pip install pycddlibが実行できない。

Question

前提・実現したいこと

dockerを用いて数理最適化のコードを書くための環境を作ろうと思っています。
ですがdockerを勉強中で分かっていないことが多いため、自力で解決できず困っています。
主なエラーとしてはpycddlibというパッケージのインストールができません。

発生している問題・エラーメッセージ

 ERROR: Failed building wheel for pycddlib
  Running setup.py clean for pycddlib
Failed to build pycddlib
Installing collected packages: pycddlib
    Running setup.py install for pycddlib ... error

該当のソースコード

FROM ubuntu:latest
RUN apt-get update  && apt-get install -y \
	sudo \
	wget \
	vim
WORKDIR /opt
RUN wget "https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh" && \

sh /opt/Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh -b -p /opt/anaconda3 && \

rm -f Anaconda3-2020.07-Linux-x86_64.sh

ENV PATH /opt/anaconda3/bin:$PATH

RUN pip install --upgrade pip
RUN pip install pulp \
	pycddlib \
	vpython \
	picos
RUN conda install cvxopt
WORKDIR /
CMD ["jupyter", "lab", "--ip=0.0.0.0", "--allow-root", "--LabApp.token=''"]

試したこと

エラーメッセージはdocker exec -it <image> bashでコンテナに入って、pip install pycddlibを実行した際に表示されたものです。エラーメッセージが長く、どの部分をコピペすればよいのかわからなかったので何か情報が足りない場合は教えていただけると助かります。
pycddlibを除いた場合、docker runは通りました。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

Windows10

Comments

[etherbeg]

pycddlibの公式ドキュメントでインストールについてのページをみると、
"On Linux, this will install from source, and you will need GMP. Your distribution probably has a pre-built package for it. "
とあります。ubuntuでのGMPのインストール方法を調べるのが先でしょう。この点について私はアドバイスできませんので、こちらに記入させていただきました。
https://pycddlib.readthedocs.io/en/latest/quickstart.html#installation

なお、Anacondaを使用する際はpipは極力使用せず、condaコマンドを使ってパッケージのインストール及び仮想環境の構築を行うべきです。以下のページを参照してください。
https://www.python.jp/install/anaconda/pip_and_conda.html
https://www.python.jp/install/anaconda/conda_and_venv.html

pycddlib以外はcondaパッケージが存在しますので、condaコマンドを使ってインストールできます。インストールの際のコマンドはパッケージの公式ドキュメント、もしくは以下でパッケージ名で検索して確認してください。
https://anaconda.org/

Answer 1

エラー error: command 'gcc' failed with exit status 1 の回避方法

Dockerfile の RUN php install pycddlib よりも前に gcc と libgmp3-dev パッケージをセットアップする命令を書くと、 docker build が通ります。

RUN apt-get install -y libgmp3-dev gcc

調べ方

biuld 時のログやエラーが長くても、多くの場合は問題解決のヒントになります。

今回の場合、そのまま Dockerfile をビルドしますと、gcc というコマンドがない、というエラーが確認できます。

'gcc': No such file or directory
    error: command 'gcc' failed with exit status 1

そのため、 RUN apt-get install -y gcc を Dockerfile に追加して様子をみます。

再度 docker build を実行しますと、今度は次のエラーが出ます。

  cddlib/lib-src/cddmp.h:30:11: fatal error: gmp.h: No such file or directory
     30 |  #include "gmp.h"
        |           ^~~~~~~

Ubuntu は libgmp3-dev パッケージに GMP の gmp.h が含まれています。
これをインストールするには

RUN apt-get install -y libgmp3-dev

が必要と分かります。