NetWorkXでノードに座標を持たせたい

Question

###NetWorkXでの中心性を出すときノードに座標を持たせて位置を固定して考えたいのです

調べてもノードに座標を持たせる方法がわかりませんでした。
できないのでしょうか。

それとエッジを繋ぐ方法は自分で入力する以外に方法はありますでしょうか。
是非ご教示いただけると幸いです。
よろしくお願いいたします。

Answer 1

以下のような感じでposを渡してあげればよいです。
参考：Draw nodes in fixed position with coordinates in Networks python

それとエッジを繋ぐ方法は自分で入力する以外に方法はありますでしょうか。

これはどのようなルールで繋ぎたいかしだいです。以下のように自動的に指定することもできます。

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
from itertools import combinations, product
import random
import math

# ノード。碁盤目状に配置
N, D = 10, 0.95 # 碁盤の大きさ, ノードの密度
random.seed(110)
pos = list(product(range(N), repeat=2))
random.shuffle(pos)
pos = {f'{p[0]}{p[1]}':p for p in pos[:int(len(pos)*D)]}

# エッジ。ノード間の距離が１以下
nodes = pos.keys()
edges = []
for n1, n2 in combinations(nodes, 2):
    p1, p2 = pos[n1], pos[n2]
    if math.sqrt(abs(p1[0]-p2[0]) + abs(p1[1]-p2[1])) <= 1:
        edges.append((n1, n2))

G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(nodes)
G.add_edges_from(edges)

nx.draw(G, pos=pos, with_labels=True)
plt.show()

密度=0.5

密度=0.95