回答編集履歴

- >>ryunixさん

- 私はMavericks -> El Capitanです。

- 調べてみると、/etc/paths で /usr/local/bin が先頭にありました。

- 自発的に修正した記憶はありません（存在すら知らなかった）ので、見よう見まねで何かをしているときに書き換わったのかも知れませんね。