PythonのPycaretをインポートできない件

Question

前提・実現したいこと

PythonでPycaretをインポートしたときにエラーが発生しました。
こちらの解決策をご存じの方いらっしゃいますでしょうか。

発生している問題・エラーメッセージ

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OSError                                   Traceback (most recent call last)
Input In [27], in <cell line: 1>()
----> 1 from pycaret.regression import *

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/pycaret/regression.py:10, in <module>
      7 import pandas as pd
      8 import numpy as np
---> 10 import pycaret.internal.tabular
     11 from pycaret.internal.Display import Display, is_in_colab, enable_colab
     12 from typing import List, Tuple, Any, Union, Optional, Dict

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/pycaret/internal/tabular.py:48, in <module>
     46 import pycaret.containers.models.clustering
     47 import pycaret.containers.models.anomaly
---> 48 import pycaret.internal.preprocess
     49 import pandas as pd
     50 import numpy as np

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/pycaret/internal/preprocess.py:34, in <module>
     32 from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier as rfc
     33 from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor as rfr
---> 34 from lightgbm import LGBMClassifier as lgbmc
     35 from lightgbm import LGBMRegressor as lgbmr
     36 import sys

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/lightgbm/__init__.py:8, in <module>
      2 """LightGBM, Light Gradient Boosting Machine.
      3 
      4 Contributors: https://github.com/microsoft/LightGBM/graphs/contributors.
      5 """
      6 from pathlib import Path
----> 8 from .basic import Booster, Dataset, Sequence, register_logger
      9 from .callback import early_stopping, log_evaluation, print_evaluation, record_evaluation, reset_parameter
     10 from .engine import CVBooster, cv, train

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/lightgbm/basic.py:110, in <module>
    106         raise LightGBMError(lib.LGBM_GetLastError().decode('utf-8'))
    107     return lib
--> 110 _LIB = _load_lib()
    113 NUMERIC_TYPES = (int, float, bool)
    116 def _safe_call(ret: int) -> None:

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/lightgbm/basic.py:101, in _load_lib()
     99 if len(lib_path) == 0:
    100     return None
--> 101 lib = ctypes.cdll.LoadLibrary(lib_path[0])
    102 lib.LGBM_GetLastError.restype = ctypes.c_char_p
    103 callback = ctypes.CFUNCTYPE(None, ctypes.c_char_p)

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/ctypes/__init__.py:460, in LibraryLoader.LoadLibrary(self, name)
    459 def LoadLibrary(self, name):
--> 460     return self._dlltype(name)

File ~/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/ctypes/__init__.py:382, in CDLL.__init__(self, name, mode, handle, use_errno, use_last_error, winmode)
    379 self._FuncPtr = _FuncPtr
    381 if handle is None:
--> 382     self._handle = _dlopen(self._name, mode)
    383 else:
    384     self._handle = handle

OSError: dlopen(/Users/k.hiroto/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/lightgbm/lib_lightgbm.so, 0x0006): Library not loaded: /usr/local/opt/libomp/lib/libomp.dylib
  Referenced from: /Users/k.hiroto/opt/anaconda3/envs/pycaret_1/lib/python3.9/site-packages/lightgbm/lib_lightgbm.so
  Reason: tried: '/usr/local/opt/libomp/lib/libomp.dylib' (no such file), '/usr/local/lib/libomp.dylib' (no such file), '/usr/lib/libomp.dylib' (no such file)

該当のソースコード

from pycaret.regression import *

試したこと

brew install libomp は行いました。

Comments

[jbpb0]

> '/usr/local/opt/libomp/lib/libomp.dylib' (no such file), '/usr/local/lib/libomp.dylib' (no such file), '/usr/lib/libomp.dylib' (no such file)

上記を探したけど、どれも見つからない、とのこと

> brew install libomp は行いました。

それでしたら、「libomp.dylib」というファイル名のファイルがどこかにインストールされてると思いますので、探してみてください
インストールされた場所と、「.../python3.9/site-packages/lightgbm/lib_lightgbm.so」が探してる場所が違ってるのではないですかね

[jbpb0]

brew install libomp

の後で、「lightgbm」をアンインストール→インストールで、直るかも
https://qiita.com/ryryry/items/917d3da1bf028ced1468

[hiroto_kkkk]

ありがとうございます！

lightgbmの再インストールはダメでした、、

「libomp.dylib」というファイルはありました！
このファイルを「.../python3.9/site-packages/lightgbm/lib_lightgbm.so」と同じディレクトリに入れれば良いのでしょうか？

[jbpb0]

> '/usr/local/opt/libomp/lib/libomp.dylib' (no such file), '/usr/local/lib/libomp.dylib' (no such file), '/usr/lib/libomp.dylib' (no such file)

の三箇所のどこかに置けば使われると思いますが、「/usr/lib」には置かない方がいいので、残りの二箇所のどちらかですね

[jbpb0]

technocoreさんの回答の内容で、解決しませんか？
解決したなら、technocoreさんの回答をベストアンサーにしましょう

Answer 1

homebrewではパッケージはCellar配下にインストールされます。
ライブラリの場合そのシンボリックリンクが/usr/local/lib配下に自動的に作られます（Intelの場合）

% ls -l /usr/local/lib/libomp*
lrwxr-xr-x owner admin /usr/local/lib/libomp.a@ -> ../Cellar/libomp/13.0.1/lib/libomp.a
lrwxr-xr-x owner admin /usr/local/lib/libomp.dylib@ -> ../Cellar/libomp/13.0.1/lib/libomp.dylib

もし無かった場合は手動でリンクを作成してください。
作業できたら、動作を確認してください。

% python -c 'import pycaret ; print(pycaret.__version__)'
2.3.6