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なってないならpipコマンドとpythonコマンドが対応していませんよ。
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> python -c 'import sys; print(sys.base_prefix)'の結果は、次のとおりです。
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> ********:~$ python -c 'import sys; print(sys.base_prefix)'
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> /usr
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ということなので、python は `/usr/bin/python` でしょうね。
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`pip -V`が分かりませんが質問の結果からすると`/usr/local/bin/pip`を実行していますね。
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由来が違うであろうpythonとpipが混じっていそうですが、どうやってインストールしたんでしょうか?
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しかも、Ubuntu16.04の`python3`パッケージは3.5.1のはずですね。Linuxのディストリビューションは`/usr/bin/python`は2系を実行するように固定しようということになったはずなので、システムにも影響があるんじゃないでしょうか?
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pythonをどうセットアップしたのか詳しく書くべきです。
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`/usr/lol/bin/python`はないんでしょうか?
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`pip -V`の結果が、`python -c 'import sys; print(sys.base_prefix)'`の結果の下の`
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`pip -V`の結果が、`python -c 'import sys; print(sys.base_prefix)'`の結果の下の`lib/python3.6/site-packages/pip`になってますか?
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