ufunc 'isnan' not supported for the input types エラーのcsvでの対処方法

Question

前提・実現したいこと

google colab で地図上に人口数で色分けするプログラムを書いています。
将来的には平均寿命等で色分けしたいと思っています。
以下のサイトのコードを模写しながら実行していました。
https://96lovefootball.hatenablog.com/entry/2018/11/05/160000
■■な機能を実装中に以下のエラーメッセージが発生しました。

発生している問題・エラーメッセージ

TypeError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-92-11e2a2c83cb5> in <module>()
7 columns=['行政区分コード', '日本人世帯数'],
8 key_on='feature.properties.N03_007',
----> 9 fill_color='PuBu'
10 ).add_to(m)
11

/usr/local/lib/python3.7/dist-packages/folium/features.py in init(self, geo_data, data, columns, key_on, bins, fill_color, nan_fill_color, fill_opacity, nan_fill_opacity, line_color, line_weight, line_opacity, name, legend_name, overlay, control, show, topojson, smooth_factor, highlight, **kwargs)
962 if color_data is not None and key_on is not None:
963 real_values = np.array(list(color_data.values()))
--> 964 real_values = real_values[~np.isnan(real_values)]
965 _, bin_edges = np.histogram(real_values, bins=bins)
966

TypeError: ufunc 'isnan' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe''

該当のソースコード

!pip install folium==0.8.3

fukushima_location = [37.750299, 140.467551]

import pandas as pd
fukushima_data = pd.read_csv('/content/gdrive/MyDrive/data/fukushima_population.csv', encoding='utf-8')
fukushima_data.head()

fukushima_data['行政区分コード'] = fukushima_data['行政団体コード'].astype('str')
fukushima_data['行政区分コード'] = fukushima_data['行政区分コード'].str[:4]
fukushima_data['行政区分コード'] = fukushima_data['行政区分コード'].str.zfill(5)

geojson = '/content/gdrive/MyDrive/data/fukushima.geojson'

!pip install folium
import folium

m = folium.Map(location=fukushima_location,tiles='cartodbpositron',zoom_start=10) 
folium.Choropleth(
    geo_data=fukushima_geojson,
    name='choropleth',
    data=fukushima_data,
    columns=['行政区分コード', '日本人世帯数'],
    key_on='feature.properties.N03_007',
    fill_color='PuBu'
).add_to(m)

folium.LayerControl().add_to(m)

m.save('/content/gdrive/MyDrive/data/fukushima.html')

試したこと

他のサイトで調べたのですが、該当箇所が見当たらず手詰まりになってしまいました。初心者のため見逃している部分も多々あると思いますが、ご指摘よろしくおねがいします。

補足情報（FW/ツールのバージョンなど）

fukushima_population.csvはhttps://www.pref.fukushima.lg.jp/sec/01145a/juukijinkou.html
fukushima.geojsonはhttps://nlftp.mlit.go.jp/ksj/index.html
市区町村コードはhttps://www.soumu.go.jp/denshijiti/code.htmlから取得しました。市区町村コードはcsvファイルに直接入れました。

csvの中身
市町村別人口､世帯数（令和３年1月1日現在),男日本人,男外国人,男合計,女日本人,女外国人,女合計,日本人合計,外国人合計,合計,日本人世帯数,外国人世帯,複数国籍世帯,世帯合計,行政団体コード
福島市,"133,371",791,"134,162","140,344","1,140","141,484","273,715","1,931","275,646","122,223","1,041",614,"123,878",72010
会津若松市,"55,586",370,"55,956","60,580",491,"61,071","116,166",861,"117,027","51,325",491,214,"52,030",72028
郡山市,"156,389","1,338","157,727","162,048","1,619","163,667","318,437","2,957","321,394","140,387","1,852",658,"142,897",72036
いわき市,"155,409","1,352","156,761","160,188","1,541","161,729","315,597","2,893","318,490","144,235","1,863",695,"146,793",72044
白河市,"29,690",286,"29,976","29,760",374,"30,134","59,450",660,"60,110","24,515",377,180,"25,072",72052
須賀川市,"37,175",201,"37,376","38,252",264,"38,516","75,427",465,"75,892","29,442",300,93,"29,835",72079

Comments

[8524ba23]

参考のサイトと提示コードの内容がかけ離れているように思います。
実際に現象が再現するデータおよびコード全体を提示しないと適切な回答は得られにくいとおもいます。

[kumasann]

御指摘ありがとうございます。質問を編集します。

[8524ba23]

インデントがなくコードが読めません（実行できません）。以下を参考に修正ください。
https://teratail.storage.googleapis.com/uploads/contributed_images/56957fe805d9d7befa7dba6a98676d2b.gif
また、fukushima.geojsonの入手元（方法）およびfukushima_population.csvデータ内容についても提示（ソースコード欄にテキストとして）ください。
エラーが再現するのであれば、先頭数行だけでもよいです。

[kumasann]

有難うございます。編集しましたので、また五色いただけると幸いです。

[8524ba23]

「fukushima.geojson」ですが、提示HPにたくさんあるリンク先から見つけられませんでした。
具体的なダウンロード方法を提示できますでしょうか？

Answer 1

結論としては、.csvデータの数値部分に桁区切りの,が含まれており、データが文字列として認識されているのが原因のようです。
表計算ソフトで適切に保存しなおすことで桁区切りを取り除くとエラーなく動作しました。

fukushima_population.csv

市町村別人口､世帯数（令和３年1月1日現在),男日本人,男外国人,男合計,女日本人,女外国人,女合計,日本人合計,外国人合計,合計,日本人世帯数,外国人世帯,複数国籍世帯,世帯合計,行政団体コード
福島市,133371,791,134162,140344,1140,141484,273715,1931,275646,122223,1041,614,123878,72010
会津若松市,55586,370,55956,60580,491,61071,116166,861,117027,51325,491,214,52030,72028
郡山市,156389,1338,157727,162048,1619,163667,318437,2957,321394,140387,1852,658,142897,72036
いわき市,155409,1352,156761,160188,1541,161729,315597,2893,318490,144235,1863,695,146793,72044
白河市,29690,286,29976,29760,374,30134,59450,660,60110,24515,377,180,25072,72052
須賀川市,37175,201,37376,38252,264,38516,75427,465,75892,29442,300,93,29835,72079

なお以下結果例での.geojsonはTOP 国土数値情報 行政区域データの
N03-190101_07_GML.zip内のN03-19_07_190101.geojsonを利用しました。

Comments

[kumasann]

不十分な質問内容にも関わらず丁寧に艇王してくださり、有難うございました。