多次元リストの作り方を教えてほしいです。

Question

下記のコードのnum_2に格納されている数字を1列ごと違うリストに入れたいです。

実践したこと

import collections
from collections import Counter
from pkgutil import iter_importers
from pprint import pprint

data = [
["A", "B", "C", "D", "E", "E"],
["C", "D", "E", "A", "B", "B"],
["D", "C", "E", "A", "A", "D"],
["D", "A", "C", "B", "D", "E"],
]

items_each_column = []
for c in zip(*data):
    items_each_column.append(len(set(c)))
#print(items_each_column)

frequency = []

for z in zip(*data):
    frequency.append(z)
    z_list = list(z)
   
    nx = list(map(Counter,map(list, zip(*data))))

num = len(nx)


num_2 = []

for i in range(num):
    for j in ["A", "B", "C", "D", "E"]:
        ni = nx[i][j]
        if ni == 0:
            continue
        num_2.append(ni)
print(num_2)

#出力結果
#[1, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 2]

このような結果が得られたのですが、想定していた結果は
[[1, 1, 2], [1, 1, 1, 1], [2, 2], [2, 1, 1], [1, 1, 1, 1], [1, 1, 2]]
です。
これはdataの1列目にAが１つ、Cが１つ、Eが2つ、2列目にAが１つ、Bが１つ、Cが１つ、Dが１つ、、、のように対応しています。