時系列DataFrameで特定列に含まれるキーワードにより行を抽出

Question

時系列DataFrameで特定列に含まれるキーワードにより行を抽出

解決済

回答 2

投稿 2019/07/10 15:56 ・編集 2019/07/12 18:54

評価
クリップ 0
VIEW 66

Higomon

score 19

最終目標
Python, Pandasでlogファイルの時系列解析
実現したいこと
時系列DataFrameにおいて、特定列に含まれるキーワードにより行を抽出
具体的には、列名"Refid"に"PPS"というキーワードが含まれれば、その行を抽出

質問者背景
・Python初学者
・開発経験　Excel VBAのみ

(Original) logデータ

refclocks.log

(前処理後) logデータ

前処理は最下部記載のコードをご参照。

	Date Time(UTC)	Refid	Raw offset	Cooked offset	Disp.
0	2019-05-25 16:51:22.999972	PPSx	2.731100e-05	0.000027	1.000000e-09
1	2019-05-25 16:51:22.323771	NMEA	-3.237718e-01	0.176228	1.000000e-03
2	2019-05-25 16:51:23.999975	PPS	2.434500e-05	0.000024	1.000000e-09
3	2019-05-25 16:51:23.999975	PPSx	2.434500e-05	0.000024	1.000000e-09
4	2019-05-25 16:51:23.324379	NMEA	-3.243791e-01	0.175621	1.000000e-03
5	2019-05-25 16:51:24.999973	PPS	2.658800e-05	0.000027	1.000000e-09
6	2019-05-25 16:51:24.999973	PPSx	2.658800e-05	0.000027	1.000000e-09

各列の型

In[]: df.dtypes

Out[]:
Date Time(UTC)    datetime64[ns]
Refid                 object
Raw offset         float64
Cooked offset     float64
Disp.                 float64
dtype: object

【理想】抽出後のDataFrame

	Date Time(UTC)	Refid	Raw offset	Cooked offset	Disp.
2	2019-05-25 16:51:23.999975	PPS	2.434500e-05	0.000024	1.000000e-09
5	2019-05-25 16:51:24.999973	PPS	2.658800e-05	0.000027	1.000000e-09

【現状】抽出失敗したDataFrame

試したこと１(→ 正常動作を確認)
DataFrameに時系列を含まなければ、上記の理想通りとなるが、
時系列を含むと以下のようなる。

In[]: df[df['Refid'] == 'PPS']

Out[]:

	Date Time(UTC)	Refid	Raw offset	Cooked offset	Disp.
0	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
1	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
2	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
3	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
6	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN

↑logファイル前処理のバグが原因だった

試したこと２(→ 正常動作を確認)

In[]: df.query('Refid' == 'PPS')

Out[]:
...
ValueError: expr must be a string to be evaluated, <class 'bool'> given
↑logファイル前処理のバグが原因だった

【解決済】Code

import numpy as np
import pandas as pd
import re             #正規表現

path = "D:\\refclocks.log"

# 列名の取得
#    logファイル先頭３行から抽出
def get_Header(f):
    c = 0
    for a in f:
        if '=' not in a:
            a = a.lstrip(' ') #文字列先頭の半角スペースを削除
            s = re.sub(r" +", ",", a)
            s = s.replace("Date,(UTC),Time,", "Date Time(UTC),") #1列目と２列目を結合
            s = s.replace("Raw,offset,", "Raw offset,")
            s = s.replace("Cooked,offset,", "Cooked offset,")
            s = s.replace("\n", "")       #改行コードの除去
            s = s.split(",")
            del s[2:5]                         #不要な列の削除

        c += 1
        if c == 3:
            break

    return s

def get_Body(f, body):
# ファイル先頭以外に定期的に含まれる列名(3行連続)は無視
    for a in f:
        if '=' not in a:
            if a[0] != ' ':
                s = re.sub(r" +", ",", a) #複数半角スペース → １つの半角スペース                
                s = s.replace("\n", "")   #改行コードの除去
                s = s.split(",")
                tmp = s[0] + ' ' + s[1] #1列目と２列目を結合
                s[0] = tmp
                del s[1]                       #不要な列の削除
                del s[2:5]
                body.append(s)

    return body

def main():
    f = open(path, mode='rt') 

