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  ソースコードは通常、64bitと32bitの両方共用で一個です。

  64bit用のDLLは64bit用のEXEからしか使えませんからすべてのEXEをx64で作成するのが唯一の解決策かもしれません。

 

  ちなみに32bitのCファイルというのが、32bit整数を扱かうCファイルという意味でしたら、Windowsの場合x64で作成しても64bitになるのはポインタだけで、int型の変数はx64でもx86でも32bitのままですし、long longや__int64は64bitのままです。