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Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

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The beeswarm plot does not support plotting explanations ~への対処

kouji_39

総合スコア164

Python 3.x

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。

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投稿2022/07/03 05:17

1.前提・実現したいこと
shap値を視覚的に求めたい。
3.で示したコードで、エラーが発生します。対処方法をお願いします。

2.発生している問題・エラーメッセージ
3.のソースコード実行(最終行のコード)で下記のエラーメッセージが発生

ValueError:The beeswarm plot does not support plotting explanations with instances that have more than one dimension!

発生場所は、---> 12 shap.plots.beeswarm(shap_values)

3.該当のソースコード

python3

1# common 2import pandas as pd 3import numpy as np 4from pandas import DataFrame, Series 5import matplotlib.pyplot as plt 6import seaborn as sns 7from sklearn.model_selection import train_test_split, GridSearchCV 8from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier 9from sklearn.linear_model import LogisticRegression 10from sklearn.neural_network import MLPClassifier 11# モデリング: lightgbm 12import lightgbm as lgb 13 14#データ読み込み等は、省略 15 16#重要特徴量17項目 17feature_cols = ['eqpdays','months','mou_Mean','change_mou','totmrc_Mean','change_rev','hnd_price','avgqty','avgmou','avgrev','mou_cvce_Mean','rev_Mean','lor','uniqsubs','drop_vce_Mean','mouiwylisv_Mean','ovrrev_Mean'] 18target_col = ['churn'] 19 20#Numpyの配列に変換 21y = np.array(df[target_col])#ターゲット変数 22X = np.array(df[feature_cols])#説明変数 23 24x_tr, x_va1, y_tr, y_va1 = train_test_split(X, 25 y, 26 test_size=0.2, 27 shuffle=True, 28 stratify=y, 29 random_state=123) 30print(x_tr.shape, y_tr.shape)#(80000, 17) (80000, 1) 31print(x_va1.shape, y_va1.shape)#(20000, 17) (20000, 1) 32 33#モデル学習(ホールドアウト検証) 34params = { 35 'boosting_type': 'gbdt', 36 'objective': 'binary', 37 'metric': 'auc', 38 'learning_rate': 0.1, 39 'num_leaves': 16, 40 'n_estimators': 100000, 41 "random_state": 123, 42 "importance_type": "gain", 43} 44model = lgb.LGBMClassifier(**params) 45model.fit(x_tr, 46 y_tr, 47 eval_set=[(x_tr,y_tr), (x_va1,y_va1)], 48 early_stopping_rounds=100, 49 verbose=10, 50 ) 51 52# ライブラリのインポート 53!pip install shap 54import shap 55# explain the model's predictions using SHAP 56# (same syntax works for LightGBM, CatBoost, scikit-learn, transformers, Spark, etc.) 57# 1. モデル shap.Explainer()に渡す 58explainer = shap.Explainer(model, feature_names=feature_cols) 59# 2. 説明変数(特徴量)を渡す 60shap_values = explainer(X)#X:説明変数 61 62# summarize the effects of all the features 63shap.plots.beeswarm(shap_values)

4.自分で調べたことや試したこと
Google検索では、有用な情報なし。

5.使っているツールのバージョンなど補足情報
開発環境:Google Colaboratory
プログラム言語:python3
OS:windows10 Home
CPU:Intel(R) Core(TM) i7-7500U CPU@2.70GHz 2.90GHz

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can110

2022/07/03 05:32

エラーメッセージの意味(原因)は理解されているでしょうか? また、理解されているとして、beeswarm関数に渡している引数が、妥当であるかどうかは判断できているでしょうか? そのあたりの詳細を記載すると回答得られやすくなるかと思います。
meg_

2022/07/03 05:32

「Google検索では、有用な情報なし。」とのことですが、どのような検索ワードで調べられたのでしょうか? 1件もヒットする情報がなかったのでしょうか?
kouji_39

2022/07/03 09:36

エラーに関する翻訳は、「ValueError:beeswarmプロットは、複数の次元を持つインスタンスでの説明のプロットをサポートしていません!」とあります。「複数の次元を持つインスタンス」とは、何のことでしょう?
kouji_39

2022/07/03 14:56

解決の方向性を、自己解決欄に記入しました。
guest

回答1

0

自己解決

以下の対処方法でいけそうです。お二方のご助言ありがとうございました。
1) shap.Explainerを、shap.TreeExplainerに変更
2) shap.plots.beeswarmを、shap.summary_plotに変更

投稿2022/07/03 14:55

kouji_39

総合スコア164

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