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シェルスクリプト

シェルスクリプトは、UNIX系のOSもしくはコマンドラインインタプリタ向けに記述されたスクリプト。bash/zshといったシェルによって実行されるため、このように呼ばれています。バッチ処理などに使用されており、テキストファイルに書かれた命令を順に実行します。

JOIN

これはSQL文のJOINに関するタグです。リレーショナルデータベースシステムの二つ以上のテーブルを結合する際に、この構文が利用されます。

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1回答

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【Unix】joinコマンドが使えない

candycorn

総合スコア9

シェルスクリプト

シェルスクリプトは、UNIX系のOSもしくはコマンドラインインタプリタ向けに記述されたスクリプト。bash/zshといったシェルによって実行されるため、このように呼ばれています。バッチ処理などに使用されており、テキストファイルに書かれた命令を順に実行します。

JOIN

これはSQL文のJOINに関するタグです。リレーショナルデータベースシステムの二つ以上のテーブルを結合する際に、この構文が利用されます。

0グッド

1クリップ

投稿2020/11/13 07:09

編集2020/11/13 07:14

###背景
Bash5.0でシェルスクリプトを利用しています。
joinコマンドで2つのcsvファイルを結合したいと考えているのですが、どうも上手く行きません。使用しているファイルは以下のような形式で、test1の2列目とtest2の1列目を結合したいです。

$cat test1.csv 123456,ABC $cat test2.csv ABC,ABC,987654321,2468,369,14916,12357

###問題
以下のコマンドでは何も出力されませんでした。(エラーメッセージも無し)
オプションを色々変えてみても同様でした。

$join -t, -1 2 -2 1 test1.csv test2.csv

また、最終的にはデータを外部結合したいと考えているため以下のようなコマンドを試したところ、ファイルは結合されずそのまま順番に出力されました。

$join -t, -a 1 -a 2 -1 2 -2 1 test1.csv test2.csv ABC,ABC,987654321,2468,369,14916,12357 123456,ABC

###質問

  1. コマンド自体は色々調べて理解しているつもりなのですが、なぜ動かないのでしょうか。環境の問題かとも思いましたが、エラーメッセージも出ないので原因が分かりません。
  2. また、既にソートされている複数行のデータで試したところ、「ソートされていません」という旨のエラーが出るのですが、それは何故か。

以上の2点についてお伺いしたいです。よろしくお願いいたします。

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hidezzz

2020/11/13 07:28

手元の環境(Linux Mint 19.3にはいっているcoreutilsのjoin)では、表示されていないと書かれているコマンドを実行して出力されました。 $ join -t, -1 2 -2 1 test1.csv test2.csv ABC,123456,ABC,987654321,2468,369,14916,12357 環境は何をお使いですか?
candycorn

2020/11/13 08:11

Darwin Kernel Version 19.6.0、Homebrew 2.3.0を使用しています。(初心者のため、回答が的外れでしたらご指摘ください)
hidezzz

2020/11/13 11:34

Macですよね?Macはあまり詳しくないのですが、 MacにプリインストールされているBSD由来のjoinの挙動かもしれないので、coreutilsを追加インストールしてそちらに含まれるjoinを使うと良いかもしれません。(その場合コマンド名はgjoinという名前になっているかもしれません。)
candycorn

2020/11/14 05:54

おっしゃる通り、gjoinの方で無事動きました。ご回答いただき、ありがとうございました。
guest

回答1

0

ベストアンサー

以下のコマンドでは何も出力されませんでした。(エラーメッセージも無し)
以下のようなコマンドを試したところ、ファイルは結合されずそのまま順番に出力されました。

マッチする結合キーが無かった場合の正常結果です。

改行コードがCRLFになっているのでは?
その場合、test1.csvの第2フィールドはABC\rなのでABCとマッチしません。

既にソートされている複数行のデータで試したところ、「ソートされていません」

結合するフィールド以外のキーでソートしたのでしょう。

投稿2020/11/13 07:22

otn

総合スコア85901

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candycorn

2020/11/13 08:14

分かりやすいご回答ありがとうございます。お恥ずかしながら、CRLFに関してはじめて聞きました、詳しく調べてみます。となりますと、csvファイルの改行コードを変更することで改善される可能性があるということでしょうか。(後ほど試してみます)
otn

2020/11/13 09:00

そうですね。Windowsのエディタで作成するとデフォルトだと改行コードが CRLF (= \r\n) になります。 Linux系ツールは改行コードが LF (= \n)でないと使えないツールが多いです。 プログラミング向けのエディタだと、改行コード LF で保存を選択出来るものがほとんどだと思います。
candycorn

2020/11/13 11:33

改行コードの変更で問題は解決しました!実際のデータでも試してみたところ、求めていた結果を得ることができました。本当にありがとうございます。 >Linux系ツールは改行コードが LF (= \n)でないと使えないツールが多いです こちらに関しても大変参考になりました。
guest

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