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jupyter notebookが使えるdockerにnbextensionsが導入できない

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SolKul

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jupyter notebookサーバになるdockerコンテナにnbextensions を導入したい

いろんな環境でデータ分析できるようdockerコンテナをサーバにして、
そこにアクセスしてjupyter notebookを使いたいと考えています。
dockerのjupyter/datascience-notebookイメージでコンテナを作成していろいろいじっているのですが、
拡張機能のnbextensionsが導入できません

試したこと

dockerコンテナを立ち上げたあと、
コンテナ上のbashでroot権限で

pip install jupyter-contrib-nbextensions
pip install jupyter-nbextensions-configurator
jupyter contrib nbextension install --user
jupyter nbextensions_configurator enable --user


として再起動すると、jupyter上にnbextensionsのタブが現れるのですが
どのエクステンションを有効にしても、F5で更新すると無効になってしまいます。

このdockerイメージのjupyter/datascience-notebookではjupyterがjovyanユーザーで動いているらしいので、
権限の問題だと思い、root権限でインストールするのではなく、jovyanユーザーでpipしてみると、

su jovyan
pip install jupyter-contrib-nbextensions
bash: pip: command not found


となりコマンドが見つかりません。

(なぜpipコマンドもjupyterコマンドも動かないjovyanでjupyterが動いているのかもの謎なのですが)

よろしくおねがいします。

補足情報

OS:Windows 10
使用ソフト:docker for Windows
(会社ではWindowsしか使えないのでWindows以外を使えという回答はなしでお願いします。)

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回答 1

check解決した方法

0

まだ挙動がよくわかっていない部分があるのですが、
解決方法を示します。

原因

jupyte notebookでnbextensionsが使えるためにはnotebookを実行するユーザーのjovyanで
jupyter contrib nbextension install --user
とnbextensionsをインストール必要があると考えられます。
しかしjovyanはなぜかpipjupyterコマンドも動かせません。

そこでrootで調べます。

root@56cd00d75be2:~# which pip
/opt/conda/bin/pip


とわかるので、pip/opt/conda/bin/にあると分かりました。
さらにjovyanの環境変数のPATHを調べてみると、/opt/conda/bin/が入っていないことがわかりました。
そこで解決法として2つ考えられます

PATHに/opt/conda/bin/を加える方法

単純に環境変数のPATHに/opt/conda/bin/を加えれば、pipjupyterも動くようになります。

jovyan@56cd00d75be2:~$ export PATH=$PATH:/opt/conda/bin


あるいは毎回/opt/conda/bin/pipとすればいいです。これで

jovyan@56cd00d75be2:~$ pip install jupyter-contrib-nbextensions
jovyan@56cd00d75be2:~$ jupyter contrib nbextension install --user


とすればnbextensionsが使えるようになります。/opt/conda以下のディレクトリはjovyanが所有しているのでsudoは必要ないと思われます。もしうまく動かなかったらsudo -Hで実行すればいいと思います。(jovyanでsudoするにはGRANT_SUDO=yesとした環境変数を設定してstart-notebook.shをrootで実行する必要があります。jovyanでsudoが使える条件についてはリファレンスを参考にして下さい
https://jupyter-docker-stacks.readthedocs.io/en/latest/using/common.html)

イメージをビルドする段階(Dockerfile内)で、nbextensionsをでインストールする方法

これはリファレンスに書いてあった方法です。
https://jupyter-docker-stacks.readthedocs.io/en/latest/using/recipes.html?highlight=nbextensions
Dockerfile上のRUNコマンドで実行すれば、なぜかpipも使えます。

...
USER jovyan
RUN pip install jupyter-contrib-nbextensions
RUN jupyter contrib nbextension install --user
...


これでnbextensionsが使えるようになります。

これはDockerfileのRUNコマンドは実際にそのコンテナを立ち上げて実行しているのではなく、すぐ削除される別のintermediate container上でコマンドを実行していて、そのコンテナ上ではPATHに/opt/conda/bin/が入っているためpipが使えるのだと思われます。

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