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PostgreSQL

PostgreSQLはオープンソースのオブジェクトリレーショナルデータベース管理システムです。 Oracle Databaseで使われるPL/SQLを参考に実装されたビルトイン言語で、Windows、 Mac、Linux、UNIX、MSなどいくつものプラットフォームに対応しています。

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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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psycopg2でUUID型のカラムを含むテーブルにNOT EXISTSを使ってexecute_values関数でバルクインサートしたい

tama1422

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PostgreSQL

PostgreSQLはオープンソースのオブジェクトリレーショナルデータベース管理システムです。 Oracle Databaseで使われるPL/SQLを参考に実装されたビルトイン言語で、Windows、 Mac、Linux、UNIX、MSなどいくつものプラットフォームに対応しています。

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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2023/11/17 23:12

編集2023/11/18 00:46

実現したいこと

postgresqlのテーブルでUUID型のカラムを含むテーブルにバルクインサートしたいです。
NOT EXISTS句でチェックをしてインサートをしたいのですが、NOT EXISTS句を含めるとエラーが出てうまくいきません。

前提

テーブル定義

SQL

1\c postgres 2 3CREATE SCHEMA TEST; 4 5CREATE TABLE TEST.USER ( 6 id UUID, 7 name VARCHAR(100) 8);

発生している問題・エラーメッセージ

--------------------------------------------------------------------------- ValueError Traceback (most recent call last) <ipython-input-24-01916b6c2dc7> in <module> 18 with get_connection() as conn: 19 with conn.cursor() as cur: ---> 20 extras.execute_values(cur, sql, params) ~/python_env/ml/lib/python3.7/site-packages/psycopg2/extras.py in execute_values(cur, sql, argslist, template, page_size, fetch) 1294 parts = pre[:] 1295 for args in page: -> 1296 parts.append(cur.mogrify(template, args)) 1297 parts.append(b',') 1298 parts[-1:] = post ValueError: only bytes values expected, got NoneType

該当のソースコード

python

1import psycopg2 2import uuid 3from psycopg2 import extras 4from psycopg2.extensions import ISQLQuote 5 6# DB接続情報 7DB_HOST = 'localhost' 8DB_PORT = '5432' 9DB_NAME = 'postgres' 10DB_USER = 'postgres' 11DB_PASS = 'password' 12SCHEMA = "TEST" 13 14def get_connection(): 15 return psycopg2.connect( 16 f"postgresql://{DB_USER}:{DB_PASS}@{DB_HOST}:{DB_PORT}/{DB_NAME}" 17 ) 18 19psycopg2.extensions.register_adapter(uuid.UUID, ISQLQuote) 20sql = f""" 21 INSERT INTO {SCHEMA}.USER 22 SELECT v.id, v.name 23 FROM (VALUES %s) AS v(id, name) 24 WHERE NOT EXISTS ( 25 SELECT 1 FROM {SCHEMA}.USER WHERE name = v.name 26 ); 27 """ 28params = [ 29 (uuid.uuid4(), 'test1'), 30 (uuid.uuid4(), "test2") 31] 32with get_connection() as conn: 33 with conn.cursor() as cur: 34 extras.execute_values(cur, sql, params)

試したこと

上記ソースコードのsql, params変数の箇所を下記のように修正すると正常にインサートされます。

python

1# sqlはNOT EXISTSを使わない形 2sql = f""" 3 INSERT INTO {SCHEMA}.USER 4 VALUES %s; 5 """ 6# paramsはUUID型から文字列型に変更 7params = [ 8 (str(uuid.uuid4()), 'test1'), 9 (str(uuid.uuid4()), ’test2’) 10]

下記のようなNOT EXISTSを使うSQLだと、

python

1sql = f""" 2 INSERT INTO {SCHEMA}.USER 3 SELECT v.id, v.name 4 FROM (VALUES %s) AS v(id, name) 5 WHERE NOT EXISTS ( 6 SELECT 1 FROM {SCHEMA}.USER WHERE name = v.name 7 ); 8 """

下記のようなエラーになります。

--------------------------------------------------------------------------- DatatypeMismatch Traceback (most recent call last) <ipython-input-26-a21cf7e66973> in <module> 19 with get_connection() as conn: 20 with conn.cursor() as cur: ---> 21 extras.execute_values(cur, sql1, params) ~/python_env/ml/lib/python3.7/site-packages/psycopg2/extras.py in execute_values(cur, sql, argslist, template, page_size, fetch) 1297 parts.append(b',') 1298 parts[-1:] = post -> 1299 cur.execute(b''.join(parts)) 1300 if fetch: 1301 result.extend(cur.fetchall()) DatatypeMismatch: column "id" is of type uuid but expression is of type text LINE 3: SELECT v.id, v.name ^ HINT: You will need to rewrite or cast the expression.

