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Pathを通してもおこるInvocationException: GraphViz's executables not found

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前提・実現したいこと

『東京大学のデータサイエンティスト育成講座』を使い、
決定木モデルの構築をしようとしています。

そこでpydotplusとgraphvizをpipでインストールし、
以下のコードを実行しようとしたのですが、
エラーが起きました。

発生している問題・エラーメッセージ

---------------------------------------------------------------------------
InvocationException                       Traceback (most recent call last)
<ipython-input-56-3edeb7430a4f> in <module>
      9 tree.export_graphviz(model, out_file=dot_data)
     10 graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
---> 11 Image(graph.create_png())

c:\users\jupyter-notebook\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in <lambda>(f, prog)
   1795             self.__setattr__(
   1796                 'create_' + frmt,
-> 1797                 lambda f=frmt, prog=self.prog: self.create(format=f, prog=prog)
   1798             )
   1799             f = self.__dict__['create_' + frmt]

c:\users\jupyter-notebook\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in create(self, prog, format)
   1958             if self.progs is None:
   1959                 raise InvocationException(
-> 1960                     'GraphViz\'s executables not found')
   1961 
   1962         if prog not in self.progs:

InvocationException: GraphViz's executables not found

該当のソースコード

#reference programme
#necessary to install pydotplus and graphviz
from sklearn import tree
import pydotplus
from sklearn.externals.six import StringIO
from IPython.display import Image

dot_data = StringIO()
tree.export_graphviz(model, out_file=dot_data)
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
Image(graph.create_png())

試したこと

環境変数の設定でPATHを
追加しましたが、
効果はありませんでした。
conda installが推奨されているようですが、
Anaconda環境ではないので、
それ以外の方法を探しています。

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

windows 10 pro
Python 3.7.4

何卒宜しくお願い致します。

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  • tiitoi

    2019/08/19 14:19

    再起動してもコマンドプロンプトで dot コマンドが認識されていないようであれば、Path に設定したパスが間違っているかもしれません。
    graphviz をインストールすると、dot.exe がどこかにあるはずなので、その exe があるディレクトリのパスを指定します。(exe 自身のパスではない)
    自分の環境では、C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe にありました。

    キャンセル

  • Pablito

    2019/08/19 15:15

    う~~~~ん
    pathを通しているつもりですが、
    なかなかできません。
    今度詳しい方に直接お聞きしたいと思います。。。。

    キャンセル

  • quickquip

    2019/08/19 17:50

    > pathを通しているつもり
    > なかなかできません
    Graphvizをどこにインストールしていて、Pathをどう書いたか、なにを確認してなかなかできませんと言っているのか、を質問に追記するとリアクションがあるかもしれませんよ。

    「Pathの設定をしました」「できません」ではどうしたのか伝わらないんですよね。

    キャンセル

回答 2

check解決した方法

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こちらを参考にし、
データサイエンティストの友人に手伝って頂いたらできました。

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参考になるといいのですが
単純にgraphvizをインストールしただけでは
動作しない場合があるようです。

下記、の部分を参照してみてください。
グローバルな環境変数設定で、Graphviz の バイナリのあるところに PATH を通すと、
動作するようになる。

https://qiita.com/natsuriver/items/15663226e57d60c24623

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  • 2019/08/19 12:48

    ご回答ありがとうございます。
    紹介して頂いたURLは一度見ましたが、
    自分がAnaconda環境を使っていないことから
    あまり参考になるとは思えませんでした。

    また、質問にも書いた通り、
    PATHを通す設定は実施済みです。

    Anacondaをいまさらインストールしたくないので、
    conda以外の方法を探しています。

    何卒宜しくお願い致します。

    キャンセル

  • 2019/08/19 12:53

    coda ではなく、他のグローバルな環境変数の中を
    指定して、うまくいくならおんのじだなと思い
    上記URLを記載しました。

    キャンセル

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