SVG形式でモデルを表示できません

Question

私は今CNNの勉強しています。(いちばんやさしいディープラーニングという本で勉強しています。)
その中で、Keras の Conv2D を使用した CNN の例を実行しようとしました。
プログラムは以下の通りです。

# coding: utf-8
# Conv2D を使った CNN の例

# CNN Model 1 - one layer
# Keras とその他ライブラリをインポート
from keras.models import Sequential, Model
from keras.layers import Conv2D
from keras.utils import np_utils

# SVG の表示に必要なライブラリのインポート
from IPython.display import SVG
from keras.utils.vis_utils import model_to_dot

# 畳み込みニューラルネットのモデルを作成
model = Sequential()
model.add(Conv2D(filters=3, kernel_size=(3, 3), input_shape=(6, 6, 1), name='Conv2D_1'))

# SVG形式でモデルを表示
SVG(model_to_dot(model, show_shapes=True).create(prog='dot', format='svg'))

エラーが以下の通りです。

ImportError                               Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-53d8384b4a2b> in <module>()
     18 
     19 # SVG形式でモデルを表示
---> 20 SVG(model_to_dot(model, show_shapes=True).create(prog='dot', format='svg'))

~/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/lib/python3.7/site-packages/keras/utils/vis_utils.py in model_to_dot(model, show_shapes, show_layer_names, rankdir, expand_nested, dpi, subgraph)
     77     from ..models import Sequential
     78 
---> 79     _check_pydot()
     80     if subgraph:
     81         dot = pydot.Cluster(style='dashed', graph_name=model.name)

~/.pyenv/versions/anaconda3-5.3.1/lib/python3.7/site-packages/keras/utils/vis_utils.py in _check_pydot()
     20     if pydot is None:
     21         raise ImportError(
---> 22             'Failed to import `pydot`. '
     23             'Please install `pydot`. '
     24             'For example with `pip install pydot`.')

ImportError: Failed to import `pydot`. Please install `pydot`. For example with `pip install pydot`.

ImportError: Failed to import pydot. Please install pydot. For example with pip install pydot.
ここをコピペして検索した結果kerasのplot_modelでハマった話このサイトに

pydotは現在開発が止まっており、python3.5および3.6では動きません。
pydotplusまたはpydot-ngを代わりに使用することで対処できます。

とあったので、pydotplusを[python] Macにpygraphvizをインストールするこのサイトを参考にインストールしました。
しかし、エラーが消えません。
どうすればいいのか教えてください。

Comments

[jbpb0]

> インストールしました。
しかし、エラーが消えません。

その時のエラーは、質問に書いてるエラーと全く同じものですか？
pydotplusをインストールして、表示されるエラーメッセージが変わったなら、質問にはそちらを書いてください

[退会済みユーザー]

インストール前のエラーを完璧に覚えている訳では無いのですが、全く同じものでした。
# SVG形式でモデルを表示
SVG(model_to_dot(model, show_shapes=True).create(prog='dot', format='svg'))
この文より前のプログラムまではエラー出さないことも確認しました。
何がいけないのでしょうか？

Answer 1

pydotは現在開発が止まっており、python3.5および3.6では動きません。

pydotplusまたはpydot-ngを代わりに使用することで対処できます。

ImportError: Failed to import pydot. Please install pydot. For example with pip install pydot. #69
を見ると、下記の順番でインストールするとエラーが出なくなるようです
・pydot
・pydotplus
・graphviz

Comments

[退会済みユーザー]

試してみたのですが、このようなエラーが出るのですがどうしたらいいですか？
---------------------------------------------------------------------------
NameError Traceback (most recent call last)
/var/folders/72/fl6l29ds4xvbv0zcgdzj4wc00000gn/T/ipykernel_55902/4281578741.py in <module>
1 # SVG形式でモデルを表示
----> 2 SVG(model_to_dot(model, show_shapes=True).create(prog='dot', format='svg'))

NameError: name 'SVG' is not defined

[jbpb0]

> from IPython.display import SVG

を実行してれば、

> name 'SVG' is not defined

とはならないはず

上記の二つの行がjupyter notebookで別のセルに分かれていて、
from IPython...
がある方のセルの実行を忘れているのでは？

[jbpb0]

当方のMacで試してみました

「pydotplus」と「graphviz」はインストールされてるけど「pydot」はインストールされてない状態では、質問のコードをそのままjupyter notebookで実行したら、質問と同じエラー
Failed to import `pydot`...
が出ました

そこで「pydot」もインストールしたら、jupyter notebookで表示できました

ただし、表示されるのが大きすぎるので、
https://qiita.com/ReoNagai/items/b8436a4299bb70941fb7
に書かれてるように「dpi=None」を付けたら、ちょうどいいサイズになりました

[退会済みユーザー]

本当にいつもありがとうございます。
今回もおかげさまでできました。

今回慌ててしまい色々なものをアップデートし、順番にインストールするために消したら、過去のプログラムまでエラーが出てしまいつらかったので助かりました。