16bitの画像rawデータをtifに変換したい

pythonで16bitリトルエンディアンのrawデータを読み込み、tiffファイルに変換したいのですがうまくいきません。
画像は出力されますが、正常な画像になっていません。（rawと違う。何が写っているかわからない）
また、データの容量がrawの2倍になっています。
以下のコードでおかしなところがあれば教えてください。
また、rawデータをtifに変換する別の方法があれば教えていただけないでしょうか。

追記
尚、rawデータはイメージセンサーの出力データそのものをバイナリで保存したものです。
（このrawデータは正しく保存されていることは、rawを表示するソフトで確認済み）
1画素＝16bitのリトルエンディアンで、符号はなしの整数です。

コードは以下です。 python
コード
Imagesize=[2592,1922]
with open(filename +".raw","rb") as f: #2byteのrawデータファイル
data=f.read()
img = Image.frombytes('F', Imagesize, data,"raw", 'F;16B')
img.save("test.tif")

can110

2021/12/25 03:59

コードブロックが正常に表示されていないので修正ください（最後の```が抜けている？）また、具体的に何がどううまくいっていないのかを記載ください。（エラーが発生する、意図した画像になっていないなど）

hasy

2021/12/25 06:18

ご指摘ありがとうございます。初学者のためいろいろ不備がありすいません。修正しました。よろしくお願いします。

can110

2021/12/25 06:34

元のバイナリ(raw)データについての情報をより詳細に記載すると回答得られやすくなるかと思います。たとえば、そのデータはどのような手段（他ソフト、コード）で作成されたのか。１画素＝16bitリトルエンディアンだとして、それは符号付or無の整数あるいは浮動or固定小数点値と扱うべきなのかなど。

y_waiwai

2021/12/25 06:37

エラーが出たなら、エラーメッセージを提示しましょうエラーメッセージは、いらぬ翻訳省略しないで、出たそのママをコピペで提示してください

hasy

2021/12/25 06:57

いろいろご教授ありがとうござます。 rawデータはイメージセンサーの出力データそのものをバイナリで保存したものです。（このrawデータは正しく保存されていることは、rawを表示するソフトで確認済み） 1画素＝16bitのリトルエンディアンで、符号はなしの整数です。また、現状はエラーなしでtifは保存されていますが、画像が正常でありません。（rawと違う。何が写っているかわからない）あと、保存されたtifデータの容量がrawの2倍になっているのも疑問です。また、リトルエンディアンなら 'F;16B'の部分が 'F;16L'ではないかというご指摘をいただきましたが、ご指摘の通り修正すると以下のエラーがでます。 ValueError: unknown raw mode

melian

2021/12/25 07:27

「リトルエンディアンで符号はなしの整数」であれば I;16L ではないでしょうか。

hasy

2021/12/25 07:43

ありがとうございます。 I;16Lをためしましたが、F;16Lのときと変わらず、下記エラーがでます。 ValueError: unknown raw mode

melian

2021/12/25 07:51

今気がついたのですが、 img = Image.frombytes('I;16L', Imagesize, data, "raw") としていますか？(mode は第一パラメータで指定)

hasy

2021/12/25 08:05

ありがとうございます。ご指摘のとおり修正したところエラーが変わりました。このrawデータはtiff保存ができない？？？ OSError: cannot write mode I;16L as TIFF また、こういう引数の順番や書き方などはどこで調べることができるのでしょうか。

melian

2021/12/25 08:13

参考までに。 ** PIL.Image.frombytes(mode, size, data, decoder_name='raw', *args) https://pillow.readthedocs.io/en/stable/reference/Image.html#PIL.Image.frombytes ** Image modes https://pillow.readthedocs.io/en/stable/handbook/concepts.html#modes

hasy

2021/12/25 08:24

ありがとうございます。大変参考になります。

行動規範の内容に同意します

回答1件

ベストアンサー

ぱっと見て気になるのは、'F;16B'です。
~~16bitリトルエンディアンなら'F;16L'でしょう。~~
16bitリトルエンディアンなら'I;16L'でしょう。(melianさんのご指摘のとおり)
16bitリトルエンディアンということは、モノクロで16ビットの画像ですがそれであっていますか。

PIL.Image.frombytes(mode, size, data, decoder_name='raw', *args)

Modes
を読み直してみましたが、「16bitリトルエンディアンのモノクロで16ビットのrawデータ」ならば

img = Image.frombytes('I;16L', Imagesize, data,"raw")

で変換できるはずです。

OSError: cannot write mode I;16L as TIFF
とのことですね。なんとなくそうなりそうな気がしてPILでuint16の画像をTIFFでsaveできるかを調べてみたのですが、見つからなかったので前回の回答をしました。

cv2でuint16の画像をTIFF形式で保存したものを画像処理ソフトで開いてみたところ、Grayの16ビット画像として開くことができました。

したがって、PILのuint16の画像をdtypeがnp.uint16のndarrayに変換できれば保存できるはずです。

python
1Imagesize=[2592,1922]
2with open(filename +".raw","rb") as f: #2byteのrawデータファイル
3    data=f.read()
4img = Image.frombytes('I;16L', Imagesize, data,"raw")
5img_ndarray = np.array(img, dtype=np.uint16)
6cv2.imwrite('test.tiff', img_ndarray)

投稿2021/12/25 04:55

編集2021/12/25 11:07

ppaul

総合スコア24666

hasy

2021/12/25 06:16

ご回答ありがとうございます。ご指摘のF;16BをF;16Lに変更しましたが、エラーがでて出力もされなくなりました。 ValueError: unknown raw mode 初学者なのでいろいろ不備がありますが、ご教授お願いします。

hasy

2021/12/25 08:20

ご回答ありがとうございます。データは、ご指摘のとおり「16bitリトルエンディアンのモノクロで16ビットのrawデータ」です。修正することで現在のエラーは、最終行の「img.save("test.tif")」に進みました。 OSError: cannot write mode I;16L as TIFF というエラーがでているのですが、tiffにはできないということなのでしょうか？