GitHubでマージ済みのファイルが差分として表示される

Question

Git&Github初心者なのですが、マージの挙動がイマイチ分かっていません。
Squashを使って以下のようなことをしたのですが、キレイにマージできません。

やったこと

1. テストレポジトリを作成
2. mainブランチからdevelopブランチを作成
3. developブランチからfixブランチを作成
4. fixブランチに対して2回コミット(fix1, fix2)
5. Github上でfixブランチをdevelopブランチにマージ
6. Github上でdevelopブランチをmainブランチにマージ(Squashして1コミットに集約)

satken2/test - Github

この状態で、main→developのプルリクエスト、develop→mainのプルリクエストを作成しました(未マージ)
Pull request #3
Pull request #4

起こる事象

この状態では、mainとdevelppはマージ済みなので同じだと思っていたのですが、プルリクエストでは差分が発生しています。
Pull request #3

Squashしたのでコミットに差分が出そうなのは何となくわかるのですが、なぜファイルの中身にも差分が出ているのでしょうか。。
そして、このような現象を発生させずにきれいにマージするにはどうしたらいいのでしょうか。

また、develop→mainのプルリクエストも差分が発生しています
すでにマージしたんじゃなかったっけ、、？

Pull request #4

図示

Githubは課金しておらずグラフ表示できないので、GitLabにインポートしてグラフ表示しました。
merge Develop (#2)というのがSquashしたdevelopからmainへのマージですが、これがマージではなくmainへの直接コミット(?)のようになっています。

Answer 1

こんにちは。

ちょうど同事象の質問があったので、GitHub の差分表示についてはこちらに書いた回答を読んでいただければ。
https://teratail.com/questions/304415

merge Develop (#2) が main への直接コミットとなっているのは、あなたが squash マージをしたからです。
squash はその名の通りマージ対象ブランチの差分を一コミットに詰め込んで先頭に積む操作なので、まさに見た目の通りの状態になります。