npzから、pngに直したい次第です。(編集済み)

Question

前提・実現したいこと

npzから、pngに直したいと考えております。
ですが、エラーがでてしまいました。
どのようにしたら、pngになおせるのか、わかりかねている次第です。

こちらの通りに実践しました。

発生している問題・エラーメッセージ

AttributeError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-27-208dfd64eac4> in <module>()
      3     # f = np.asarray(f)
      4     # f = Image.fromarray(f.astype('uint8'))
----> 5     f = Image.fromarray(f)
      6 
      7 

/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/PIL/Image.py in fromarray(obj, mode)
   2702     .. versionadded:: 1.1.6
   2703     """
-> 2704     arr = obj.__array_interface__
   2705     shape = arr["shape"]
   2706     ndim = len(shape)

AttributeError: 'str' object has no attribute '__array_interface__'

該当のソースコード

for idx, f in enumerate(A):
    from PIL import Image
    # f = np.asarray(f)
    # f = Image.fromarray(f.astype('uint8'))
    f=np.load(f)
    
    f = Image.fromarray(f.astype(np.uint8))
    im.save(f"/content/drive/MyDrive/神様/sartorius-inserted/train_sample_npy_to_pnp/{f[-16:-4]}.jpeg")

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

ここにより詳細な情報を記載してください。

Python3 (3.7.4)
macbookpro 16

１，

---------------------------------------------------------------------------
AttributeError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-37-df6ebf7b8628> in <module>()
      5     # f = Image.fromarray(f.astype('uint8'))
      6     f=np.load(f)
----> 7     f = Image.fromarray(f)
      8     print(f)

/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/PIL/Image.py in fromarray(obj, mode)
   2702     .. versionadded:: 1.1.6
   2703     """
-> 2704     arr = obj.__array_interface__
   2705     shape = arr["shape"]
   2706     ndim = len(shape)

AttributeError: 'NpzFile' object has no attribute '__array_interface__'

2,
rgbで変化なしです。

3,

こちらに複数のやりかたってかいてあるので、その通りにやっています。

4,melianさんへの返信

Comments

[jbpb0]

np.loadで読み込まないと

https://python.atelierkobato.com/npsave/#outline__2
の「numpy.savez()」を見てください

[Deep_passion]

jbpb0さん、ご返信ありがとうございます。こちらでも、おこなってみたのですが、このようなエラーが登場してしまいました。
上記です。

[melian]

以前の質問で PNG を pickle 化して保存する、という様な事をされていたかと思いますが、もしかして読み込もうとしている npz ファイルの中身は pickle ですか？

[Deep_passion]

npzでございます。

[melian]

はい、了解です。npz ファイルをどうやって作成したのかが判ればエラーの原因が分かるかもしれません。

[Deep_passion]

https://www.kaggle.com/dschettler8845/open-npz
このようにしてでございます。

[Deep_passion]

for idx, f in enumerate(A):
from PIL import Image
# f = np.asarray(f)
# f = Image.fromarray(f.astype('uint8'))
ff = f[-16:-4]
f=np.load(f)
print(f[f'{ff}'])

https://note.nkmk.me/python-numpy-load-save-savez-npy-npz/

このような感じで行った見たのですが、ヒントになりますでしょうか、エラーでしたが。笑。

[jbpb0]

> 6 f=np.load(f)
----> 7 f = Image.fromarray(f)

https://stackoverflow.com/questions/53969450/create-image-with-pil-image-fromarray-results-in-attributeerror-list-object/53969526
とか見ると分かると思いますが、

f = Image.fromarray(f)

は、「f」がnumpy.ndarrayじゃないとできません

f=np.load(f)

のすぐ下に

print(type(f))

を追加して実行してみてください
「f」はnumpy.ndarrayでしょうか？

[Deep_passion]

<ipython-input-49-94211bc3e20d> in <module>()
6 ff = f[-16:-4]
7 f=np.load(f)
----> 8 print(f[f'{ff}'])
9
10 # print(f.dtype)

/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/numpy/lib/npyio.py in __getitem__(self, key)
257 return self.zip.read(key)
258 else:
--> 259 raise KeyError("%s is not a file in the archive" % key)
260
261

KeyError: '0140b3c8f445 is not a file in the archive'

[Deep_passion]

<class 'numpy.lib.npyio.NpzFile'>
<class 'numpy.lib.npyio.NpzFile'>
<class 'numpy.lib.npyio.NpzFile'>

[Deep_passion]

https://note.nkmk.me/python-numpy-load-save-savez-npy-npz/
こちらをnpzは参考にしました。

[melian]

なるほど、複数のファイルを束ねて一つの npz にしたのですね。

[jbpb0]

print(type(f))

を実行したら、「f」がnumpy配列なら「<class 'numpy.ndarray'>」と表示されますが、

> <class 'numpy.lib.npyio.NpzFile'>

だから違うのでダメです

f=np.load(f)
の後に、「f」から中身(numpy配列)を取り出さないといけません

print(type(f))

の代わりに、

print(f.files)

を追加して実行してみてください
そうすれば、「f」の中身の名前が表示されますので、その名前を使って取り出します

たとえば
['arr_0', 'arr_1']
と表示された場合は、下記で中身が取り出せます

f['arr_0']
f['arr_1']

これはnumpy配列なので、「Image.fromarray」に渡せます

【追記】
質問者さんが参考にした
https://note.nkmk.me/python-numpy-load-save-savez-npy-npz/
にも、下記のように同じ事が書いてありました
「格納されたndarrayを取得するには、各ndarrayの名前を[]で指定する必要がある。各ndarrayの名前はfiles属性で確認できる。」

[jbpb0]

> https://www.kaggle.com/dschettler8845/open-npz
このようにしてでございます。

のコードでも、

npz_test = np.load("../input/sartorius-segmentation-train-mask-dataset-npz/0030fd0e6378.npz")["arr_0"]

と、「np.load」の結果に「["arr_0"]」を付けて、中身を取り出してますよね

[Deep_passion]

そんなやり方も存在したのですね。ありがとうございます。

[jbpb0]

npzファイルの中身が一つだけならそれでもいいですが、複数あるなら

np.load("*.npz")["arr_0"]
np.load("*.npz")["arr_1"]

と何回も「np.load」を実行するのは無駄なので、

z=np.load("*.npz")
z["arr_0"]
z["arr_1"]

のように「np.load」の結果を変数に格納してから、その変数から一つずつ取り出す方がいいと思います

Answer 1

from PIL import Image
for idx, f in enumerate(A):

    ori=f

    f=np.load(f)
    # print(f.files)
    # arr_0
    f=f['arr_0']    
    f = Image.fromarray(f)
    # f.save(f"/content/drive/MyDrive/神様/sartorius-inserted/train_sample_npy_to_pnp/{f[-16:-4]}.png" )
    f.save(f"/content/drive/MyDrive/神様/sartorius-inserted/train_sample_npy_to_pnp/{ori[-16:-4]}.png" )

melianさん、jbpb0さん、本当にありがとうございます。
とけました。
感謝しかないです。(北島康介)