# /// 前処理 ///
    #列名(リスト)の取得
    header = get_Header(f) 

    #ファイルボディの取得
    body = []
    get_Body(f, body)

    f.close()

    #List --> Pandas DataFrameに変換
    df = pd.DataFrame(body, dtype=float)
    df.columns = header  #columnsの指定 (← get_Header関数を修正)

    #Cast
    df['Date Time(UTC)'] = pd.to_datetime(df['Date Time(UTC)'])
    df['Raw offset'] = df['Disp.'].astype(float)


# /// 行の抽出 ///
    #試したこと１ ←正常動作
    print(df[df['Refid'] == 'PPS'])

    #試したこと２ ←正常動作
    print(df.query("Refid == 'PPS'"))

if __name__ == '__main__':
    main()

環境

Windows 10
Anaconda (default, Apr 24 2019, 15:29:51) [MSC v.1915 64 bit (AMD64)]
Python: 3.7.3, Pandas: 0.24.2
Jupyter Notebook

気になる質問をクリップする

クリップした質問は、後からいつでもマイページで確認できます。

またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

クリップを取り消します
良い質問の評価を上げる

以下のような質問は評価を上げましょう
- 質問内容が明確
- 自分も答えを知りたい
- 質問者以外のユーザにも役立つ
評価が高い質問は、TOPページの「注目」タブのフィードに表示されやすくなります。
質問の評価を上げたことを取り消します

評価を下げられる数の上限に達しました

評価を下げることができません
- 1日5回まで評価を下げられます
- 1日に1ユーザに対して2回まで評価を下げられます
質問の評価を下げる

teratailでは下記のような質問を「具体的に困っていることがない質問」、「サイトポリシーに違反する質問」と定義し、推奨していません。
- プログラミングに関係のない質問
- やってほしいことだけを記載した丸投げの質問
- 問題・課題が含まれていない質問
- 意図的に内容が抹消された質問
- 広告と受け取られるような投稿
評価が下がると、TOPページの「アクティブ」「注目」タブのフィードに表示されにくくなります。
質問の評価を下げたことを取り消します

この機能は開放されていません

評価を下げる条件を満たしてません

評価を下げる理由を選択してください
プログラミングに関係のない質問やってほしいことだけを記載した丸投げの質問問題・課題が含まれていない質問意図的に内容が抹消された質問広告と受け取られるような投稿
詳細な説明はこちら

上記に当てはまらず、質問内容が明確になっていない質問には「情報の追加・修正依頼」機能からコメントをしてください。
質問の評価を下げる機能の利用条件

この機能を利用するためには、以下の事項を行う必要があります。
- 質問回答など一定の行動
- メールアドレスの認証
  メールアドレスの認証
- 質問評価に関するヘルプページの閲覧
  質問評価に関するヘルプページの閲覧

2 件の質問への追記・修正依頼

質問への追記・修正、ベストアンサー選択の依頼

can110

2019/07/10 16:18

報告のみ。以下の当方環境では正常に動作します。提示コードに問題はなさそうです。
Win10
Python 3.5.5 |Anaconda custom (64-bit)| (default, Apr 7 2018, 04:52:34) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)] on win32
pandas:0.23.0
コンソール上で実行

報告のみ。以下の当方環境では正常に動作します。提示コードに問題はなさそうです。 Win10 Python 3.5.5 |Anaconda custom (64-bit)| (default, Apr 7 2018, 04:52:34) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)] on win32 pandas:0.23.0 コンソール上で実行

