Pathを通してもおこるInvocationException: GraphViz's executables not found

Question

前提・実現したいこと

『東京大学のデータサイエンティスト育成講座』を使い、
決定木モデルの構築をしようとしています。

そこでpydotplusとgraphvizをpipでインストールし、
以下のコードを実行しようとしたのですが、
エラーが起きました。

発生している問題・エラーメッセージ

---------------------------------------------------------------------------
InvocationException                       Traceback (most recent call last)
<ipython-input-56-3edeb7430a4f> in <module>
      9 tree.export_graphviz(model, out_file=dot_data)
     10 graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
---> 11 Image(graph.create_png())

c:\users\jupyter-notebook\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in <lambda>(f, prog)
   1795             self.__setattr__(
   1796                 'create_' + frmt,
-> 1797                 lambda f=frmt, prog=self.prog: self.create(format=f, prog=prog)
   1798             )
   1799             f = self.__dict__['create_' + frmt]

c:\users\jupyter-notebook\lib\site-packages\pydotplus\graphviz.py in create(self, prog, format)
   1958             if self.progs is None:
   1959                 raise InvocationException(
-> 1960                     'GraphViz\'s executables not found')
   1961 
   1962         if prog not in self.progs:

InvocationException: GraphViz's executables not found

該当のソースコード

#reference programme
#necessary to install pydotplus and graphviz
from sklearn import tree
import pydotplus
from sklearn.externals.six import StringIO
from IPython.display import Image

dot_data = StringIO()
tree.export_graphviz(model, out_file=dot_data)
graph = pydotplus.graph_from_dot_data(dot_data.getvalue())
Image(graph.create_png())

試したこと

環境変数の設定でPATHを
追加しましたが、
効果はありませんでした。
conda installが推奨されているようですが、
Anaconda環境ではないので、
それ以外の方法を探しています。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

windows 10 pro
Python 3.7.4

何卒宜しくお願い致します。

Comments

[quickquip]

Pythonバインディングじゃない"Graphvizのソフトウェア"はインストールしてありますか?

[Pablito]

質問ありがとうございます！
それはしていないと思います。
至急やります！

[Pablito]

やってみて、
Pathの設定までしましたが、
同じエラーが起きてしまいます、、、
これは環境を変える必要があるのでしょうか？？？

[tiitoi]

コマンドプロンプトで dot とコマンドを入力して、「、内部コマンドまたは外部コマンド、操作可能なプログラムまたはバッチ ファイルとして認識されていません。」と出た場合は Path が通せてないです。
環境変数を設定したあとは再起動しないと反映されないかもしれません。

[Pablito]

tiitoiさん
ありがとうございます！
とりあえず再起動してみます。

[tiitoi]

再起動してもコマンドプロンプトで dot コマンドが認識されていないようであれば、Path に設定したパスが間違っているかもしれません。
graphviz をインストールすると、dot.exe がどこかにあるはずなので、その exe があるディレクトリのパスを指定します。(exe 自身のパスではない)
自分の環境では、C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe にありました。

[Pablito]

う～～～～ん
pathを通しているつもりですが、
なかなかできません。
今度詳しい方に直接お聞きしたいと思います。。。。

[quickquip]

> pathを通しているつもり
> なかなかできません
Graphvizをどこにインストールしていて、Pathをどう書いたか、なにを確認してなかなかできませんと言っているのか、を質問に追記するとリアクションがあるかもしれませんよ。

「Pathの設定をしました」「できません」ではどうしたのか伝わらないんですよね。

Answer 1

こちらを参考にし、
データサイエンティストの友人に手伝って頂いたらできました。

Answer 2

参考になるといいのですが
単純にgraphvizをインストールしただけでは
動作しない場合があるようです。

下記、の部分を参照してみてください。
グローバルな環境変数設定で、Graphviz の バイナリのあるところに PATH を通すと、
動作するようになる。

https://qiita.com/natsuriver/items/15663226e57d60c24623

Comments

[Pablito]

ご回答ありがとうございます。
紹介して頂いたURLは一度見ましたが、
自分がAnaconda環境を使っていないことから
あまり参考になるとは思えませんでした。

また、質問にも書いた通り、
PATHを通す設定は実施済みです。

Anacondaをいまさらインストールしたくないので、
conda以外の方法を探しています。

何卒宜しくお願い致します。

[nanami12]

coda ではなく、他のグローバルな環境変数の中を
指定して、うまくいくならおんのじだなと思い
上記URLを記載しました。