのことでしたので、代わりにpydotplusをインストールし、再度実行してみました。
しかし、同様にplot_model()の部分でImportErrorが発生しております。
pydotplusにパスが通ってることは確認できているのですが、解決法が分かりません。よろしくお願いいたします。

※参考にした記事

環境

Python3.6
Tensorflow-gpu 1.9.0
Windows10

import tensorflow as tf
from tensorflow import keras as K
from tensorflow.keras.layers import Dense, Activation, Conv2D
from tensorflow.keras.models import Sequential
from tensorflow.keras.preprocessing.image import ImageDataGenerator, array_to_img, img_to_array
from tensorflow.keras import callbacks
from tensorflow.keras.callbacks import CSVLogger
import pydotplus as pydot
from keras.utils.vis_utils import plot_model

#モデルは省略
# (x_train, y_trainはNumpy行列の学習データ)
model.fit_generator(
    train_data_generator,
    validation_data=(test_x, test_y),
    steps_per_epoch=N_TRAIN_DATA // BATCH_SIZE,
    epochs=50,
    callbacks=callbacks
)

pred = model.predict(test_x)

plot_path = os.path.join(model_dir, "model.png")
plot_model(model, to_file=plot_path, show_shapes=True)
Traceback (most recent call last):
  File "C:/.../CNN_SR.py", line 121, in <module>
    plot_model(model, to_file=plot_path, show_shapes=True)
  File "C:...\lib\site-packages\keras\utils\vis_utils.py", line 133, in plot_model
    dot = model_to_dot(model, show_shapes, show_layer_names, rankdir)
  File "C:...\lib\site-packages\keras\utils\vis_utils.py", line 55, in model_to_dot
    _check_pydot()
  File "C:...\lib\site-packages\keras\utils\vis_utils.py", line 20, in _check_pydot
    'Failed to import `pydot`. '
ImportError: Failed to import `pydot`. Please install `pydot`. For example with `pip install pydot`.

pip listの出力

>pip list
Package             Version
------------------- -------------
absl-py             0.2.2
astor               0.7.1
cycler              0.10.0
gast                0.2.0
grpcio              1.13.0
h5py                2.8.0
Keras               2.2.0
Keras-Applications  1.0.2
Keras-Preprocessing 1.0.1
kiwisolver          1.0.1
llvmlite            0.24.0
Markdown            2.6.11
matplotlib          2.2.2
numba               0.39.0
numpy               1.14.5
opencv-python       3.4.2+contrib
pandas              0.23.3
Pillow              5.2.0
pip                 10.0.1
protobuf            3.6.0
pydotplus           2.0.2
pyparsing           2.2.0
python-dateutil     2.7.3
pytz                2018.5
PyYAML              3.13
scipy               1.1.0
setuptools          39.1.0
six                 1.11.0
tensorboard         1.9.0
tensorflow-gpu      1.9.0
termcolor           1.1.0
Werkzeug            0.14.1
wheel               0.31.1
You are using pip version 10.0.1, however version 18.0 is available.
You should consider upgrading via the 'python -m pip install --upgrade pip' command.
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  • wakame

    2018/08/02 17:51

    pip listの結果が知りたいです

    キャンセル

  • mori_takeshi

    2018/08/02 20:14

    見にくかったので,本文の最後に載せて更新しております.よろしくお願いいたします.

    キャンセル

回答 2

check解決した方法

+1

解決法

from keras.utils.vis_utils import plot_model

from tensorflow.python.keras.utils.vis_utils import plot_model

問題だった点

tensorflowのkerasはこちらのソースにあるようimport時にpydot_ng,pydotplusをimportするように記述されているが,keras(ver=2.2.0)はimport時,pydotしかimportするようにしか記述されていなかった.

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+1

tensorflow-gpuが1.9.0であればこの変更でいけるかなと

# from keras.utils.vis_utils import plot_model
from tensorflow.keras.vis_utils import plot_model


https://www.tensorflow.org/api_docs/python/tf/keras/utils/plot_model

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  • 2018/08/02 20:59

    先ほどは修正が反映されておらず,すみませんでした.
    上記の回答を試したところ,utilsにvis_utilsがないと言われました.
    以下はエラーの出力です.

    Traceback (most recent call last):
    File "C:/Users/ken/PycharmProjects/tensor/venv/CNN_SR.py", line 12, in <module>
    from tensorflow.keras.utils.vis_utils import plot_model
    ModuleNotFoundError: No module named 'tensorflow.keras.utils.vis_utils'

    キャンセル

  • 2018/08/02 22:36

    失礼しました、修正したのでもう一度試してもらえますか

    キャンセル

  • 2018/08/02 23:19

    回答ありがとうございます.
    上記の修正を試しましたところ,同様にkerasにvis_utilsが無いと言われました.

    しかし,回答のほうにありましたURLからvis_utils.pyのソースを確認しましたところ,pydotplusやpydot_ngを呼んでいる記述があったにもかかわらず,keras.utils.vis_utilsにはなかったため,他のvis_utilsを探しまして,2つを呼んでいるライブラリを発見しました.
    以下で実行したところ,正常に動作し,可視化に成功いたしました

    from tensorflow.python.keras.utils.vis_utils import plot_model

    ご回答感謝いたします.

    キャンセル

  • 2018/08/03 07:03

    申し訳ありません、お手数おかけしました。

    キャンセル

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