キャンセル
Higomon

2019/07/10 17:14

ご検証、ありがとうござます。
お使いの環境だと正常動作するのですね。。。

Pandasではなく、Numpyの話ですが、先日取得したAnaconda(Anaconda3-2019.03)で
Numpyのimportが出来ず、悪戦苦闘しました。
以下のサイトを参考に、Numpyのimport問題は解決しましたが、
上記Pandasの問題は解決に至っていません。
https://teratail.com/questions/149566

取り急ぎ、お礼申し上げます。

ご検証、ありがとうござます。お使いの環境だと正常動作するのですね。。。 Pandasではなく、Numpyの話ですが、先日取得したAnaconda(Anaconda3-2019.03)で Numpyのimportが出来ず、悪戦苦闘しました。以下のサイトを参考に、Numpyのimport問題は解決しましたが、上記Pandasの問題は解決に至っていません。 https://teratail.com/questions/149566 取り急ぎ、お礼申し上げます。

キャンセル

回答 2 件

評価が高い順
新着順
古い順

+1

-コメントを受けて-

一応、自分が状況再現に用いたコードを載せておきます。これがうまく動作するかどうかも試してもらえると、回答時の参考になります。

import pandas as pd
import datetime

##logf.logの中身(メモ帳で作ってlog拡張子で保存)

#Date Time(UTC),Refid,Raw offset,Cooked offset,Disp.
#2019-05-25 16:51:22.999972,PPSx,2.73E-05,0.000027,1.00E-09
#2019-05-25 16:51:22.323771,NMEA,-3.24E-01,0.176228,1.00E-03
#2019-05-25 16:51:23.999975,PPS,2.43E-05,0.000024,1.00E-09
#2019-05-25 16:51:23.999975,PPSx,2.43E-05,0.000024,1.00E-09
#2019-05-25 16:51:23.324379,NMEA,-3.24E-01,0.175621,1.00E-03
#2019-05-25 16:51:24.999973,PPS,2.66E-05,0.000027,1.00E-09
#2019-05-25 16:51:24.999973,PPSx,2.66E-05,0.000027,1.00E-09

#logファイルの読み込み
df=pd.read_csv('logf.log')

#読み込み時点ではDate Time(UTC)のdtypeがobjectなのでdatetime64[ns]に変える
df['Date Time(UTC)']=pd.to_datetime(df['Date Time(UTC)'])

#データ抽出(どちらのコードでもうまくいった)
df[df['Refid'] == 'PPS']
df.query("Refid == 'PPS'")

試したこと2について、以下のように修正した場合はどうでしょう。
※コードにミスが有ったので修正しました。

#修正前
df.query('Refid' == 'PPS')

#修正後(等式全体を””で囲み、'Refid'をRefidに変える)
df.query("Refid == 'PPS'")

参考：note.nkmk.me - pandas.DataFrameの行を条件で抽出するquery

投稿 2019/07/10 21:53

編集 2019/07/12 12:12

回答の評価を上げる

以下のような回答は評価を上げましょう
- 正しい回答
- わかりやすい回答
- ためになる回答
評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。
回答の評価を下げる

下記のような回答は推奨されていません。
- 間違っている回答
- 質問の回答になっていない投稿
- スパムや攻撃的な表現を用いた投稿
評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

2019/07/11 09:58 編集

ご提案、ありがとうございます。

df.query("Refid == 'PPS'")を試しましたが、以下のエラーを吐いています。
#1 質問時とは異なり、環境をAnaconda → Minicondaとしましたが、
　インストールしたPythonおよびPandasのバージョンは変更してません。
　質問したPandas問題も未解決のままです。

#2 列名 Refidは設定しているはずですが、
　　下記最下部のError: name 'Refid' is not definedの意味が理解できてません。

---
KeyError Traceback (most recent call last)
~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\scope.py in resolve(self, key, is_local)
180 if self.has_resolvers:
--> 181 return self.resolvers[key]
182

