Q&A
dframe[,3]はベクトルです。データフレームではありません。
実現したいこと
Rを使って特定のデータを削除したい
前提
行列に86万ものデータがあるデータセットの中から、3列目の「chrX」「chrY」という名前が付いている行のデータだけを削除したいのですが、削除するコードやパッケージがわかりません。
教えていただけませんでしょうか。
試したこと
subsetのパッケージを使い、(-chrX,-xhrY)でスクリプトを書いてもできませんでした。
回答3件
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tidyverse パッケージの dplyr::filter() を使う方法もあります。
なお，列名（c）ではなく列番号（3）で指定するなら df[[3]] を使います。
R
1library(tidyverse) 2 3N <- 860000 4flag <- paste0("chr", c("V", "W", "X", "Y")) 5set.seed(127) 6 7df <- data.frame(a = runif(N), b = runif(N), 8 c = sample(flag, N, replace = TRUE)) 9head(df, n = 10) 10## a b c 11## 1 0.28510789 0.6525932 chrX 12## 2 0.06156252 0.4604521 chrV 13## 3 0.20760469 0.3686386 chrX 14## 4 0.14384433 0.5446151 chrX 15## 5 0.31067442 0.1983991 chrY 16## 6 0.74434070 0.7339179 chrX 17## 7 0.50072562 0.6571588 chrV 18## 8 0.26197449 0.9620552 chrW 19## 9 0.79383064 0.3612686 chrY 20## 10 0.80961544 0.3258545 chrX 21 22df2 <- df |> 23 dplyr::filter(!(c %in% c("chrX", "chrY"))) 24 ## dplyr::filter(!(df[[3]] %in% c("chrX", "chrY"))) 25head(df2) 26## a b c 27## 1 0.06156252 0.4604521 chrV 28## 2 0.50072562 0.6571588 chrV 29## 3 0.26197449 0.9620552 chrW 30## 4 0.84055898 0.3127375 chrV 31## 5 0.36470927 0.8804756 chrV 32## 6 0.71383384 0.8528818 chrV
投稿2023/06/06 15:08
総合スコア437
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データフレーム[-n, ]
which ( ... %in% ...)を使用して複数の行インデックスを求めます。-c(行インデックス, ...)を指定して除外します。
R
1dframe[-which(dframe[,3] %in% c("chrX","chrY")), ]
投稿2023/05/31 07:27
総合スコア1109
0
いくつかやり方は考えられますが、次のようにするとデータフレームdf1のうち３列めが"chrX"ではない行のみが選択されてdf2に格納されます。
df2 <- df1[df1[,3]!="chrX", ]
投稿2023/04/27 17:08
総合スコア13727
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2023/06/06 22:30