Windows10環境でprophetを実行したい

実現したいこと

ローカル環境のjupyter notebookでprophetのライブラリを用いた解析を行いたいと考えています。

発生している問題・分からないこと

prophetをインストールし、動かそうとしたのですが、
「AttributeError: 'Prophet' object has no attribute 'stan_backend'」
とエラーが出ました。
調べると、pystanが動く環境である必要があるとのことだったので、
pystanのインストールを行ったのですが、これも上手くコンパイルできずに困っています。
どのように対処すればうまく動くようになるかご教授頂きたいです。

エラーメッセージ

error
1DistutilsExecError                        Traceback (most recent call last)
2D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\cygwinccompiler.py in _compile(self, obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts)
3    144                 self.spawn(
4--> 145                     self.compiler_so + cc_args + [src, '-o', obj] + extra_postargs
5    146                 )
6
7D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\ccompiler.py in spawn(self, cmd, **kwargs)
8   1006     def spawn(self, cmd, **kwargs):
9-> 1007         spawn(cmd, dry_run=self.dry_run, **kwargs)
10   1008 
11
12D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\spawn.py in spawn(cmd, search_path, verbose, dry_run, env)
13     70         raise DistutilsExecError(
14---> 71             "command {!r} failed with exit code {}".format(cmd, exitcode)
15     72         )
16
17DistutilsExecError: command 'C:\\Users\\○○○\\anaconda3\\Library\\mingw-w64\\bin\\gcc.exe' failed with exit code 1
18
19During handling of the above exception, another exception occurred:
20
21CompileError                              Traceback (most recent call last)
22~\AppData\Local\Temp\ipykernel_13756\1613198025.py in <module>
23      1 from pystan import StanModel
24      2 
25----> 3 model = StanModel(model_code="parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}")
26      4 print(model.sampling()["y"].mean())
27
28D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\model.py in __init__(self, file, charset, model_name, model_code, stanc_ret, include_paths, boost_lib, eigen_lib, verbose, obfuscate_model_name, extra_compile_args, allow_undefined, include_dirs, includes)
29    376 
30    377         try:
31--> 378             build_extension.run()
32    379         finally:
33    380             if redirect_stderr:
34
35D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in run(self)
36    344 
37    345         # Now actually compile and link everything.
38--> 346         self.build_extensions()
39    347 
40    348     def check_extensions_list(self, extensions):  # noqa: C901
41
42D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in build_extensions(self)
43    466             self._build_extensions_parallel()
44    467         else:
45--> 468             self._build_extensions_serial()
46    469 
47    470     def _build_extensions_parallel(self):
48
49D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in _build_extensions_serial(self)
50    492         for ext in self.extensions:
51    493             with self._filter_build_errors(ext):
52--> 494                 self.build_extension(ext)
53    495 
54    496     @contextlib.contextmanager
55
56D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in build_extension(self, ext)
57    554             debug=self.debug,
58    555             extra_postargs=extra_args,
59--> 556             depends=ext.depends,
60    557         )
61    558 
62
63D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\ccompiler.py in compile(self, sources, output_dir, macros, include_dirs, debug, extra_preargs, extra_postargs, depends)
64    597             except KeyError:
65    598                 continue
66--> 599             self._compile(obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts)
67    600 
68    601         # Return *all* object filenames, not just the ones we just built.
69
70D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\cygwinccompiler.py in _compile(self, obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts)
71    146                 )
72    147             except DistutilsExecError as msg:
73--> 148                 raise CompileError(msg)
74    149 
75    150     def link(
76
77CompileError: command 'C:\\Users\\○○○\\anaconda3\\Library\\mingw-w64\\bin\\gcc.exe' failed with exit code 1

該当のソースコード

Python
1from pystan import StanModel
2
3model = StanModel(model_code="parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}")
4print(model.sampling()["y"].mean())

試したこと・調べたこと

teratailやGoogle等で検索した
ソースコードを自分なりに変更した
知人に聞いた
その他

上記の詳細・結果

https://pystan2.readthedocs.io/en/latest/windows.html
https://indonegiyaland.hatenablog.com/entry/2022/03/31/162245
上記のページを参考に設定しました。

