openslide-pythonというライブラリをwindowsで使いたい

Question

実現したいこと

Pythonでopenslideという、巨大な画像を開くライブラリを使いたい(install & use)です。
正確には、pythonなのでopenslide-pythonになります。

windows (jupyter notebook上)で使えるようにしたいです。

Linux　(jupyter notebook上)では普通に使っていました。

単純なことだと思います。
初学者にてやり方がわかりません。

やったこと

installの方法は、ネット上では2つのやり方が示唆されてます。
1つ目は、ココにあるように、

1，Install OpenSlide.
2，pip install openslide-python

とあります。
２はわかるのですが、
１が「どの (what)」ファイルを「どうやって(how)」インストールするのかがわかりません。

なので断念しました。

2つ目は、ココを参考にして、

1，openslideのWindows Binaries (のbinary package)をココからDL
（Cドライブに適当に置きました）
2，1の"bin" フォルダのパスをシステム環境変数Pathに追加
3，pip install openslide-python（successfully installed ver1.1.1）

と解釈して、1-3の操作を行いました。

その後、jupyter notebookで

import openslide

とだけ書いてRunすると、
Windows Binariesが32-bitだと、
以下のように、
OSError: [WinError 193] %1 is not a valid Win32 application
というエラーが出ます。

OSError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-bb94c1b557c7> in <module>
----> 1 import openslide

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\site-packages\openslide\__init__.py in <module>
     27 from PIL import Image
     28 
---> 29 from openslide import lowlevel
     30 
     31 # For the benefit of library users

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\site-packages\openslide\lowlevel.py in <module>
     39 
     40 if platform.system() == 'Windows':
---> 41     _lib = cdll.LoadLibrary('libopenslide-0.dll')
     42 elif platform.system() == 'Darwin':
     43     try:

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\ctypes\__init__.py in LoadLibrary(self, name)
    424 
    425     def LoadLibrary(self, name):
--> 426         return self._dlltype(name)
    427 
    428 cdll = LibraryLoader(CDLL)

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\ctypes\__init__.py in __init__(self, name, mode, handle, use_errno, use_last_error)
    346 
    347         if handle is None:
--> 348             self._handle = _dlopen(self._name, mode)
    349         else:
    350             self._handle = handle

OSError: [WinError 193] %1 is not a valid Win32 application

Windows Binariesが64-bitだと、

windows上に
上の、「エントリポイントが見つかりません」という4つのエラーが出たあと、
jupyter上に
下の
OSError: [WinError 127] The specified procedure could not be found
というエラーが出ます。

OSError                                   Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-bb94c1b557c7> in <module>
----> 1 import openslide

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\site-packages\openslide\__init__.py in <module>
     27 from PIL import Image
     28 
---> 29 from openslide import lowlevel
     30 
     31 # For the benefit of library users

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\site-packages\openslide\lowlevel.py in <module>
     39 
     40 if platform.system() == 'Windows':
---> 41     _lib = cdll.LoadLibrary('libopenslide-0.dll')
     42 elif platform.system() == 'Darwin':
     43     try:

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\ctypes\__init__.py in LoadLibrary(self, name)
    424 
    425     def LoadLibrary(self, name):
--> 426         return self._dlltype(name)
    427 
    428 cdll = LibraryLoader(CDLL)

~\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy\lib\ctypes\__init__.py in __init__(self, name, mode, handle, use_errno, use_last_error)
    346 
    347         if handle is None:
--> 348             self._handle = _dlopen(self._name, mode)
    349         else:
    350             self._handle = handle

OSError: [WinError 127] The specified procedure could not be found

あと、
Python 3.6.7 (default, Jul 2 2019, 02:21:41) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)] on win32
なのですが、
win binaries fileは64 or 32 bitどちらを使うべきなのでしょうか？

よろしくお願いします。

補足情報

OS : windows10
CPU : Intel(R)Core(TM)i9-9900X CPU @ 3.50GHz
RAM : 128 GB
64bit OS
グラボ ：ZOTAC GAMING GeForce RTX 2080 AMP Edition　(2台)
Python 3.6.7 (default, Jul 2 2019, 02:21:41) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)] on win32
anaconda環境で動かしています。

