JupyterNotebookをPyinstallerでEXE化した際の実行エラー

Question

Jupyter lab/notebookで作ったコードをExe化して実行したい

Jupyter labで、以下のようなコードを作成し、EXE化して配布したいです。
・ファイルダイアログを表示して、複数のcsvファイルを読み込み、データフレーム化
・以下、データフレームをPandasで数値処理して、数値処理したデータに加えて図面を表示

Jupter labで実行した際には、エラーは発生せず、問題なく実行することができました。
そこで、pyinstallerで単一のファイルにexe化して実行すると、ファイルダイアログは表示され、ファイルを選択はできますが、下記のようなエラーが発生して処理が止まってしまいました。
*最初の部分のTry項をコメントアウトしているのは、エラー内容を確認するためです。

発生している問題・エラーメッセージ

Traceback (most recent call last):
 File <exe化した元ファイルの名前.py> line35, in <module>
 File <exe化した元ファイルの名前.py> line27, in file dialog
AttributeError: 'NoneType' object 'run_line_magic'
[11776] Failed to execute script 'exe化した元ファイルの名前' due to unhandled exception!

該当のソースコード

#!/usr/bin/env python
# coding: utf-8

# In[1]:

##drophead and normarized
##IWATSU
Time_scale = 1e+9
from IPython import get_ipython
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from decimal import Decimal, ROUND_HALF_UP, ROUND_HALF_EVEN

normarized = False

def file_dialog():
#    try:
    import os, tkinter, tkinter.filedialog, tkinter.messagebox
    root = tkinter.Tk()
    root.attributes('-topmost', True)
    root.withdraw()
    root.lift()
    root.focus_force()
    fTyp = [("","*.csv")]
    files = tkinter.filedialog.askopenfilenames(filetypes = fTyp)
    get_ipython().run_line_magic('gui', 'tk')
    #読み込みテスト
    df = pd.read_csv(files[0], skiprows=18, usecols=[0,1], header=0) #(chによってcolsを変える)
    return files
#     except:
#         print("データが読み込みできませんでした。形式やデータの内容が正しいか確認してください。")
#         return file_dialog()
print("ファイルの読み込みを行います。IWATSUのDecayデータ・.csvファイルをファイルダイアログから選んでください。")
file_dialog_result = file_dialog()
files = file_dialog_result
print("データの読み込みに成功しました。")

for file in files:
    # tsv (tab-separated values)
    df = pd.read_csv(file, skiprows=18, usecols=[0,1], header=0) #(chによってcolsを変える)
    #df = pd.read_csv(file)
    df.columns = ['Time(s)', 'Ch1 V']
    #df["Ch1 V"] = - df["Ch1 V"]
    Int_min = df['Ch1 V'].max()
    if Int_min > 0:
        df['Ch1 V'] = df['Ch1 V'] - Int_min
    Int_max = df['Ch1 V'].min()
    Int_max_time = df.loc[df['Ch1 V'] == Int_max,'Time(s)'].values[-1]
    Int_max_filename = Decimal(str(-Int_max)).quantize(Decimal('0'), rounding=ROUND_HALF_UP)
    if Int_max_filename < 0:
        continue
    df['Time(s)'] = (df['Time(s)'] - Int_max_time) * Time_scale
    if normarized:
        df['Ch1 V'] = - df['Ch1 V'] * 1000
    else:
        df['Ch1 V'] = - df['Ch1 V']       
    #df['Ch1 V'] = (df['Ch1 V'] / Int_max)*1000

    fig = plt.figure(figsize=(85/25.4, 85/25.4/2), dpi=128)
    #plt.scatter(df['Time(s)'], df['Ch1 V'], s=0.4, alpha=0.6, label=Int_max_filename)
    plt.plot(df['Time(s)'], df['Ch1 V'], lw=1.0)
    #plt.legend(loc="best")
    plt.title(file[-30:], fontsize=8)
    plt.yscale("log")
    plt.savefig((f'{file}-thum.png'), bbox_inches="tight")
    plt.show()

    df = df[['Time(s)', 'Ch1 V']]
    df = df.rename(columns={'Ch1 V': 'Int'})
    df.to_csv(f'{file}-drop-header-{Int_max_filename}.txt', index=False, sep="\t")

print("end")

試したこと

pyinstaller <filename> --clean -Fでexe化しています。

必要なパッケージが仮想環境に入っているかどうか確認した。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

      conda version : 4.8.3
conda-build version : 3.18.11
     python version : 3.7.7.final.0
   virtual packages : __cuda=11.3

解決法

pyinstallerの前に、python XXX.pyで実行することによって確認できる。
余分な行 (get_ipython().run_line_magic('gui', 'tk'))を削除した。

Answer 1

Jupyterで使われている!で始まるシステムコマンド実行や%lsmagicで始まるマジックコマンドはJupyterが拡張している文法でPythonの文法ではありません。

まず、Juputerのコードの!で始まるシステムコマンド実行や%lsmagicで始まるマジックコマンドの行をすべてコメント行にしましょう。
次に、コードを.ipynbから.pyに変換しましょう。

出来上がったファイルがたとえばtest.pyだったとすると、

python test.py

をコマンドプロンプトで実行して動作することを確認してください。

コマンドプロンプトで実行ことを確認したらpyinstallerでexe化します。

このときnumpyなどのモジュールを使っていると正常に動作しないことがあるので、その場合はPyinstallerを使ってPythonコードから生成した実行ファイルについて、実行時エラーModuleNotFoundErrorを回避を読んでください。

Comments

[sho-G]

ありがとうございました。マジックコマンドに関して全くわかっていませんでした。該当する行をコメントアウトしました。また、コマンドプロンプト上での実行の仕方もわかっておらず、大変参考になりました。

Answer 2

AttributeError: 'NoneType' object 'run_line_magic'

'NoneType' には 'run_line_magic' ってもんがない、とおっしゃってますんで、
そいつがくっついてるやつを片っ端から中身を調べてみては。

Comments

[sho-G]

ありがとうございます。get_ipython().run_line_magic('gui', 'tk')という行をコメントアウトし、別の方の指摘も併せて対処したところ、うまくいきました。