既に解決済の質問ですが、、、
AmazonLinuxを利用していますが、開発環境はVagrant+VirtualBoxでCentOS 6を利用しています。
AmazonLinuxはCentOS 6ベースの為、使うだけなら殆ど差がありません。
標準ではyumでインストール可能なものがCentOS 6よりも多いです。
例えばCentOS 6ではMySQLのバージョンは5.1となりますが、AmazonLinuxでは5.1, 5.5, 5.6と選択可能です。
CentOS 6にyumで5.6を入れる場合はOracleの提供しているリポジトリを設定してインストールしますが、
確かAmazonLinuxのMySQLはサービス名が mysql で、OracleリポジトリのMySQLは mysqld だったりと微妙な差があったのを記憶しています。
他にも細かいところで違いはありますが、そんなに苦労することはありません。
違いはありますが、大幅に異なることもないので開発環境はCentOS 6での利用で問題ないと思い、
私はそのようにしています。
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