while read line で２行づつ処理したい（？）
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while read line で２行づつ処理したいです。
あるいはそれに相当する処理が行いたいです。
現状、やりたいことは以下の通りです。
手元に、以下のようなファイルがある時に、
$ find | grep fastq
a_1.fastq
a_2.fastq
b_1.fastq
b_2.fastq
c_1.fastq
c_2.fastqa, b, c に対して繰り返し以下のような処理を行いたい時に、どのように記述すればよいのでしょうか。
$ script [-i1 input_1.fastq] [-i2 input_2.fastq]ご教授いただけたら幸いです。
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+1
以下のような感じでしょうか。
while true
do
read line1
read line2
if [ -z "$line1" ] ; then break ; fi
script -i1 $line1 -i2 $line2
done投稿
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+1
こんな感じでしょうか。
for a in *_1.fastq
do script -i1 $a -i2 ${a%%1.fastq}2.fastq
done投稿
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+1
素直に書くとこうなります。これが普通でしょう。
while read a && read b
do script -i1 $a -i2 $b
done投稿
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2018/07/24 17:56
ありがとうございます。