~\Miniconda3\lib\collections\__init__.py in __getitem__(self, key)
913 pass
--> 914 return self.__missing__(key) # support subclasses that define __missing__
915

~\Miniconda3\lib\collections\__init__.py in __missing__(self, key)
905 def __missing__(self, key):
--> 906 raise KeyError(key)
907

KeyError: 'Refid'

During handling of the above exception, another exception occurred:

KeyError Traceback (most recent call last)
~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\scope.py in resolve(self, key, is_local)
191 # e.g., df[df > 0]
--> 192 return self.temps[key]
193 except KeyError:

KeyError: 'Refid'

During handling of the above exception, another exception occurred:

UndefinedVariableError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-f108e38e0600> in <module>
----> 1 df.query("Refid == 'PPS'")

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\frame.py in query(self, expr, inplace, **kwargs)
3086 kwargs['level'] = kwargs.pop('level', 0) + 1
3087 kwargs['target'] = None
-> 3088 res = self.eval(expr, **kwargs)
3089
3090 try:

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\frame.py in eval(self, expr, inplace, **kwargs)
3201 kwargs['target'] = self
3202 kwargs['resolvers'] = kwargs.get('resolvers', ()) + tuple(resolvers)
-> 3203 return _eval(expr, inplace=inplace, **kwargs)
3204
3205 def select_dtypes(self, include=None, exclude=None):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\eval.py in eval(expr, parser, engine, truediv, local_dict, global_dict, resolvers, level, target, inplace)
292
293 parsed_expr = Expr(expr, engine=engine, parser=parser, env=env,
--> 294 truediv=truediv)
295
296 # construct the engine and evaluate the parsed expression

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in __init__(self, expr, engine, parser, env, truediv, level)
747 self.env.scope['truediv'] = truediv
748 self._visitor = _parsers[parser](self.env, self.engine, self.parser)
--> 749 self.terms = self.parse()
750
751 @property

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in parse(self)
764 def parse(self):
765 """Parse an expression"""
--> 766 return self._visitor.visit(self.expr)
767
768 @property

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs)
329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__
330 visitor = getattr(self, method)
--> 331 return visitor(node, **kwargs)
332
333 def visit_Module(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Module(self, node, **kwargs)
335 raise SyntaxError('only a single expression is allowed')
336 expr = node.body[0]
--> 337 return self.visit(expr, **kwargs)
338
339 def visit_Expr(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs)
329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__
330 visitor = getattr(self, method)
--> 331 return visitor(node, **kwargs)
332
333 def visit_Module(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Expr(self, node, **kwargs)
338
339 def visit_Expr(self, node, **kwargs):
--> 340 return self.visit(node.value, **kwargs)
341
342 def _rewrite_membership_op(self, node, left, right):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs)
329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__
330 visitor = getattr(self, method)
--> 331 return visitor(node, **kwargs)
332
333 def visit_Module(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Compare(self, node, **kwargs)
664 op = self.translate_In(ops[0])
665 binop = ast.BinOp(op=op, left=node.left, right=comps[0])
--> 666 return self.visit(binop)
667
668 # recursive case: we have a chained comparison, a CMP b CMP c, etc.

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs)
329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__
330 visitor = getattr(self, method)
--> 331 return visitor(node, **kwargs)
332
333 def visit_Module(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_BinOp(self, node, **kwargs)
433
434 def visit_BinOp(self, node, **kwargs):
--> 435 op, op_class, left, right = self._maybe_transform_eq_ne(node)
436 left, right = self._maybe_downcast_constants(left, right)
437 return self._maybe_evaluate_binop(op, op_class, left, right)

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in _maybe_transform_eq_ne(self, node, left, right)
370 def _maybe_transform_eq_ne(self, node, left=None, right=None):
371 if left is None:
--> 372 left = self.visit(node.left, side='left')
373 if right is None:
374 right = self.visit(node.right, side='right')

