PCではmbedデバイス用のシリアルドライバーをインストールしているであろうから、COMポートは自然にUnityからでも見えます。対してandroid端末では、対抗のmbed用のシリアルドライバーは入っていないので、PCのようにはCOMポートは見えていません。USBホスト機能が使えるandroid端末を使っているのであれば、他で作られたandoroid用ライブラリを使って通信ができるかもしれません。
そうだとしても、android用としてスマホ版ビルドしたUnityのプログラムの中からは見えない可能性が高いです。お使いのmbedデバイスの機種や、android端末の機種、バージョン、Unityの該当のソース部分を提示すれば、もっと詳しい回答やアドバイスがもらえるかもしれません。
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