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Python

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Q&A

1回答

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Pythonでの階層クラスター分析をCSV上の日本語ラベルを用いて出力したい

kanamu

総合スコア4

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2023/01/05 13:13

CSVファイルのデータをpythonで階層クラスター分析を行い、図化したいです。

ネットで漁った結果、下記URLの記事が最もやりたいことに近いです。

https://corvus-window.com/python_hierarchal-clustering/

pythonでこの方の分析は再現することができたのですが、デンドログラム内の数字(ラベル名)を日本語で表記したいです。

また、ラベル名はCSVファイル上で日本語で表記された状態で取り込みたいです。
(こちらの記事では列にラベルがないが、左端に日本語のラベルがある状態で取り込み、それをデンドログラムのラベルにしたい)

デンドログラム上のラベルをpython及びCSVファイルを用い、日本語で表記する方法が分からず困っています。
よろしくお願いいたします。

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回答1

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scipy.cluster.hierarchy.dendrogramにてlabelsでラベル指定できます。
さらに以下ではラベルが重ならないようにleaf_rotationで傾けています。

Python

1import pandas as pd 2import matplotlib.pyplot as plt 3from scipy.cluster.hierarchy import linkage, dendrogram 4from scipy.spatial.distance import squareform, pdist 5import random 6 7# テストデータ 8random.seed(110) 9N = 20 10df = pd.DataFrame({ 11 'name':[f'Name{i}' for i in range(N)], 12 'v1':[random.randint(1,10) for _ in range(N)], 13 'v2':[random.randint(1,10) for _ in range(N)] 14 }) 15print(df) 16 17data = df.iloc[:,1:] 18data = squareform(pdist(data)) 19clu = linkage(data, method='ward', metric='euclidean') 20 21fig, ax = plt.subplots() 22dendrogram(clu, labels=df['name'].values, leaf_rotation=80) 23fig.tight_layout() 24plt.show()

イメージ説明

投稿2023/01/06 06:44

can110

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