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs)
329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__
330 visitor = getattr(self, method)
--> 331 return visitor(node, **kwargs)
332
333 def visit_Module(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Name(self, node, **kwargs)
447
448 def visit_Name(self, node, **kwargs):
--> 449 return self.term_type(node.id, self.env, **kwargs)
450
451 def visit_NameConstant(self, node, **kwargs):

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\ops.py in __init__(self, name, env, side, encoding)
62 self.is_local = (tname.startswith(_LOCAL_TAG) or
63 tname in _DEFAULT_GLOBALS)
---> 64 self._value = self._resolve_name()
65 self.encoding = encoding
66

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\ops.py in _resolve_name(self)
79
80 def _resolve_name(self):
---> 81 res = self.env.resolve(self.local_name, is_local=self.is_local)
82 self.update(res)
83

~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\scope.py in resolve(self, key, is_local)
192 return self.temps[key]
193 except KeyError:
--> 194 raise compu.ops.UndefinedVariableError(key, is_local)
195
196 def swapkey(self, old_key, new_key, new_value=None):

UndefinedVariableError: name 'Refid' is not defined

ご提案、ありがとうございます。 df.query("Refid == 'PPS'")を試しましたが、以下のエラーを吐いています。 #1 質問時とは異なり、環境をAnaconda → Minicondaとしましたが、　インストールしたPythonおよびPandasのバージョンは変更してません。　質問したPandas問題も未解決のままです。 #2 列名 Refidは設定しているはずですが、　　下記最下部のError: name 'Refid' is not definedの意味が理解できてません。 --- KeyError Traceback (most recent call last) ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\scope.py in resolve(self, key, is_local) 180 if self.has_resolvers: --> 181 return self.resolvers[key] 182 ~\Miniconda3\lib\collections\__init__.py in __getitem__(self, key) 913 pass --> 914 return self.__missing__(key) # support subclasses that define __missing__ 915 ~\Miniconda3\lib\collections\__init__.py in __missing__(self, key) 905 def __missing__(self, key): --> 906 raise KeyError(key) 907 KeyError: 'Refid' During handling of the above exception, another exception occurred: KeyError Traceback (most recent call last) ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\scope.py in resolve(self, key, is_local) 191 # e.g., df[df > 0] --> 192 return self.temps[key] 193 except KeyError: KeyError: 'Refid' During handling of the above exception, another exception occurred: UndefinedVariableError Traceback (most recent call last) <ipython-input-3-f108e38e0600> in <module> ----> 1 df.query("Refid == 'PPS'") ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\frame.py in query(self, expr, inplace, **kwargs) 3086 kwargs['level'] = kwargs.pop('level', 0) + 1 3087 kwargs['target'] = None -> 3088 res = self.eval(expr, **kwargs) 3089 3090 try: ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\frame.py in eval(self, expr, inplace, **kwargs) 3201 kwargs['target'] = self 3202 kwargs['resolvers'] = kwargs.get('resolvers', ()) + tuple(resolvers) -> 3203 return _eval(expr, inplace=inplace, **kwargs) 3204 3205 def select_dtypes(self, include=None, exclude=None): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\eval.py in eval(expr, parser, engine, truediv, local_dict, global_dict, resolvers, level, target, inplace) 292 293 parsed_expr = Expr(expr, engine=engine, parser=parser, env=env, --> 294 truediv=truediv) 295 296 # construct the engine and evaluate the parsed expression ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in __init__(self, expr, engine, parser, env, truediv, level) 747 self.env.scope['truediv'] = truediv 748 self._visitor = _parsers[parser](self.env, self.engine, self.parser) --> 749 self.terms = self.parse() 750 751 @property ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in parse(self) 764 def parse(self): 765 """Parse an expression""" --> 766 return self._visitor.visit(self.expr) 767 768 @property ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs) 329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__ 330 visitor = getattr(self, method) --> 331 return visitor(node, **kwargs) 332 333 def visit_Module(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Module(self, node, **kwargs) 335 raise SyntaxError('only a single expression is allowed') 336 expr = node.body[0] --> 337 return self.visit(expr, **kwargs) 338 339 def visit_Expr(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs) 329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__ 330 visitor = getattr(self, method) --> 331 return visitor(node, **kwargs) 332 333 def visit_Module(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Expr(self, node, **kwargs) 338 339 def visit_Expr(self, node, **kwargs): --> 340 return self.visit(node.value, **kwargs) 341 342 def _rewrite_membership_op(self, node, left, right): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs) 329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__ 330 visitor = getattr(self, method) --> 331 return visitor(node, **kwargs) 332 333 def visit_Module(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Compare(self, node, **kwargs) 664 op = self.translate_In(ops[0]) 665 binop = ast.BinOp(op=op, left=node.left, right=comps[0]) --> 666 return self.visit(binop) 667 668 # recursive case: we have a chained comparison, a CMP b CMP c, etc. ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs) 329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__ 330 visitor = getattr(self, method) --> 331 return visitor(node, **kwargs) 332 333 def visit_Module(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_BinOp(self, node, **kwargs) 433 434 def visit_BinOp(self, node, **kwargs): --> 435 op, op_class, left, right = self._maybe_transform_eq_ne(node) 436 left, right = self._maybe_downcast_constants(left, right) 437 return self._maybe_evaluate_binop(op, op_class, left, right) ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in _maybe_transform_eq_ne(self, node, left, right) 370 def _maybe_transform_eq_ne(self, node, left=None, right=None): 371 if left is None: --> 372 left = self.visit(node.left, side='left') 373 if right is None: 374 right = self.visit(node.right, side='right') ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit(self, node, **kwargs) 329 method = 'visit_' + node.__class__.__name__ 330 visitor = getattr(self, method) --> 331 return visitor(node, **kwargs) 332 333 def visit_Module(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\expr.py in visit_Name(self, node, **kwargs) 447 448 def visit_Name(self, node, **kwargs): --> 449 return self.term_type(node.id, self.env, **kwargs) 450 451 def visit_NameConstant(self, node, **kwargs): ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\ops.py in __init__(self, name, env, side, encoding) 62 self.is_local = (tname.startswith(_LOCAL_TAG) or 63 tname in _DEFAULT_GLOBALS) ---> 64 self._value = self._resolve_name() 65 self.encoding = encoding 66 ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\ops.py in _resolve_name(self) 79 80 def _resolve_name(self): ---> 81 res = self.env.resolve(self.local_name, is_local=self.is_local) 82 self.update(res) 83 ~\Miniconda3\lib\site-packages\pandas\core\computation\scope.py in resolve(self, key, is_local) 192 return self.temps[key] 193 except KeyError: --> 194 raise compu.ops.UndefinedVariableError(key, is_local) 195 196 def swapkey(self, old_key, new_key, new_value=None): UndefinedVariableError: name 'Refid' is not defined

キャンセル
2019/07/12 12:00

質問にある表をもとに作ったdataframeを使った場合では問題なく動作したので、入力ファイル(logファイル)の問題かもしれません。
※環境はPython: 3.7.1, Pandas: 0.23.4,Jupyter Notebook

logファイル自体もしくはファイルの中身(コンマのついたテキスト形式になっているはず)を提示できないでしょうか。

質問にある表をもとに作ったdataframeを使った場合では問題なく動作したので、入力ファイル(logファイル)の問題かもしれません。 ※環境はPython: 3.7.1, Pandas: 0.23.4,Jupyter Notebook logファイル自体もしくはファイルの中身(コンマのついたテキスト形式になっているはず)を提示できないでしょうか。

