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bash

bash(Bourne-again-Shell)は sh(Bourne Shell)のインプリメンテーションに様々な機能が追加されたシェルです。LinuxやMac OS XではBashはデフォルトで導入されています。

Q&A

2回答

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ディレクトリの名前をディレクトリの中のファイルに貼り付ける方法

iziz

総合スコア8

bash

bash(Bourne-again-Shell)は sh(Bourne Shell)のインプリメンテーションに様々な機能が追加されたシェルです。LinuxやMac OS XではBashはデフォルトで導入されています。

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投稿2020/04/24 14:11

カレントディレクトリに7つのディレクトリがあり、各ディレクトリにtsvファイルが格納されています。
すべてのtsvファイルは同じ名前がついています。

bash

1$ $ ls */*.tsv 2SRR1550989/abundance.tsv SRR1551005/abundance.tsv SRR1551011/abundance.tsv SRR1551050/abundance.tsv SRR1551057/abundance.tsv SRR1551071/abundance.tsv SRR1551091/abundance.tsv

各tsvファイルの名前の先頭に各ディレクトリの名前を追加する作業をbash上で行いたいのですが、方法を教えて頂けないでしょうか。

下記の様に、ディレクトリの名前と無関係な連番をつける方法は分かるのですが、

bash

1ls */*.tsv | awk '{ printf "mv %s test%03d.png\n", $0, NR }' 2mv SRR1550989/abundance.tsv test001.png 3mv SRR1551005/abundance.tsv test002.png 4mv SRR1551011/abundance.tsv test003.png 5mv SRR1551050/abundance.tsv test004.png 6mv SRR1551057/abundance.tsv test005.png 7mv SRR1551071/abundance.tsv test006.png 8mv SRR1551091/abundance.tsv test007.png

入力値を使ってファイル名を変更する方法が知りたいです。
readコマンドとパイプを使ってなんとかできるのではと思っているのですが、、、、

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hotta

2020/04/24 14:24

やりたいことが今ひとつ見えません。 SRR1550989/abundance.tsv として見えているファイル名を SRR1550989/SRR1550989_abundance.tsv などにしたいということですか?
iziz

2020/04/24 15:40

言葉足らずですみません。 ご理解のとおりです。
guest

回答2

0

ファイル名が固定なら、以下のでよろしいのでは。

for a in ~/*; do \ [ -d $a ] && [ -f $a/abundance.tsv ] && mv $a/abundance.tsv $a/${a}_abundance.tsv \ done

投稿2020/04/24 16:38

KojiDoi

総合スコア13671

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iziz

2020/04/25 15:32 編集

ありがとうございます。エラーは出ないのですが、ファイル名が変更されないのですが、何がおかしいのでしょうか。
guest

0

readコマンドとパイプを使ってなんとかできるのではと思っているのですが、、、、

もうちょっとコンパクトに書く方法はありますが、見てわかりやすいのはこんな感じで。

sh

1ls */*.tsv | while read name 2 dir=`dirname $name` 3 file=`basename $name` 4 mv $name $dir/$dir-$file 5done

投稿2020/04/24 14:27

otn

総合スコア84598

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iziz

2020/04/24 16:07 編集

早速ありがとうございます。 頂いた回答、whileの後にdoを足すとちゃんと動作しました。 dirname、basenameというコマンドでディレクトリ名とファイル名を取得できるんですね。 勉強になりました。 ちなみにもっとコンパクトに書くとどんな感じになるのでしょうか?
otn

2020/04/24 22:55 編集

あ、do忘れてました。 for name in */*.tsv do mv $name ${name%/*}/${name%/*}-${name##*/} done ${~~} の中の意味はman bashに書いてあります。
iziz

2020/04/25 14:44 編集

いつもありがとうございます。こちらも調べておきます
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