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なぜ、FumiakiNakaoさんの環境では常に0.0秒のままなのか分かりませんが、環境の問題の可能性がありそうです。start、end、CLOCKS_PER_SECの値を直接printfされてみれば何か判るかも知れません。
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ozwkさんの下記を見て調べてみました。
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> UNIX系だと IO処理はclock()の経過時間に含まれないようです。
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http://man7.org/linux/man-pages/man3/clock.3.html
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http://www.cplusplus.com/reference/ctime/clock/
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を見るとプログラムが使ったプロセッサ時間と記載されてます。経過時間ではないのですね。
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Windowsでは下記のように記載されているので、マイクロソフトは規格とは異なる実装をしているようです。
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https://msdn.microsoft.com/ja-jp/library/4e2ess30.aspx
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ということは、catsforepawさんの対策が妥当と感じます。
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