質問をすることでしか得られない、回答やアドバイスがある。

15分調べてもわからないことは、質問しよう!

ただいまの
回答率

87.95%

anacondaのjupyter notebookでgraphvizが使えない

解決済

回答 3

投稿

  • 評価
  • クリップ 0
  • VIEW 109

score 0

発生している問題・エラーメッセージ

学校の課題でjupyter notebook上でgraphvizを用いなければならないのですが,

インポートを行うことができません.

もし解決法がわかる方がいらっしゃればぜひ教えていただきたいです.

エラーメッセージ

ModuleNotFoundError: No module named 'graphviz'

試したこと

brew install graphbiz

は行っており,

conda search python-graphviz

を実行してパッケージがインストールされていることもpydotplusが入っているのも確認できているのですが,

anaconda navigatorのenvironments上では

python-graphviz がインストールされていないことになっています.

インストールを行おうとしても solving package specifications の文字が出てきたまま動くことがありません.

補足情報(FW/ツールのバージョンなど)

使用PC: M1 macbook air 

anaconda version:4.10.1

  • 気になる質問をクリップする

    クリップした質問は、後からいつでもマイページで確認できます。

    またクリップした質問に回答があった際、通知やメールを受け取ることができます。

    クリップを取り消します

  • 良い質問の評価を上げる

    以下のような質問は評価を上げましょう

    • 質問内容が明確
    • 自分も答えを知りたい
    • 質問者以外のユーザにも役立つ

    評価が高い質問は、TOPページの「注目」タブのフィードに表示されやすくなります。

    質問の評価を上げたことを取り消します

  • 評価を下げられる数の上限に達しました

    評価を下げることができません

    • 1日5回まで評価を下げられます
    • 1日に1ユーザに対して2回まで評価を下げられます

    質問の評価を下げる

    teratailでは下記のような質問を「具体的に困っていることがない質問」、「サイトポリシーに違反する質問」と定義し、推奨していません。

    • プログラミングに関係のない質問
    • やってほしいことだけを記載した丸投げの質問
    • 問題・課題が含まれていない質問
    • 意図的に内容が抹消された質問
    • 過去に投稿した質問と同じ内容の質問
    • 広告と受け取られるような投稿

    評価が下がると、TOPページの「アクティブ」「注目」タブのフィードに表示されにくくなります。

    質問の評価を下げたことを取り消します

    この機能は開放されていません

    評価を下げる条件を満たしてません

    評価を下げる理由を選択してください

    詳細な説明はこちら

    上記に当てはまらず、質問内容が明確になっていない質問には「情報の追加・修正依頼」機能からコメントをしてください。

    質問の評価を下げる機能の利用条件

    この機能を利用するためには、以下の事項を行う必要があります。

質問への追記・修正、ベストアンサー選択の依頼

  • jbpb0

    2021/06/11 12:12 編集

    > terminalからjupyter notebook を立ち上げていたのを,
    anacanda navigator から立ち上げた結果,graphvizが認識され実行ができるようになりました.

    > anaconda navigatorから立ち上げるのとは別の場所にjupyterがインストールされてしまっていたのではないかと思っています.

    ターミナルで
    which jupyter
    を実行したら、
    /Users/.../opt/anaconda3/...
    以外のどこかにあるのが出てくるなら、そうなのかもしれません

    ただし、pprint.pprint(sys.path)の結果を見ると、jupyterから使われてるのはAnacondaのPython 3.8のようなんです
    それなのに、なんでcondaで入れたのが見つからないのか、不思議です

    キャンセル

  • jbpb0

    2021/06/11 12:18

    もしかしたら、pprint.pprint(sys.path)を実行したのは、ターミナルから起動したjupyterではなく、anacanda navigatorから起動したjupyterでしょうか?
    それならば、pprint.pprint(sys.path)の結果はつじつまが合います

    キャンセル

  • iu_kt

    2021/06/11 12:38

    which jupyter
    /Users/.../opt/anaconda3/bin/jupyter

    となったのでターミナルから使っているjupyterも同じぽいですね・・・

    今あらためてターミナルからとnavigatorからそれぞれjupyterを立ち上げてpprintを実行したのですがそれも結果は同じでした.

