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bash

bash(Bourne-again-Shell)は sh(Bourne Shell)のインプリメンテーションに様々な機能が追加されたシェルです。LinuxやMac OS XではBashはデフォルトで導入されています。

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sortコマンドでフィールドの中の一部をNumericに並べ替える方法

candycorn

総合スコア9

bash

bash(Bourne-again-Shell)は sh(Bourne Shell)のインプリメンテーションに様々な機能が追加されたシェルです。LinuxやMac OS XではBashはデフォルトで導入されています。

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投稿2021/02/11 10:32

編集2021/02/11 10:34

###質問
以下のようなデータ(test.txt)がある時、第2フィールドのhsa:以降をnumericに並べ変えたいのですが、上手くいきません。

shell

1$ cat test.txt 2path:hsa00120 hsa:1 3path:hsa00564 hsa:10 4path:hsa00564 hsa:100 5path:hsa00600 hsa:1000 6path:hsa00600 hsa:10000 7path:hsa00590 hsa:100000 8path:hsa00071 hsa:120 9path:hsa00561 hsa:1500 10path:hsa00072 hsa:99999 11path:hsa00565 hsa:2021

###試したこと
以下のコマンドを試しましたが、-n、-k、-tオプションなどの順番を入れ替えても結果は変わりませんでした。
また、-kを2.4,2のようにしてsortの開始位置を直接指定してみましたが、同様の結果となりました。

shell

1$ sort -n -t "\t" -k 2,2 test.txt 2path:hsa00071 hsa:120 3path:hsa00072 hsa:99999 4path:hsa00120 hsa:1 5path:hsa00561 hsa:1500 6path:hsa00564 hsa:10 7path:hsa00564 hsa:100 8path:hsa00565 hsa:2021 9path:hsa00590 hsa:100000 10path:hsa00600 hsa:1000 11path:hsa00600 hsa:10000

環境は、MacOS Darwin Kernel Version 20.2.0、bash5.0です。よろしくお願いいたします。

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回答2

0

フィールドバイト位置を使うなら、

sh

1sort -k 2.5nb

です。
何故bオプションが必要なのかman sortからは分からないのですが。

投稿2021/02/11 13:12

otn

総合スコア85886

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ベストアンサー

若干憶測が入りますが、以下のような結果をお求めでしょうか?

bash

1$ sort -n -t : -k 3 test.txt 2path:hsa00120 hsa:1 3path:hsa00564 hsa:10 4path:hsa00564 hsa:100 5path:hsa00071 hsa:120 6path:hsa00600 hsa:1000 7path:hsa00561 hsa:1500 8path:hsa00565 hsa:2021 9path:hsa00600 hsa:10000 10path:hsa00072 hsa:99999 11path:hsa00590 hsa:100000

考え方としては、numericに並べ変えたいのであれば、数字列を区切る必要があり、 -t に指定するセパレータは、タブではなく ':'(コロン)になるのではということです。

投稿2021/02/11 10:57

kozuchi

総合スコア1193

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candycorn

2021/02/11 11:30 編集

ありがとうございます!このような結果を求めていました。 コロンで区切るのは調べても見つからなかったので助かりました。
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