Answer 1

１が「どの (what)」ファイルを「どうやって(how)」インストールするのかがわかりません。

使用するのはWindows Binaries 32-bitでよいと思います。
Windows Binaries 64bitを使用してください。
binフォルダのDLLファイルを使っているPython.exeが置いてある同じディレクトリに置いてみてください。
※本当は64 bit windowsの32bit DLLはC:\Windows\SysWOW64に置くべきなのしれませんが最初はお勧めしません。
※本当は64 bit windowsの32bit DLLはC:\Windows\systemに置くべきなのしれませんが最初はお勧めしません。
環境変数Pathは実行ファイル(exe)の検索パスになるだけでDLLには効果はないと思います。

自分の場合はwindows10 64bit+公式Python (x86_64)なので
1.64bit版をDLし、binフォルダにあるDLLファイルすべてをPythonのインストールディレクトリ(Python.exeのあるフォルダ)に置く
1.pip install openslide-python実施
することで、Pythonのインタラクティブモードでimport openslideをPassすることができました。

.dll.debugも?

不要です。

Comments

[SakuSakuLab]

nomuken様

前回に引き続き、ご教示、本当にありがとうございます。
助かります！

今現在、全Windows PCが中断できない作業を進行中でして、
早くとも夜中にならないと使用できない状態です。
終わり次第、早速試してみます。

1，Windows Binaries 32-bitをDLする。
2，Windows Binaries 32-bitのbinフォルダ内のDLLファイルをコピー(.dllだけ？.dll.debugも?)
3，コピーしたものをPython.exeが置いてある同じディレクトリにペースト
（私の場合はanacondaでpythonをインストールしているのでC:\Users\SakuLab2\Anaconda3?）
4，pip install openslide-python
てな感じで試してみます。

ありがとうございます！

[SakuSakuLab]

momuken様

駄目でした。

1，Windows Binaries 32-bit（openslide-win32-20171122）をDLする。
2，Windows Binaries 32-bitのbinフォルダ内のDLLファイル (.dllのみ20ファイル)をコピー
3，コピーしたものをPython.exeが置いてある同じディレクトリにペースト
（C:\Users\SakuLab2\Anaconda3）
4，pip install openslide-python

jupyter notebookでもインタラクティブモードでも
OSError: [WinError 193] %1 is not a valid Win32 application
が出てしまいます。

DLLファイルを実際に使うアナコンダ環境
(C:\Users\SakuLab2\Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy)
にコピペしても駄目でした。

その後、
C:\Windows\SysWOW64
にもコピーしましたが駄目でした（その後削除）。

再起動、などいろいろ試したのですが、駄目でした。

ただ、なぜかuninstall
(pip uninstall openslide-python)
してから
import openslide
とするとpassすることが出来ました。

pip listで確認してもしっかりuninstallされています。

ただこれだと、
openslideの基本動作の画像の読み込み
img = openslide.OpenSlide("filename")
を行うと、
AttributeError: module 'openslide' has no attribute 'OpenSlide'
とエラーが出てしまい。実行することが出来ません(Linuxではこんなエラーは起きないのですが)。

何か、考えられる可能性がありますか？

あと、32-bitってなにが32-bitなのでしょうか？
PCは64bitだし、Anacondaも64bit版をDLしたような、、、。
python も確認したら64bitだし。
なにかアイデアいただけたら助かります。
よろしくお願いします。

[nomuken]

夜遅くまでお疲れ様です・・・。
32bit binaryを使ってくださいといったのは完全に私の認識誤りでした。64bit binaryで挑戦してみてください。

[SakuSakuLab]

nomuken様
（お名前間違えてすいません。）

即レスありがとうございます。
大変心強いです。

64-bitでtryしてみます。
帰宅してしまったため、
仕切り直します。

よろしくお願いします。

[SakuSakuLab]

nomuken 様

64-bit versionを使ったところ
あっさりopenslideを使えるようになりました！

ネットを調べても埒が明かず、
途方に暮れていたところを
助けていただき、またもや感謝です！

おかげで今週末の締切に間に合いそうです。
ありがとうございました！
今後ともどうぞよろしくお願いします。
ベストアンサーにさせていただきます。

（備忘録）
openslide-python windows install方法
1，https://openslide.org/download/
のWindows Binariesファイル
2017-11-22 64-bit versionをDL

２，bin内の20個の.dllファイルを copy to Anaconda3\envs\tesnsorflow_gpu_with_kivy
(python.exeがあるフォルダ)

３，(anaconda prompt) pip install openslide-python (tesnsorflow_gpu_with_kivyで)