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NumPy

NumPyはPythonのプログラミング言語の科学的と数学的なコンピューティングに関する拡張モジュールです。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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コンマ区切りの数値をスペースでグループ分けしたテキストファイルをNumpy arrayに変換したい

t-taro

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投稿2021/02/16 07:07

編集2021/02/16 07:17

Python初心者です.

コンマ区切りの数値をスペース区切りでグループ分けしたテキストファイルを, 以下のようなNumpy arrayに変換したく思い, 試行錯誤しています.

sh

1$ cat test.txt 21,2,3 4,5,6 311,22,33 44,55,66

python

1>>> np.array([[[1,2,3],[4,5,6]],[[11,22,33],[44,55,66]]]) 2array([[[ 1, 2, 3], 3 [ 4, 5, 6]], 4 5 [[11, 22, 33], 6 [44, 55, 66]]]) 7>>> np.array([[[1,2,3],[4,5,6]],[[11,22,33],[44,55,66]]]).shape 8(2, 2, 3)

NumPyのgenfromtxtを試してみたのですが, コンマ区切りとスペース区切りをうまく分けることはできませんでした.
(どちらもnanが出てしまい, そもそもテキストファイルの形式を保つこともできませんでした…)

python

1>>> np.genfromtxt("test.txt", delimiter=",") 2array([[ 1., 2., nan, 5., 6.], 3 [11., 22., nan, 55., 66.]]) 4 5>>> np.genfromtxt("test.txt", delimiter=" ") 6array([[nan, nan], 7 [nan, nan]])

ご助言いただけますと幸いです. どうぞ宜しくお願いいたします.

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回答3

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元ファイルの空白をいったん改行に置き換える書き方は、
上のjeanbiegoさんの投稿のスクリプトを使わせていただきました。

1、元のファイルを読み込み、
2、求める配列に変換してから、
3、json形式で別ファイルへ書き込み、
4、それを読み込んで確認する

という手順を書いてみました。

jsonシリアライズのために、こちらを参考にクラスを再定義しています。

解决:TypeError: Object of type xxx is not JSON serializable - 简书
日付型のエラーは確認してませんが、こちらが参考になりそうです。
[Python] dateやdatetimeをjson.dumpでエラーなく出力する - YoheiM .NET

ご参考になれば幸いです。

python

1#!/usr/bin/env python3 2#-*- coding: utf-8 -*-↲ 3 4import io 5import numpy as np 6import json 7import time 8 9#json encoder 10class MyEncoder(json.JSONEncoder): 11 def default(self, obj): 12 if isinstance(obj, np.integer): 13 return int(obj) 14 elif isinstance(obj, np.floating): 15 return float(obj) 16 elif isinstance(obj, np.ndarray): 17 return obj.tolist() 18 elif isinstance(obj, time): 19 return obj.__str__() 20 else: 21 return super(NpEncoder, self).default(obj) 22 23# intを前提 24# input test.txt 25# output out.json 26 27with open('test.txt') as f: 28 data = f.read().replace(" ","\n") 29 a = np.loadtxt(io.StringIO(data), delimiter=',', dtype=int) 30 31# 配列を求める形に整える 32# ここで欲しい形式に整えます。 33# 2*2*3=12通りのデータとしています。 34a = a.reshape([2,2,3]) 35print(a) 36 37#json形式で保存 38#write json 39with open('out.json', 'tw') as out: 40 json.dump(a, out, cls=MyEncoder) 41 42#書き出したファイルをテストで読み込み 43#load json 44with open('out.json','tr') as inp: 45 b = np.array(json.load(inp)) 46 47#読み込み元と、書き込み先が一致しているか目視する 48print(b) 49

投稿2021/02/16 10:01

phoepsilonix

総合スコア233

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ベストアンサー

長く書くとこうです。

python

1>>> import numpy as np 2>>> with open('test.txt', 'r') as f: 3... s3 = f.read() 4... 5>>> x3 = [] 6>>> for s2 in s3.strip().split('\n'): 7... x2 = [] 8... for s1 in s2.split(' '): 9... x1 = [] 10... for x in s1.split(','): 11... x1.append(int(x)) 12... x2.append(x1) 13... x3.append(x2) 14... 15>>> a = np.array(x3) 16>>> a 17array([[[ 1, 2, 3], 18 [ 4, 5, 6]], 19 20 [[11, 22, 33], 21 [44, 55, 66]]])

短く書くとこうです。

python

1>>> import numpy as np 2>>> with open('test.txt', 'r') as f: 3... s3 = f.read() 4... 5>>> a = np.array([[[int(x) for x in s1.split(',')] for s1 in s2.split(' ')] for s2 in s3.strip().split('\n')]) 6>>> a 7array([[[ 1, 2, 3], 8 [ 4, 5, 6]], 9 10 [[11, 22, 33], 11 [44, 55, 66]]])

投稿2021/02/16 07:58

ppaul

総合スコア24670

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変なファイルなんですね。
とりあえず、一回空白を改行に置き換えてから、numpy配列として読み込み直してみました。

python3

1import numpy as np 2import io 3with open('test.txt') as f: 4 data = f.read().replace(" ","\n") 5 print(data) 6 # 1,2,3 7 # 4,5,6 8 # 11,22,33 9 # 44,55,66 10 11 a = np.loadtxt(io.StringIO(data), delimiter=',', dtype=int) 12 print(a) 13 # [[ 1 2 3] 14 # [ 4 5 6] 15 # [11 22 33] 16 # [44 55 66]]

投稿2021/02/16 07:32

jeanbiego

総合スコア3966

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