回答編集履歴
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追記
test
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それ以降に新規に生成したプロセスから有効です。
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[setx | Microsoft Docs](https://docs.microsoft.com/ja-jp/windows-server/administration/windows-commands/setx)
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#補足の追記
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> それ以降に新規に生成したプロセスから有効です。
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正確には、それ以降にWindows本体やExplorerから新規に生成したプロセスから有効です。
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`setx`やGUIで変更する以前に起動されていたプロセスから、新規に子プロセスを起動した場合には、影響しませんので、
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```Python
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import subprocess
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subprocess.run('set FOO', shell=True) # 未定義
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subprocess.run('setx FOO 123', shell=True) # ここでシステム変更するが
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# 起動元のPythonプロセスには反映されないのでそこから起動しても反映されない
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subprocess.run('set FOO', shell=True) # 未定義
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```
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となります。
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Pythonから起動するプロセスの環境変数を変更したいなら、
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```Python
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import subprocess
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import os
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subprocess.run('set FOO', shell=True) # 未定義
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os.environ["FOO"]="123"
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subprocess.run('set FOO', shell=True) # FOO=123 が定義されている
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```
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のようにPythonプロセスの環境変数を変更します。
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