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

環境はDockerを使用しcomposeファイルは下記になります。

docker

1volumes: 2 testdb: 3 external: false 4 name: testdb 5 6services: 7 postgres: 8 container_name: testdb 9 image: postgres:15.3 10 volumes: 11 - testdb:/var/lib/postgresql/data 12 - ./script:/docker-entrypoint-initdb.d 13 ports: 14 - "5432:5432" 15 environment: 16 TZ: Asia/Tokyo 17 POSTGRES_DB: postgres 18 POSTGRES_USER: postgres 19 POSTGRES_PASSWORD: password 20 POSTGRES_ROOT_PASSWORD: root 21 POSTGRES_INITDB_ARGS: "--encoding=UTF-8" 22 hostname: postgres 23 restart: always 24

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ikedas

2023/11/18 00:01

・NOT EXISTSを含む形、含まない形の両方を併記してはどうでしょうか。どちらか一方しか記載していないので両者がどう異なるのか分かりにくいです。 ・psychopgをよく知らないのですが、「values(%s)」のように記述されている一方対応する値のタプルは2つの要素を持っています。よいのでしょうか。
tama1422

2023/11/18 00:49 編集

psycopg2のexecute_values関数では下記にもある通り、1つのプレースホルダーじゃないとエラーになるため、「values(%s)」の記述で問題ないと思います。 https://www.psycopg.org/docs/extras.html#psycopg2.extras.execute_values sql – the query to execute. It must contain a single %s placeholder, which will be replaced by a VALUES list. Example: "INSERT INTO mytable (id, f1, f2) VALUES %s". また、試したことに少し追記しました
ikedas

2023/11/18 00:52

なるほど。この点は問題なさそうですね。 で、「該当のソースコード」のほうではuuidをstrにキャストしておらず、「試したこと」のほうではキャストしています。またエラーも > DatatypeMismatch: column "id" is of type uuid but expression is of type text > ... > HINT: You will need to rewrite or cast the expression. と言っていますので、キャストされていないのではないでしょうか。
melian

2023/11/18 01:03

本題とは無関係かもしれませんが、 > #paramsはUUID型から文字列型に変更 str型に変更していますが、 psycopg2.extensions.register_adapter(uuid.UUID, ISQLQuote) を、 psycopg2.extras.register_uuid() にすれば必要ないかと思います。psycopg2 のソースコードを読むと、register_uuid() の方は、"Create the UUID type and an uuid.UUID adapter" となっていて、UUID type も用意しています。
tama1422

2023/11/18 02:03

あまり詳しくなく、キャストの方法がわかっていません。sqlのプレイスホルダー部分(%s)を下記のようにしてみてもSyntaxError: syntax error at or near "CAST"のエラーが出てしまいました。 CAST(%s AS UUID) あまり理解できていませんが、該当ソースコードのところをご指摘の通り下記の通り変更したら、うまくINSERTできました。ソースコード読んで理解を深めようと思います。ありがとうございます。 psycopg2.extensions.register_adapter(uuid.UUID, ISQLQuote) を、 psycopg2.extras.register_uuid()
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自己解決

解決方法

下記を追加することで、PythonのUUID型の変数をpostgresqlのUUID型のカラムにインサートできる。
psycopg2.extras.register_uuid()

補足

まだちゃんと理解できていませんが、整理すると下記のような感じだと思います。間違っていたらご指摘いただけると助かります。

基本的には文字列型の変数もUUID形式になっていれば、UUID型のカラムにインサートできるが、下記のようにNOT EXIST句を含んだINSERTの場合、UUIDが文字列型だとDatatypeMismatchのエラーが起きてしまう。
なので、UUID型で値を渡す必要があるが、そのままではpsycopg2ではPythonのUUID型を認識できずに、ValueErrorが出てしなう。この問題を解決するため、上記の解決方法によりpsycopg2でPythonのUUID型に対応できるようにする。

Python

1sql = f""" 2 INSERT INTO {SCHEMA}.USER 3 SELECT v.id, v.name 4 FROM (VALUES %s) AS v(id, name) 5 WHERE NOT EXISTS ( 6 SELECT 1 FROM {SCHEMA}.USER WHERE name = v.name 7 ); 8 """

投稿2023/11/18 03:00

tama1422

総合スコア5

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