npyから、pngに変換する方法がわかりかねます。

前提・実現したいこと

1,
こちらを参考にさせていただきました。
そして、

2
こちらを検討したのですが、文字などのはなしになって、内容が異なる印象でした。

npyの中身です。
shapeは、エラーが帰ってきました。

npyでも、特別なものは存在するのでしょうか？　

発生している問題・エラーメッセージ


---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-28-e50bfa95f0d9> in <module>()
      1 
----> 2 im = Image.fromarray((f_1 * 255).astype(np.uint8))

TypeError: unsupported operand type(s) for *: 'dict' and 'int'

該当のソースコード




import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from PIL import image
f_1=np.load('/content/drive/MyDrive/神様/sartorius-inserted/train_masks_npz/0030fd0e6378_seg.npy', allow_pickle=True)


f_1 = Image.fromarray((f_1 * 255).astype(np.uint8)) #１で変更
plt.imshow(f_1)





#こちらでnpyを作成


imgs_2D = imgs[:-1]

from cellpose import models
model = models.Cellpose(gpu=use_GPU, model_type='cyto')

masks, flows, styles, diams = model.eval(imgs_2D, diameter=None, flow_threshold=None, channels=channels)
from cellpose import io

io.masks_flows_to_seg(imgs_2D, masks, flows, diams, files, channels)

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

ここにより詳細な情報を記載してください。

Python3 (3.9)
macbookpro 16

1,
写真

２，

melian

2021/12/24 01:32

こちらの質問「npzから、pngに直したい次第です。(編集済み)」 https://teratail.com/questions/374640 と同じ内容ではないでしょうか？(解決方法も同じかと思います)。

Deep_passion

2021/12/24 01:33

お世話になっております。 npyでございます。

Deep_passion

2021/12/24 01:34

それとですね、cellposeを使用しております。

melian

2021/12/24 01:37

npz と npy は内部構造は同じで、おそらく今回も複数の画像が一つに束ねられているのだと思います（エラーメッセージに dict と表示されています）。

Deep_passion

2021/12/24 01:39

https://cellpose.readthedocs.io/en/latest/outputs.html こちらから、numpy配列を取得していけばよろしいのでしょうか？

Deep_passion

2021/12/24 01:41

どのようにすれば、良いのかわかりかねます。

melian

2021/12/24 01:42

まずは、np_load の直後で辞書のキーを表示させてみて下さい。 f_1=np.load(...) print(f_1.keys())

Deep_passion

2021/12/24 01:48

--------------------------------------------------------------------------- AttributeError Traceback (most recent call last) <ipython-input-36-cd607ae510a5> in <module>() ----> 1 print(f_1.keys()) AttributeError: 'numpy.ndarray' object has no attribute 'keys'

melian

2021/12/24 01:52

print 文をコメントアウトして（元の状態に戻して）実行すると、同じエラーメッセージ TypeError: unsupported operand type(s) for *: 'dict' and 'int' が表示されますか？

Deep_passion

2021/12/24 01:56

すいません、よく理解できていません。このようになります。

melian

2021/12/24 02:07

ndarray の中に辞書がある様な感じですかね。もしかしたら、 print(f_1.item().keys()) とすればキーが表示されるかもしれません。

Deep_passion

2021/12/24 02:08

dict_keys(['img', 'outlines', 'masks', 'chan_choose', 'ismanual', 'filename', 'flows', 'est_diam'])