    また,ターミナルから立ち上げたjupyterでもgraphvizを使うことができました...

    なぜ昨日できなかったのかはよくわかりませんが,ひとまずターミナルから使っているjupyterとnavigatorから立ち上げたjupyterは同じもののようです.

    ただnavigator上のenvironmentsでは相変わらずpython-graphvizがnot-install欄にあることだけが謎ですね・・・

    この度は大変お手数をおかけし,申し訳ございませんでした.ご回答ありがとうございました!

    キャンセル

回答 3

check解決した方法

0

皆様たくさんのご回答ありがとうございました.

一晩開け,今までterminalからjupyter notebook を立ち上げていたのを,

anacanda navigator から立ち上げた結果,graphvizが認識され実行ができるようになりました.

まだ詳細はわかっていないのですが,anaconda navigatorから立ち上げるのとは別の場所にjupyterがインストールされてしまっていたのではないかと思っています.

改めて自分の環境を見直し,整理したいと思います.

自己解決となってしまい申し訳ございません.

ご回答くださった皆様,ありがとうございました.

投稿

  • 回答の評価を上げる

    以下のような回答は評価を上げましょう

    • 正しい回答
    • わかりやすい回答
    • ためになる回答

    評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。

  • 回答の評価を下げる

    下記のような回答は推奨されていません。

    • 間違っている回答
    • 質問の回答になっていない投稿
    • スパムや攻撃的な表現を用いた投稿

    評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

0

Jupyterのpythonとコマンドラインのpythonが同じでない可能性が高いです。

Jupyterで

import sys
print(sys.executable)


を実行してください。

これで表示されるpythonのフルパスを指定して

$ /aaa/bbb/ccc/python3 -m conda install python-graphviz

とかをやってみてください。

投稿

  • 回答の評価を上げる

    以下のような回答は評価を上げましょう

    • 正しい回答
    • わかりやすい回答
    • ためになる回答

    評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。

  • 回答の評価を下げる

    下記のような回答は推奨されていません。

    • 間違っている回答
    • 質問の回答になっていない投稿
    • スパムや攻撃的な表現を用いた投稿

    評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

  • 2021/06/11 11:53

    ご回答ありがとうございます.

    ご回答頂いたよう試してみたのですが,solving package specifications がまたずっと続いてしまう形になってしまいました.すみません...

    キャンセル

0

jupyter上で%pip install graphvizをするか、anaconda navigatorから対象の環境に対してgraphvizをインストールしましょう

投稿

  • 回答の評価を上げる

    以下のような回答は評価を上げましょう

    • 正しい回答
    • わかりやすい回答
    • ためになる回答

    評価が高い回答ほどページの上位に表示されます。

  • 回答の評価を下げる

    下記のような回答は推奨されていません。

    • 間違っている回答
    • 質問の回答になっていない投稿
    • スパムや攻撃的な表現を用いた投稿

    評価を下げる際はその理由を明確に伝え、適切な回答に修正してもらいましょう。

  • 2021/06/11 11:51

    ご回答ありがとうございます.

    記述し忘れてしまったのですがpipでのインストールもすでに試したんですよね・・・

    環境については特に仮想環境は作っておらずanaconda navigator のbase(root)の欄を見ていましたが

    仮想環境を作ったほうがよかったのでしょうか.

    キャンセル

  • 2021/06/11 11:57

    「jupyter上で」ですけど、やりました?

    キャンセル

  • 2021/06/11 11:58

    base自体も仮想環境なので、作る作らないは気にしないで良いです

    キャンセル

  • 2021/06/11 12:02

    jupyter上では試していませんでした,読み違えてしまい申し訳ありません.

    今後同じような問題が発生したとき,jupyter上でのpipも試してみたいと想います.

    ご回答ありがとうございました.

    キャンセル

15分調べてもわからないことは、teratailで質問しよう!

  • ただいまの回答率 87.95%
  • 質問をまとめることで、思考を整理して素早く解決
  • テンプレート機能で、簡単に質問をまとめられる

関連した質問

同じタグがついた質問を見る