補足

仮想環境で実施しており、インストールしているライブラリは以下の通りです。
（関係あると思われるもののみ抜粋しています）
Name Version Build Channel
cython 0.29.32 py37hf2a7229_0 conda-forge
ephem 4.1.2 py37h2bbff1b_0
holidays 0.18 py37haa95532_0
libpython 2.1 py37_0
m2w64-binutils 2.25.1 5
m2w64-bzip2 1.0.6 6
m2w64-crt-git 5.0.0.4636.2595836 2
m2w64-gcc 5.3.0 6
m2w64-gcc-ada 5.3.0 6
m2w64-gcc-fortran 5.3.0 6
m2w64-gcc-libgfortran 5.3.0 6
m2w64-gcc-libs 5.3.0 7
m2w64-gcc-libs-core 5.3.0 7
m2w64-gcc-objc 5.3.0 6
m2w64-gmp 6.1.0 2
m2w64-headers-git 5.0.0.4636.c0ad18a 2
m2w64-isl 0.16.1 2
m2w64-libiconv 1.14 6
m2w64-libmangle-git 5.0.0.4509.2e5a9a2 2
m2w64-libwinpthread-git 5.0.0.4634.697f757 2
m2w64-make 4.1.2351.a80a8b8 2
m2w64-mpc 1.0.3 3
m2w64-mpfr 3.1.4 4
m2w64-pkg-config 0.29.1 2
m2w64-toolchain 5.3.0 7 msys2
m2w64-tools-git 5.0.0.4592.90b8472 2
m2w64-windows-default-manifest 6.4 3
m2w64-winpthreads-git 5.0.0.4634.697f757 2
m2w64-zlib 1.2.8 10
mkl 2020.2 256
prophet 1.0.1 py37haa95532_0
pystan 2.19.1.1 py37hac22706_0
python 3.7.16 h6244533_0
setuptools 65.6.3 py37haa95532_0

quickquip

2024/08/08 03:18

該当のソースコードに書いてあるコードの実行結果がエラーメッセージに書いてあるものですか? 上の方に省略がありますか?

chem_search

2024/08/08 03:37

ご回答ありがとうございます。該当のソースコードを実行した結果出力されたエラーメッセージが上記の通りです。省略はしていません。また、pystanのインストールにおいては、仮想環境作成後、 conda install cython,numpy conda install pystan==2.19.1.1 conda install libpython m2w64-toolchain -c msys2 とインストールし、「試したこと・調べたこと」のリンク先にあるdistutils.cfgファイルは問題無くできていることを確認しました。また、 https://guppi524.hatenablog.jp/entry/2022/12/24/191910 こちらのページには import distutils print(distutils.__file__) で出力されるパスにdistutils.cfgをコピーする必要があると記載されていたので、そちらも試しました。その後のコード実行結果が記載したものになります。

quickquip

2024/08/08 04:19

model.py を読んでみると model = StanModel(model_code="parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}", verbose=True) とか verbose=2 とかすることでビルドのログが増えそうでした見てみてはどうでしょうか

