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Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

機械学習

機械学習は、データからパターンを自動的に発見し、そこから知能的な判断を下すためのコンピューターアルゴリズムを指します。人工知能における課題のひとつです。

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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1回答

3524閲覧

GraphViz's executables not foundの解消方法について

Yusuke_O

総合スコア7

Jupyter

Jupyter (旧IPython notebook)は、Notebook形式でドキュメント作成し、プログラムの記述・実行、その実行結果を記録するツールです。メモの作成や保存、共有、確認などもブラウザ上で行うことができます。

機械学習

機械学習は、データからパターンを自動的に発見し、そこから知能的な判断を下すためのコンピューターアルゴリズムを指します。人工知能における課題のひとつです。

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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2020/01/09 07:34

前提・実現したいこと

決定木分析をしようとしたところ、掲題の「GraphViz's executables not found」が発生しています。
同題名の質問を参考にして、エラーを解消しようとしましたが、できておりません。
(パスを追加する場所が間違っているのかもしれません)

Pythonによるあたらしいデータ分析の教科書を用いてPythonを勉強している初学者です。
初心者でも分かるようにご回答いただければ幸いです。

発生している問題・エラーメッセージ


InvocationException Traceback (most recent call last)
<ipython-input-15-05444a76591d> in <module>
16 #決定木のプロットを出力
17 graph = graph_from_dot_data (dot_data)
---> 18 graph.write_png("C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py")

C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in <lambda>(path, f, prog)

C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in write(self, path, prog, format)

C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in create(self, prog, format)

InvocationException: GraphViz's executables not found

該当のソースコード

from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier

iris = load_iris()
X, y = iris.data, iris. target
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3, random_state=123)

tree = DecisionTreeClassifier(max_depth=3)
tree.fit(X_train, y_train)

pip install pydotplus

from pydotplus import graph_from_dot_data
from sklearn.tree import export_graphviz

dot_data = export_graphviz (tree, filled=True,
rounded=True,
class_names=["Setona",
"Vercicolor",
"virginica"],
feature_names=["Sepal Length",
"Sepal Width",
"Petal Length",
"Petal Width"],
out_file=None)

graph = graph_from_dot_data (dot_data)
graph.write_png("C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py")

試したこと

最後の下記パス先の記載が間違っているのかと考え、いくつかのパスを追加したり、新しく出力したい適当なファイル名を記載したり等しましたが、解消しませんでした
graph.write_png("C:\ProgramData\Anaconda3\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py")

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

Anaconda3でJupyternotebook6.0.0を使用しています。

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tiitoi

2020/01/09 07:47

> 、いくつかのパスを追加したり 具体的にどのような作業を行ったのでしょうか? 環境変数に追加したパスを記載してください。
guest

回答1

0

ベストアンサー

python側パッケージとは別にgraphviz本体のインストールが必要です。

windowsであれば下記リンクから.msiをダウンロードしてインストーラを実行してみてください。

Windows Packages

もしかすると環境変数の設定によりインストール先にパスを通す必要があるかもしれません(試していませんが)。

参考
Windows で Graphviz のインストール

投稿2020/01/09 07:47

編集2020/01/09 07:49
hayataka2049

総合スコア30935

バッドをするには、ログインかつ

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Yusuke_O

2020/01/20 15:24

ありがとうございます。会社のPCを使用しており、ダウンロードに時間がかかりましたが、無事完了いたしました。ダウンロード後実行してみると、外部コマンドということで、”! pip install pydotplus”の"!"マークが必要でしたが、無事インストールできました。本件解決いたしました。ありがとうございます!(同じコード群に対して、他にもエラーが発生しているため、別スレでご質問させていただきますので、もし宜しければご回答いただければ幸いです)
guest

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