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Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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欠損値の補完を多重代入法で実現したい(python)

kinakomochi1

総合スコア1

Python

Pythonは、コードの読みやすさが特徴的なプログラミング言語の1つです。 強い型付け、動的型付けに対応しており、後方互換性がないバージョン2系とバージョン3系が使用されています。 商用製品の開発にも無料で使用でき、OSだけでなく仮想環境にも対応。Unicodeによる文字列操作をサポートしているため、日本語処理も標準で可能です。

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投稿2023/01/27 17:21

編集2023/01/27 17:54

前提

https://osaka-hk.org/posts/toukei_mikata04
を読み欠損値の穴埋めを多重代入法を利用したいと考えています。
以下多重代入法のイメージ図
イメージ説明

実現したいこと

欠損値を多重代入法(Multiple Imputation)で埋めたいと思っています。
そこでpythonのライブラリscikit-learnではIterativeImputerで実現しようとしています。

該当のソースコード

IterativeImputerのパラメータsample_posterior=Trueと設定することで多重代入法になっていると認識しているのですが、合っているでしょうか?
この方法では多重代入法になっておらずm回実行することでモデルをm個作成し、平均値をとるなどの処理が必要でしょうか?

python

1from sklearn.experimental import enable_iterative_imputer 2from sklearn.impute import IterativeImputer 3IterativeImputer(sample_posterior=True).fit_transform([[1, 2], [2, 4], 4 [3, 6], 5 [np.nan, 8], 6 [5, np.nan]]))

補足情報

Imputing missing values using sklearn IterativeImputer class for MICE
上記のURLではモデルを複数作成していました。しかし、下記のURLでは単一のモデルのみでした。
multiple imputation について

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bsdfan

2023/01/27 23:36

stackoverflowの回答については、random_state の値によって結果が変わることを示すために、random_state を変えながら複数の結果を示しているように思います。
kinakomochi1

2023/01/28 01:26

欠損値を埋めるのには、そのseedを変更して出した値の平均値をとることで多重代入法になっているという認識であっているでしょうか?
guest

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ベストアンサー

※リファレンスの紹介だけですが、、、

https://scikit-learn.org/stable/modules/impute.html#multiple-vs-single-imputation

Our implementation of IterativeImputer was inspired by the R MICE package (Multivariate Imputation by Chained Equations), but differs from it by returning a single imputation instead of multiple imputations. However, IterativeImputer can also be used for multiple imputations by applying it repeatedly to the same dataset with different random seeds when sample_posterior=True.

これを読む限り、自分で繰り返しの処理を書く必要があって、その時に sample_posterior=True しないといけないということのようです。

投稿2023/01/28 10:47

bsdfan

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