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pythonで””で囲まれているデータが記述されているtxtファイルを読み込みたい

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前提・実現したいこと

python3で

"2018/ 9/29 19:27:28","01","123456789B","00","0B","1235","362F","10E2","223E"," 000","80","00"," 000"," 000"," 000"," 000"," 000"
"2018/ 9/29 19:27:28","02","123456789A","00","0A","1234","362E","10E1","223D"," 000","80","00"," 000"," 000"," 000"," 000"," 000"
"2018/ 9/29 19:27:28","03","123456789B","00","0B","1235","362F","10E2","223E"," 000","80","00"," 000"," 000"," 000"," 000"," 000"

と書かれているようなtxtファイルを読み込みんで "0B"や"0A"の後ろ4列だけを抽出したいのですが
下記のようなエラーメッセージが出ます。
過去に数字だけが書かれているtxtファイルは読み込んだことがあるのですが、”や/が使われているデータは読んだことがありません。
どなたかご教授いただければ幸いです。

発生している問題・エラーメッセージ

UnicodeDecodeError                        Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-146f274a0966> in <module>
      1 import numpy as np
      2 
----> 3 xp, xm, yp, ym = np.genfromtxt("pppet.txt",skip_header=1,usecols=[7,8,9,10], delimiter=",",unpack=True)
      4 print(xp,xm,yp,ym)

~/opt/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/numpy/lib/npyio.py in genfromtxt(fname, dtype, comments, delimiter, skip_header, skip_footer, converters, missing_values, filling_values, usecols, names, excludelist, deletechars, replace_space, autostrip, case_sensitive, defaultfmt, unpack, usemask, loose, invalid_raise, max_rows, encoding)
   1792         try:
   1793             for i in range(skip_header):
-> 1794                 next(fhd)
   1795 
   1796             # Keep on until we find the first valid values

~/opt/anaconda3/lib/python3.7/codecs.py in decode(self, input, final)
    320         # decode input (taking the buffer into account)
    321         data = self.buffer + input
--> 322         (result, consumed) = self._buffer_decode(data, self.errors, final)
    323         # keep undecoded input until the next call
    324         self.buffer = data[consumed:]

UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0x8e in position 0: invalid start byte

該当のソースコード

1行目にはデータが何か日本語で記述されているので飛ばして読み込んでいます。

import numpy as np

xp, xm, yp, ym = np.genfromtxt("pppet.txt",skip_header=1,usecols=[7,8,9,10], delimiter=",",unpack=True)
print(xp,xm,yp,ym)

試したこと

上述の通りです。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

jupyter notebook で書いてます。

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回答 1

checkベストアンサー

+1

pandasを使った方が柔軟に読み込めて便利かと思います。

import pandas as pd
from io import StringIO

# テストデータ。pppet.txtの代わり
s = """
"2018/ 9/29 19:27:28","01","123456789B","00","0B","1235","362F","10E2","223E"," 000","80","00"," 000"," 000"," 000"," 000"," 000"
"2018/ 9/29 19:27:28","02","123456789A","00","0A","1234","362E","10E1","223D"," 000","80","00"," 000"," 000"," 000"," 000"," 000"
"2018/ 9/29 19:27:28","03","123456789B","00","0B","1235","362F","10E2","223E"," 000","80","00"," 000"," 000"," 000"," 000"," 000"
"""

# 型は自動で判別して読込。「10E2」は「10e2」→「10^2」→「100」として取り込まれる
df = pd.read_csv(StringIO(s), header=None, usecols=[7,8,9,10])
xp, xm, yp, ym = df.to_numpy().T
print(xp,xm,yp,ym)
# [1000.0 100.0 1000.0] ['223E' '223D' '223E'] [0 0 0] [80 80 80]

# 型は文字列として読込。「10E2」はそのまま
df = pd.read_csv(StringIO(s), header=None, usecols=[7,8,9,10], dtype=str)
xp, xm, yp, ym = df.to_numpy().T
print(xp,xm,yp,ym)
#['10E2' '10E1' '10E2'] ['223E' '223D' '223E'] [' 000' ' 000' ' 000'] ['80' '80' '80']

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  • 2020/07/16 17:14

    pandasを使うという選択肢がなかったので、非常に参考になりました。
    そもそもusecolsで指定した列が違うという問題点にも気づくことができました。
    非常に丁寧な回答ありがとうございました。

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