疎行列の要素値をファイルにすべて書き込みたいです

Question

### 実現したいこと
data.csvは8×8の二次元リストで要素値はすべて1です。

今、csvファイルを読み込んでその要素値をすべて書き込むプログラムを作成しました。
出力ファイルcsr.txtは以下の通りです。
26行目が「・・」になっており、値がすべて表示されていません。
値をすべて表示されるようにするにはどのようにすれば良いでしょうか。

![イメージ説明](https://ddjkaamml8q8x.cloudfront.net/questions/2025-01-20/da141378-6a6e-45ee-bbba-c755f043d97a.png)

### 該当のソースコード

```python
import numpy as np
np.set_printoptions(threshold=np.inf)
from scipy.sparse import csr_matrix
import pandas as pd

matrix = pd.read_csv("data.csv",header=None).values.tolist()
csr = csr_matrix(matrix)

filename  = "csr.txt"
file = open(filename, 'w')
file.write(str(csr))
file.close()
```

### 試したこと
2行目に示す通り
np.set_printoptions(threshold=np.inf)
と加えてみましたがダメでした。

Accepted Answer

`scipy.sparse.find()` を使って値を取り出して、手動のループで書くのはどうでしょう。
https://docs.scipy.org/doc/scipy-1.15.0/reference/generated/scipy.sparse.find.html

```python
from scipy import sparse

#...
csr = sparse.csr_matrix(matrix)

filename = "csr.txt"
with open(filename, 'w') as file:
    row, col, val = sparse.find(csr)
    for i, j, v in zip(row, col, val):
        file.write(f'({i}, {j})	{v}
')
```
(writeするときのフォーマットは適当に調整ください)

csvでもいいなら、データフレームにして to_csv() するのが簡単だと思います。
```python
df_csr = pd.DataFrame({'row': row, 'col': col, 'val': val})
df_csr.to_csv('csr.csv', index=False)
```

Answer

出力の形式が異なりますが、[`scipy.io.mmwrite`](https://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.io.mmwrite.html) を利用するとよいかもしれません。

```python
from scipy.sparse import csr_matrix
from scipy import io
import pandas as pd

matrix = pd.read_csv("data.csv",header=None).values.tolist()
csr = csr_matrix(matrix)

filename  = "csr"
io.mmwrite(filename, csr, symmetry='general')
```

**csr.mtx**
```
%%MatrixMarket matrix coordinate integer general
%
8 8 64
1 1 1
1 2 1
1 3 1
1 4 1
1 5 1
1 6 1
1 7 1
1 8 1
2 1 1
2 2 1
2 3 1
2 4 1
   :
```
※ インデックスは 0-base ではなく 1-base です

実現したいこと

該当のソースコード

試したこと

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