ファイルの出力で改行やタブが消えてしまう

Question

下記のようなファイルがあります。headコマンドで見たときです。

2020/6/30	2020/6/18 7:03	2020/6/23 4:53
2020/6/29	2020/6/23 1:40	2020/6/23 4:52
2020/2/24	2020/5/20 3:50	2020/6/18 1:18
2019/6/25	2020/5/20 3:49	2020/6/17 5:56
2019/6/25	2020/5/20 3:49	2020/6/17 5:55
2019/4/14	2020/5/20 3:49	2020/6/17 5:49
2019/4/13	2020/5/20 3:49	2020/6/17 5:44
2019/5/29	2020/5/20 3:49	2020/6/17 5:42
2019/6/5	2020/5/20 3:49	2020/6/17 5:42

このファイルなんですが、数十億行あり、巨大であり、一部（10000行ぐらい）だけ出力しようとして

echo `head gene_data.txt -n 10000` > ~/tmp/gene_data.txt

とやったんですが、出力結果がCSVではなく、スペースも複数並んでいるのが1つになったり、改行コードも消えてしまったりします。

2020/6/30 2020/6/18 7:03 2020/6/23 4:53 2020/6/29 2020/6/23 1:40 2020/6/23 4:52 2020/2/24 2020/5/20 3:50 2020/6/18 1:18 2019/6/25 2020/5/20 3:49 2020/6/17 5:56 2019/6/25 2020/5/20 3:49 2020/6/17 5:55 2019/4/14 2020/5/20 3:49 2020/6/17 5:49 2019/4/13 2020/5/20 3:49 2020/6/17 5:44 2019/5/29 2020/5/20 3:49 2020/6/17 5:42 2019/6/5 2020/5/20 3:49 2020/6/17 5:42 

なぜこのように成るのか分かりませんが、色々と調べてみても、「ファイルの一部の行を抽出し画面に表示する」という機能はあっても、「ファイルの一部の行を抽出し、改行およびtabを維持して別のファイルとして出力する」という機能が見つかりません。

マイナーな方法なのかどうか知りませんが、ご存知の方がおられましたら方法を教えていただけますと幸いです。

Answer 1

コマンド置換した結果をechoで表示し、それをリダイレクトする意図が不明です。タブや改行をすべて空白にしたいなら話は別ですが、質問を読むとそうではないようですし。

headコマンドの出力を直接リダイレクトして、

head gene_data.txt -n 10000 > ~/tmp/gene_data.txt

とすれば済む話では。

Comments

[tiqua_nibio]

ありがとうございます。
echoの使い方一つをとっても、ルールを知らずにやるとハマってしまいますね…

Answer 2

echoは、引き数を空白1つを区切りとして出力するコマンドです。

例：

echo A                  B
出力： A B

単に、head gene_data.txt -n 10000 > ~/tmp/gene_data.txtでいいかと。

他に理由が有り、echoでやりたい場合は、区切り文字を保存するよう引用符で囲みます。
例：

echo "A                  B"
出力：A                  B

echo "`head gene_data.txt -n 10000`" > ~/tmp/gene_data.txt

Comments

[tiqua_nibio]

複数の引数を空白1個で区切って出力するというのは知りませんでした。色々と説明いただき、恐縮です。