キャンセル
2019/07/12 16:21

ご丁寧に検証頂き、ありがとうございます。

質問の簡単化のため記載しておりませんでしたが、
logファイル(original)と前処理も含めたPython codeすべてを記載しました。
改めてご参照くださいませ。

PythonのバージョンやOSを変えても正常に動かないので、前処理部分がおかしいはずですが、
恥ずかしながら、経験不足のため、何がおかしいのか未だ発見できていません。

ご丁寧に検証頂き、ありがとうございます。質問の簡単化のため記載しておりませんでしたが、 logファイル(original)と前処理も含めたPython codeすべてを記載しました。改めてご参照くださいませ。 PythonのバージョンやOSを変えても正常に動かないので、前処理部分がおかしいはずですが、恥ずかしながら、経験不足のため、何がおかしいのか未だ発見できていません。

キャンセル

同じタグがついた質問を見る

Python 3.x

10684questions

Python 3はPythonプログラミング言語の最新バージョンであり、2008年12月3日にリリースされました。
pandas

974questions

Pandasは、PythonでRにおけるデータフレームに似た型を持たせることができるライブラリです。行列計算の負担が大幅に軽減されるため、Rで行っていた集計作業をPythonでも比較的簡単に行えます。データ構造を変更したりデータ分析したりするときにも便利です。

score 1 · Accepted Answer · 2019-07-12T16:34

ベストアンサー

+1

コードの詳細内容は把握していませんが、***部分を修正することにより動作しました。

# 略

def main():
    f = open(path, mode='rt') 

# /// 前処理 ///
    #列名の取得
    header = []
    get_Header(f, header)

    #ファイルボディの取得
    body = []
    get_Body(f, body)

    f.close()

    #List --> Pandas DataFrameに変換
    df = pd.DataFrame(body, dtype=float)
    df.columns = header[0]  #columnsの指定 ***２重リストになっているので[0]を渡す

    print(df.columns)
    print(df.head())

    #Cast
    df['Date Time(UTC)'] = pd.to_datetime(df['Date Time(UTC)']) # ***最後の「,」を除く
    df['Raw offset'] = df['Disp.'].astype(float)

投稿 2019/07/12 16:34

回答の評価を上げる

以下のような回答は評価を上げましょう
- 正しい回答
- わかりやすい回答
- ためになる回答
評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。
回答の評価を下げる

下記のような回答は推奨されていません。
- 間違っている回答
- 質問の回答になっていない投稿
- スパムや攻撃的な表現を用いた投稿
評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

2019/07/12 16:40

早急にバグを見つけて頂き、誠にありがとうございました。
感動しました！

早急にバグを見つけて頂き、誠にありがとうございました。感動しました！

キャンセル

質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう！

時系列DataFrameで特定列に含まれるキーワードにより行を抽出

(Original) logデータ

(前処理後) logデータ

【理想】抽出後のDataFrame

【現状】抽出失敗したDataFrame

【解決済】Code

環境

関連した質問

同じタグがついた質問を見る

	Date Time(UTC)	Refid	Raw offset	Cooked offset	Disp.
0	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
1	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
2	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
3	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
6	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN

	Date Time(UTC)	Refid	Raw offset	Cooked offset	Disp.
0	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
1	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
2	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
3	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
6	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN

質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう！

時系列DataFrameで特定列に含まれるキーワードにより行を抽出

(Original) logデータ

(前処理後) logデータ

【理想】抽出後のDataFrame

【現状】抽出失敗したDataFrame

【解決済】Code

環境

15分調べてもわからないことは、teratailで質問しよう！

関連した質問

同じタグがついた質問を見る

SNSアカウントでログイン

teratailアカウントでログイン

	Date Time(UTC)	Refid	Raw offset	Cooked offset	Disp.
0	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
1	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
2	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
3	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
4	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN
5	NaT	PPS	NaN	NaN	NaN
6	NaT	NaN	NaN	NaN	NaN