opencvのcv2.calcHistの返り値をholoviewのhv.Curveで表示したい

前提・実現したいこと

opencvのcv2.calcHistの返り値をholoviewのhv.Curveで表示したいです。
自分なりに考えてみましたが、考え方がそもそも間違っているのかもしれません。

発生している問題・エラーメッセージ

DataError: Supplied data does not match specified dimensions, expected at least 2 columns.

ArrayInterface expects tabular data, for more information on supported datatypes see http://holoviews.org/user_guide/Tabular_Datasets.html

該当のソースコード

python3
1im = np.array(Image.open(file_name))
2im_hist = cv2.calcHist([im],[0],None,[256],[0,256])
3hv.Curve(im_hist)

試したこと

python3
1im_hist

result
1array([[0.000000e+00],
2       [0.000000e+00],
3       [0.000000e+00],
4       [0.000000e+00],
5(中略)
6       [0.000000e+00],
7       [0.000000e+00],
8       [0.000000e+00],
9       [1.000000e+00]], dtype=float32)

arrayの中にarrayが入っていることが問題かと考えて、

python3
1im_hist_list = list(im_hist)
2im_hist_list

result
1[array([0.], dtype=float32),
2 array([0.], dtype=float32),
3 array([0.], dtype=float32),
4 array([0.], dtype=float32),
5(中略)
6 array([0.], dtype=float32),
7 array([0.], dtype=float32),
8 array([0.], dtype=float32),
9 array([1.], dtype=float32)]

としましたが、
一項目?ずつがarrayのままでダメでした。
なので、一項目?ずつlist化しようとしたのですが、

python3
1im_hist_list = []
2
3for i in im_hist:
4    im_hist_list.append(list(i))
5
6im_hist_list

result
1[[0.0],
2 [0.0],
3 [0.0],
4 [0.0],
5(中略)
6 [0.0],
7 [0.0],
8 [0.0],
9 [1.0]]

となり、各項目?に[]がついたlistになってしまい、これもダメでした。
[]を外せばうまくいくのか、わかりませんが、[]を外す手段もわかりません...
[]のついていない数字?をなんと呼ぶのかもわからないモグリであるため、質問いたしました。

行動規範の内容に同意します

回答1件

ベストアンサー

cv2.calcHist() で1次元のヒストグラムを作成した際、返り値は形状が (ビンの数, 1) の2次元の numpy 配列になっています。
これを ndarray.squeeze(axis=-1) で (n_bins,) という1次元の numpy 配列に変換してから、hv.Curve() に渡すと描画できます。

python
1a = np.array([1, 2, 3])  # 形状が (3,) の1次元配列
2b = np.array([[1], [2], [3]])  # 形状が (3, 1) の2次元配列
3c = b.squeeze(axis=1)  # 形状が (3, 1) から (3,) になる。

以下を参考にしてください。

OpenCV で画像のヒストグラムを作成する方法

修正後のコード

python
1import cv2
2import holoviews as hv
3hv.extension('matplotlib')
4
5# 画像をグレースケール形式で読み込む。
6img = cv2.imread("sample.jpg", cv2.IMREAD_GRAYSCALE)
7
8# 1次元ヒストグラムを作成する。
9hist = cv2.calcHist([img], channels=[0], mask=None, histSize=[256], ranges=[0, 256])
10hist = hist.squeeze(axis=-1)  # (n_bins, 1) -> (n_bins,)
11
12curve = hv.Curve(hist)
13curve