chem_search

2024/08/08 04:38

ありがとうございます。試してみましたが､以下の通りでした。エラー部分は変わらないように思います。 INFO:pystan:COMPILING THE C++ CODE FOR MODEL anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf NOW. INFO:pystan:OS: win32, Python: 3.7.16 (default, Jan 17 2023, 16:06:28) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)], Cython 0.29.32 Compiling C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_2102178565924967345.pyx because it changed. [1/1] Cythonizing C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_2102178565924967345.pyx INFO:root:building 'stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_2102178565924967345' extension INFO:root:creating C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users INFO:root:creating C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users\○○○ INFO:root:creating C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users\○○○\appdata INFO:root:creating C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users\○○○\appdata\local INFO:root:creating C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users\○○○\appdata\local\temp INFO:root:creating C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users\○○○\appdata\local\temp\pystan_yi8rt05r INFO:root:gcc -mdll -O -Wall -DBOOST_RESULT_OF_USE_TR1 -DBOOST_NO_DECLTYPE -DBOOST_DISABLE_ASSERTS -IC:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\stan\src -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\stan\lib\stan_math -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\stan\lib\stan_math\lib\eigen_3.3.3 -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\stan\lib\stan_math\lib\boost_1.69.0 -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\stan\lib\stan_math\lib\sundials_4.1.0\include -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\numpy\core\include -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\include -ID:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\Include -c C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_2102178565924967345.cpp -o C:\Users\○○○\AppData\Local\Temp\pystan_yi8rt05r\users\○○○\appdata\local\temp\pystan_yi8rt05r\stanfit4anon_model_5944b02c79788fa0db5b3a93728ca2bf_2102178565924967345.o -O2 -ftemplate-depth-256 -Wno-unused-function -Wno-uninitialized -std=c++1y -D_hypot=hypot -pthread -fexceptions --------------------------------------------------------------------------- DistutilsExecError Traceback (most recent call last) D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\cygwinccompiler.py in _compile(self, obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts) 144 self.spawn( --> 145 self.compiler_so + cc_args + [src, '-o', obj] + extra_postargs 146 ) D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\ccompiler.py in spawn(self, cmd, **kwargs) 1006 def spawn(self, cmd, **kwargs): -> 1007 spawn(cmd, dry_run=self.dry_run, **kwargs) 1008 D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\spawn.py in spawn(cmd, search_path, verbose, dry_run, env) 70 raise DistutilsExecError( ---> 71 "command {!r} failed with exit code {}".format(cmd, exitcode) 72 ) DistutilsExecError: command 'C:\\Users\\○○○\\anaconda3\\Library\\mingw-w64\\bin\\gcc.exe' failed with exit code 1 During handling of the above exception, another exception occurred: CompileError Traceback (most recent call last) ~\AppData\Local\Temp\ipykernel_8112\1436560234.py in <module> 1 from pystan import StanModel 2 ----> 3 model = StanModel(model_code="parameters {real y;} model {y ~ normal(0,1);}", verbose=True) 4 print(model.sampling()["y"].mean()) D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\pystan\model.py in __init__(self, file, charset, model_name, model_code, stanc_ret, include_paths, boost_lib, eigen_lib, verbose, obfuscate_model_name, extra_compile_args, allow_undefined, include_dirs, includes) 376 377 try: --> 378 build_extension.run() 379 finally: 380 if redirect_stderr: D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in run(self) 344 345 # Now actually compile and link everything. --> 346 self.build_extensions() 347 348 def check_extensions_list(self, extensions): # noqa: C901 D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in build_extensions(self) 466 self._build_extensions_parallel() 467 else: --> 468 self._build_extensions_serial() 469 470 def _build_extensions_parallel(self): D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in _build_extensions_serial(self) 492 for ext in self.extensions: 493 with self._filter_build_errors(ext): --> 494 self.build_extension(ext) 495 496 @contextlib.contextmanager D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\command\build_ext.py in build_extension(self, ext) 554 debug=self.debug, 555 extra_postargs=extra_args, --> 556 depends=ext.depends, 557 ) 558 D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\ccompiler.py in compile(self, sources, output_dir, macros, include_dirs, debug, extra_preargs, extra_postargs, depends) 597 except KeyError: 598 continue --> 599 self._compile(obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts) 600 601 # Return *all* object filenames, not just the ones we just built. D:\Anaconda_envs\envs\prophet_env\lib\site-packages\setuptools\_distutils\cygwinccompiler.py in _compile(self, obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts) 146 ) 147 except DistutilsExecError as msg: --> 148 raise CompileError(msg) 149 150 def link( CompileError: command 'C:\\Users\\○○○\\anaconda3\\Library\\mingw-w64\\bin\\gcc.exe' failed with exit code 1

meg_

2024/08/08 11:18 編集

> prophetをインストールし、動かそうとしたのですが、 > 「AttributeError: 'Prophet' object has no attribute 'stan_backend'」 > とエラーが出ました。エラーが発生したコードはどのようなものでしょうか？ pipで上手く行かない場合はcondaでインストールすると上手く行く場合もあるようです。

chem_search

2024/08/09 05:33

ありがとうございます。 conda/pipともに試してみたのですが、どちらも同じ状態でした。エラーが発生したコードは以下の通りです。 import pandas as pd from prophet import Prophet df = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/facebook/prophet/main/examples/example_wp_log_peyton_manning.csv') model = Prophet() model.fit(df)

meg_

2024/08/09 11:39 編集

Windows11、Python 3.11.4、prophet 1.1.5の組み合わせではドキュメントに沿って行ったpipでのインストールおよびQuickStartのm.fit(df)までのコード実行ではエラーは発生しませんでした。 Pythonは3.7でないといけないのでしょうか？そうでないなら組み合わせを変えてみてはどうでしょうか？

chem_search

2024/08/12 22:08

アドバイスありがとうございます。 ①仮想環境の作製（python=3.11.9) ②pipでのライブラリのインストール(prophet=1.1.5) を行って実行したところ、新たなエラー（AttributeError: `np.float_` was removed in the NumPy 2.0 release. Use `np.float64` instead.）がでたため、numpyをimportした後、 np.float_ = np.float64 を実行してからprophetをimportすることで、エラー無く実行することができました。 pythonやライブラリ間の依存関係が問題だったということでしょうか･･････。